Locus and gene search in three disorders
Üç hastalıkta lokus ve gen aranması
- Tez No: 255863
- Danışmanlar: PROF. DR. ASLIHAN TOLUN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 100
Özet
Genetik hastalıklardan sorumlu genlerin bulunması, genlerin katıldıkları hücre mekanizmalarının ve moleküler yolaçların bulunmasında, hastalıkların tanı ve sağaltımı için gerekli yeni tekniklerinin geliştirilmesinde önemli rol oynar. Bu çalışma kapsamında, otozomal çekinik geçişli üç kalıtımsal hastalıkta genetik bağlantı analizi kullanılarak hastalıklardan sorumlu genleri içeren bölgeler aranmış, hastalıkların ikisinde anlamlı bölgeler ayrıntılı olarak haritalanarak aday genler incelenmiştir. Çalışılan hastalıklar azospermi, tip 1 diyabet ve mikrohidranensefalidir.Azospermi semende saptanabilir seviyede spermatozoa bulunmaması durumudur. Çalışmada üç hasta bireyli ve sık akraba evliliği bulunan bir ailede hastalık kromozom 17p13.2-p13.1 ve 14q11.2-q12'e haritalandı. Sonra da hastalık geninin `sperm associated antigen 7' üreten SPAG7 geni olduğu gösterildi. Mutasyon (R136W) memelilerde on iki amino asitlik korunmuş bir bölge içerisinde yer almaktadır. Mikrohidranensefali mikrosefali ve hidranensefalin birlikte gözlemlendiği nadir bir gelişimsel anomalidir. İki hasta kardeşli bir ailenin genom taraması bulguları ile yapılan genetik bağlantı analizi ve ardından mikrosatelit belirteçleriyle yapılan doğrulama sonucunda hastalıkla ilişkilendirilen birden çok bölge ortaya çıkarıldı. En kuvvetli aday bölge olan 6p25.3-p25.2'de beş aday gen incelendi.Tip 1 diyabet karmaşık geçişli bir hastalıktır. Akraba evliliği yapmış bir ailede onüc kardeşten dördünde hastalığın gözlenmesi otozomal çekinik kalıtıma işaret etmiştir. Mikrosatelit ve SNP belirteçleri ile yapılan genom taramaları sonucunda hastalık 8q24.23 bölgesine haritalandırıldı. Bölgede FAM135B bulunmaktadır.
Özet (Çeviri)
Identification of genetic defects associated with hereditary diseases is important in understanding cellular mechanisms and molecular etiology of diseases, developing diagnostic tests and novel therapeutic techniques. In this study, genetic analysis was performed to map genetic loci and identify the responsible gene in three families afflicted with different autosomal recessive hereditary diseases: azoospermia, diabetes mellitus type 1, microhydranencephaly. Gene localizations involved genome scan followed by fine mapping. Localization studies were completed for all diseases, while candidate gene approach led to the identification of the gene responsible for one of them.Azoospermia is absence of detectable level of spermatozoa in the semen. In a consanguinous family with three affected sibs, the condition was mapped to 17pter-13.1 and 14q11.2-12. Seven candidate genes were analyzed, and the disease gene was identified as SPAG7, a homolog of fox sperm acrosomal protein. The mutation R136W resided in a 13 amino acid-cluster conserved in all mammals.Microhydranencephaly is a rare developmental defect of the brain, where the unusual association of microcephaly and hydranencephaly is observed. In a nuclear family with two affected sibs, genetic linkage analysis and haplotype construction followed by verification with microsatellite markers led to the identification of several candidate loci, with the strongest one at 6p25.3-p25.2. Five candidate genes were analyzed but no mutation was found.Diabetes Mellitus Type 1 exhibits complex inheritance. A consanguineous family having four of thirteen sibs affected suggested autosomal recessive inheritance. The strongest candidate locus identified by using genome scan data was 8q24.23. The locus harbors gene FAM135B.
Benzer Tezler
- Genetic analysis in three inherited disorders
Üç kalıtsal hastalıkta genetik analiz
TARIK BOZOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASLIHAN TOLUN
- Disease gene search via linkage mapping and exome sequencing
Bağlantı haritalaması ve eksom dizileme ile hastalık geni arama
ÇİĞDEM KÖROĞLU ALTOK
Doktora
İngilizce
2014
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASLIHAN TOLUN
DOÇ. DR. SERVER HANDE ÇAĞLAYAN
- Disease gene identification via linkage analysis and exome sequencing
Bağlantı analizi ve eksom dizileme yöntemleriyle hastalık genlerinin bulunması
AYŞE GÜVEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASLIHAN TOLUN
- Charcot-Marie-Tooth disease: A molecular genetic approach
Charcot-Marie-Tooth hastalığı: Moleküler genetik bir yaklaşım
NİSRİNE BİSSAR TADMOURİ
Doktora
İngilizce
2003
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ESRA BATTALOĞLU
- Düşük proteinli süt-bazlı fermente bir ürün geliştirilmesi
Development of milk-based fermented product with low protein content
SİNEM BETÜL CANİKLİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MERAL KILIÇ AKYILMAZ