Benzodiazepin GABAA reseptöründe flavonoid bağlanmalarının MCET metoduyla 4D-QSAR incelenmesi
4D-QSAR study of flavonoid binding at the benzodiazepine GABAA receptor site using MCET method
- Tez No: 346238
- Danışmanlar: PROF. DR. YAHYA GÜZEL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: İlaç tasarımı, 4D-QSAR, Flavonoid, Pharmacophore, APS MCET, GABAA, BZR, Drug Design, 4D-QSAR, Flavanoid, Pharmacophore, APS, MCET, GABAA, BZR
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 107
Özet
Bu çalışmada Moleküler Konformer Elektron Topolojik (MCET) metod kullanılarak Gamma Amino Bütirik Asit - Benzodiazepin Reseptör (GABAA-BZR) bağlanmalarını aktifleştiren flavonoid türevinden oluşan 42 bileşik seri için Dört Boyutlu Kantitatif Yapı İlişkisi? (4D-QSAR) analiz edilmiştir. Bu çalışmanın amacı biyolojik aktiviteyi tahmin etmek ve farmakofor (Pha), aktiviteyi artırıcı grup (AG) ve azaltıcı gruptan (APS) oluşan biyoyapıyı ortaya çıkarmaktır. Bu metot yalnızca flavonoid biyolojik etkileşmesinin modelinin anlaşılmasına değil aynı zamanda onların aktivitelerinin tahmin edilmesine önemli avantaj sağlar. Bütün çiftler arasındaki benzerlik bileşik konformerlerinin matrislerinin çakıştırılmasıyla bulunmuştur ve özel atomik grup olan Pha, (C7, C8, O1 ve O2) bir geometrik düzenleme içinde belirlenmiştir. Tam olarak birbiri üstünde çakıştırıldıktan sonra belirlenmiş Pha, nicel bir formül içinde kullanılan ve inceleme altındaki bileşikler için C13, C11, N1, F1 ve C18den oluşan AG ve APSli kimyasal fonksiyonların bir geometrik düzenleyicisidir. 4D-QSAR için model içerisinde farmokofor ve fonksiyonel grupların kullanılmasıyla, eğitim ve test seti için aktivite hesaplamalarının tatmin edici düzeyde (sırasıyla, q2= 0.806 ve R2=0.761) olduğu görülmüştür.
Özet (Çeviri)
In this study, four dimensional quantitative structure activity relationship for 42 compound serials which consist of flavonoid derivative activating gamma amino butyric acid benzodiazepine receptor (GABAA-BZR) binding is analyzed by using Molecular Comparative Electron topological (MCET) Method. The aim of the study is to estimate the biological activity and bring out the bio-structure which consists of pharmacophore), the auxiliary groups (AG) and anti-pharmacophere shielding (APS) groups. This method provides the advantages not only to understand the flavonoid biological interaction model but also to estimate their activities. The similarity among all pairs is found by matching the matrices of the compound conformers, and Pha, specific atomic group (C7, C8, O1 and O2) is identified in a geometrical arrangement. After being superimposed precisely one on the top of the other, the given Pha is a geometric regulation of chemical functions of AG and APS, used in a quantitative formula and consisting of C13, C11, N1, F1 and C18 for compounds under investigation. Using pharmacophore and functional groups in the model for 4D-QSAR; it is seen that activity calculations for training and test sets are at satisfactory quality (respectively, q2=0.806 and R2=0.761).
Benzer Tezler
- Computational de-novo peptide design to be used in binding gabaa receptor in epilepsy disease
Epilepsi hastalığında gabaa reseptörünün bağlanmasında kullanılacak hesaplamalı de-novo peptit tasarımı
ESMA NUR YAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Biyofizikİstanbul Medipol ÜniversitesiBiyomedikal Mühendisliği ve Biyoenformatik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEFER BADAY
- Atipik gabaa/benzodiazepin reseptör agonisti zopiklonun deneysel olarak oluşturulan şizofreni benzeri modeller
The effect of atypical gabaa/benzodiazepine receptor agonist zopiclone on experimentally induced schizo-phrenia-like models
ZEYNEP GÜL YAZICI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Eczacılık ve FarmakolojiEskişehir Osmangazi ÜniversitesiTıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA SULTAN KILIÇ
- Deneysel status epileptikusta ketamin ve propofolün etkileşimi
Interaction of ketamine and propofol in experimental status epilepticus
GAYE BOZTEPE YILMAZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Anestezi ve ReanimasyonSağlık Bilimleri ÜniversitesiAnesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMAL TOLGA SARAÇOĞLU
- Diazepamın beyin sapı işitsel uyarılmış potansiyelleri üzerine olan etkisi
Başlık çevirisi yok
ÖMER BARLAS ERGİN
- Hypericum origanifolium Willd. hidroalkolik ekstresinin farelerin santral sinir sistemi üzerine etkilerinin araştırılması
Investigating the effects of Hypericum origanifolium Willd. hydroalcoholic extract on central nervous system of mice
ŞAHİN NURİ YAŞAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Eczacılık ve FarmakolojiAnadolu ÜniversitesiFarmakoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ÖZGÜR DEVRİM CAN