Mide kanserınde GKN1 ve GKN2 genleri tanıya uygun belirteç midir? Moleküler yöntemlerle araştırılması
Are GKN1 and GKN2 genes distinctive diagnostic markers for gastric cancer? A molecular investigation
- Tez No: 347732
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MEHRİ İĞCİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Onkoloji, Genetics, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Mide kanseri, GKN1, GKN2, gen ifade analizi, mutasyon taraması, Biyobelirteçler-tümör, Gen ifadesi, Mide neoplazmları, Mutasyon, Neoplazmlar, Gastric cancer, GKN1, GKN2, expression analysis, mutation screening, Biomarkers-tumor, Gene expression, Stomach neoplasms, Mutation, Neoplasms
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Mide kanseri birçok ülkede yüksek görülme ve ölüm oranına sahiptir. Intestinal tümörlerin evrimi gastrit ile başlayan ve ardından mukozal atrofi, intestinal metaplazi, displazi ve karsinom ve metastatik yayılma ile karakterizedir. Yeni tanımlanmış mitojenik Gastrokin 1 (GKN1) ve Gastrokin 2 (GKN2) genleri normal midede yüksek bir şekilde ifade edilmektedir ve yüzeyel mide epitelinde bulunurlar. GKN1 mide mukozal epitel hücrelerinin homeostazının sağlanmasında önemli bir rol oynar. GKN1 ve GKN2'nin kopya sayısındaki belirgin kayıp ve gen ifadesindeki azalma mide adenom karsinomlarda sık sık gözlenmiştir. Bu çalışmada kanser alttürüne, cinsiyet, yaş klinik özelliklerine göre gruplandırılmış 47 mide kanseri hastasının normal ve tümör dokusu gen ifade analizi, SSCP tekniği ve Sanger dizilemesi ile incelenmiştir. Hem GKN1 hem de GKN2 gen ifadelerinin azaldığı gözlenmiştir ve istatistiki olarak yüksek oranda anlamlı bulunmuştur (Wilcoxon signed rank testi; p < 0,05). Gen taramasının sonucunda mutasyon görülmemiştir. Gastrokin genlerinin etkinliğini yitirmesinde mutasyonların rol sahibi olmadığı anlaşılmaktadır. Sonuç olarak; Gastrokin genlerinin mRNA ifadesindeki azalma mide kanseri ile doğrudan ilişkili ve cinsiyet, yaş ve kanser alttipinden bağımsızdır. GKN genlerinin aşağı yönlü düzenlenmesi kanserin ilk aşamalarında gerçekleşiyor olabilir. Bu ön bulguların epigenetik analiz, miRNA analizi, western blot ve immünohistokimya gibi ileri tekniklerle doğrulanması gerekmektedir.
Özet (Çeviri)
Gastric cancer (GC) has high incidence and mortality rate in several countries and is still one of the most frequent and lethal diseases. The evolution of intestinal tumors is characterized by progression of several sequential steps that start with gastritis and then progresses to mucosal atrophy, intestinal metaplasia, dysplasia and carcinoma with subsequent metastatic dissemination. Novel mitogenic and motogenic Gastrokine1 (GKN1) and Gastrokine 2 (GKN2) genes that are highly expressed in normal stomach epithelium and plays an important role in maintaining the integrity and homeostasis of stomch mucosal epithelial cells. Significant loss of copy number and mRNA transcript of GKN1 and GKN2 gene expression were frequently observed in all type of gastric cancer. In this study, 47 paired samples that were grouped according to the types of gastric cancer and the clinical characteristics of the patients, including gender and average of age were investigated with gene expression analysis, SSCP technique and nucleotide sequencing. Both GKN1 and GKN2 genes were observed significantly reduced. (Wilcoxon signed rank test; p<0,05). As a result of gene screening; no mutation (no different genotype) was detected. It is considered that gen mutations are not the cause of inactivation of gastrokines. In conclusion; the mRNA expression level of gastrokine genes was decreased regardless the gender, age or cancer type of patients. Down-regulation of GKN genes seems to occur at the initial steps of cancer development. This preliminary data must be confirmed by further analysis like immunohistochemistry, epigenetic analysis, miRNA analysis, and western blot.
Benzer Tezler
- Bromtimol mavisi, bromkresol moru ve klorfenol kırmızısı indikatörleri katılmış özel besiyerlerinin sütlerde antibiyotik belirtilmesine uygunluğu üzerine araştırmalar
Başlık çevirisi yok
ESENGÜL TUNCER
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiSüt Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN YAYGIN
- Bir pamuk iplikhanesinde fiili çalışma metodlarının incelenmesi ve mevcut işlemlerin standart sürelerinin saptanması
Başlık çevirisi yok
MÜRŞİDE KESEROĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
İşletmeEge ÜniversitesiTekstil Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA NAZMİ ERCAN
- Kurbağa gastrik mukozasında K-H ATPaz enziminin kinetik özellikleri ve oluşturulan ülser modelinde enzim aktivitesi
Başlık çevirisi yok
SEYHAN TÜKEL
- Nar konsantresinin dondurularak ve kimyasal yöntemlerle saklanması sırasında meydana gelen değişmeler üzerine bir araştırma
Başlık çevirisi yok
İLHAN BODUR
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiTarım Ürünleri Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YURDAGEL ÜNAL
- Kalkınmada öncelikli yörelerde görev yapan vali-kaymakam il ve ilçe Milli Eğitim Gençlik ve Spor Müdürlerinin ilköğretim yönetiminde karşılaştıkları güçlükler
Başlık çevirisi yok
MUSTAFA YALÇINKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
Eğitim ve ÖğretimGazi ÜniversitesiEğitim Yönetimi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞEGÜL ATAMAN