Böbrek kanserinde VHL, PBRM1 VE SETD2 genleri tanıya uygun belirteçmidir? moleküler yöntemlerle araştırılması
Are VHL, PBRM1 and SETD2 genes distinctive diagnostic markers for kidney cancer? a molecular investigation
- Tez No: 347738
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. MEHRİ İĞCİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Onkoloji, Genetics, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Böbrek kanseri, VHL, PBRM1, SETD2, Gen ifadesi analizleri, Mutasyon taraması, Kidney cancer, VHL, PBRM1, SETD2, Expression analysis, Mutation screening
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 83
Özet
Böbrek kanseri ürolojik kanserlerin en ölümcül olanıdır ve yetişkin malignitelerin % 3? ünü oluşturur. Böbrek kanseri tek bir hastalık olmakla birlikte renal hücreli tümörler dahil olmak üzere farklı birçok türü bulunmaktadır. VHL geni RCC ile ilişkisi olduğu bilinen tümör baskılayıcı bir gendir. VHL, hipoksi indüklenebilir faktörlerin bir negatif düzenleyicisi olarak fonksiyon gösterir. Son zamanlarda yapılan dizi analizi çalışmalarında, ccRCC?de histon modifikasyonunda ve kromatin şekillenmesinde görev alan PBRM1 ve SETD2 gibi genlerde birçok yeni ve sık görülen mutasyonlar tanımlanmıştır. PBRM1 geni, tümör baskılayıcı olan VHL geninden sonra en çok mutasyon görülen ikinci gendir. Bu gen, belirli genlerin trankripsiyonel aktivasyonununda ve baskılanmasında görev alan BAF180 proteinini kodlamaktadır. SETD2 geni, histon H3?ün 36. pozisyondaki lizin amino asitinin trimetilasyonundan sorumlu bir histon metiltransferazı kodlamaktadır. Aynı zamnda tümör gelişiminde baskılayıcı bir rol alabilir. Bu çalışmada, böbrek kanseri çeşidine ve hastaların cinsiyet, ortalama yaş gibi klinik özelliklerine göre gruplanan 30 çift örnek, gen ifadesi, SSCP ve Sanger dizileme teknikleri ile analiz edilmiştir. VHL, PBRM1, SETD2 genlerinin aşağı yönlü düzenlendiği bulunmuştur. Ancak, Wilcoxon testi ile yapılan istatistiksel analizlerde anlamlı bir sonuca varılamamaıştır (p>0,05). Yapılan mutasyon taraması sonuçlarına göre farklı bir genotip saptanamamıştır. Sonuç olarak, taranan üç genin mRNA seviyesinde düşüş görülmüştür. RCC?nin patogenezinde görev alan moleküler mekanizmaların anlaşılması, böbrek kanseri moleküler hedefli ilaçların geliştirilmesi adına önem arz etmektedir.
Özet (Çeviri)
Kidney cancer is the most lethal urological cancer and accounts for 3% of adult malignancies. Kidney cancer is not a single disease; it is made up of a number of different types including renal cell tumours as the most common type. VHL gene is a tumor suppressor, it is best known with RCC. The VHL functions as negative regulator of hypoxia inducible factors. Recent sequencing efforts have identified several novel frequent mutations of histone modifying and chromatin remodeling genes in ccRCC including PBRM1 and SETD2. The PBRM1 gene is the second most common mutated gene after VHL, a tumor suppressor gene. It encodes the BAF180 protein, which involved in transcriptional activation and repression of selected genes.SETD2 encodes a histone methyltransferase, which is responsible for trimethylation of the lysine residue at position 36 of histone H3 and may play a role in suppressing tumor development. In this study, 30 paired tumor and normal samples that were grouped according to the types of kidney cancer and clinical characteristics of patients, including gender and average age were observed with gene expression analysis, SSCP and sequencing technique. Three of genes VHL, PBRM1 and SETD2 were relatively downregulated. However, statistically no significance found by Wilcoxon signed rank test (p>0,05). As a result of gene screening no mutation (no different genotype) was observed. In conclusion, the mRNA expression levels of three genes were insignificantly downregulated. Understanding the molecular mechanisms involved in the pathogenesis of RCC has aided the development of molecular-targeted drugs for kidney cancer.
Benzer Tezler
- Sunitinib dirençli böbrek kanseri hücre serilerinde, direnç yanıtında etkili gen ekspresyonlarının, süksinik asit tedavisi sonrası karşılaştırılması
Comparison of gene expressions in the resistance response in sunitinib-resistant renal cancer cell lines following succinic acid treatment
BARIŞ ERTUĞRUL
Doktora
Türkçe
2023
Moleküler Tıpİstanbul ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BEDİA ÇAKMAKOĞLU
DOÇ. DR. ELİF SİNEM BİRELLER
- Determination of actr2 gene expression in kidney cancer
Böbrek kanserinde actr2 gen ekspresyonunun belirlenmesi
MILAT HUSSEIN MUSTAFA MUSTAFA
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
GenetikTokat Gaziosmanpaşa ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HACI ÖMER ATEŞ
- Determınatıon of ARPC1A gene expressıon ın kıdney cancer
Böbrek kanserinde ARPC1A gen ekspresyonunun belirlenmesi
LAZGIN KAREEM HUSSEIN HUSSEIN
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Tıbbi BiyolojiTokat Gaziosmanpaşa ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HACI ÖMER ATEŞ
- Böbrek kanserinde önemli proteinler ile kuersetin etkileşiminin moleküler kenetlenme ile araştırılması
Investigation of quercetin interaction with important proteins in kidney cancer by molecular docking
MELTEM BOZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CEM BÜLENT ÜSTÜNDAĞ
- Analysis of the level of WAVE11 gene expression inkidney cancer
Böbrek kanserinde WAVE11 gen ekspresyon düzeyinin analizi
RENAS NAJIB MOHAMMED MOHAMMED
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Tıbbi BiyolojiTokat Gaziosmanpaşa ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HACI ÖMER ATEŞ