Samsun ilinde yetiştirilen bazı kültür bitkilerinden elde edilen rhizoctonia izolatlarının geleneksel ve moleküler yöntemler ile karakterizasyonu
Traditional and molecular characterization of rhizoctonia isolates obtained from some cultivated plants grown in samsun province
- Tez No: 354474
- Danışmanlar: PROF. DR. İBRAHİM ÖZKOÇ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Rhizoctonia spp, rDNA-ITS, 18S filogeni, anastomoz grupları, Rhizoctonia spp, rDNA-ITS, 18S phylogeny, anastomosis groups
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 192
Özet
Bu araştırmada Samsun iline bağlı 15 ilçede yetiştirilen biber, domates, patates, patlıcan (Solanaceae), lahana (Brassicaceae) ve fiğ (Fabaceae) bitkilerinden elde edilen 70 Rhizoctonia izolatının geleneksel yöntemler ile gruplandırılması yapılmıştır. Elde edilen fungal izolatların Rhizoctonia solani AG 4, AG 7, Rhizoctonia zeae, BN Rhizoctonia AG-A, AG-F, AG-K, AG-S gruplarına ait oldukları tespit edilmiştir. Bu çalışmada elde edilen Rhizoctonia AG-A, AG-F, AG-K ve R. zeae izolatları fiğden elde edilmiştir. Ayrıca, Rhizoctonia AG-S izolatı patlıcandan, AG 7 izolatları ise patates bitkisinden elde edilmiştir. Ayrıca, hifal anastomoz reaksiyonlarına dayalı olarak gruplandırılan izolatları temsilen seçilen 20 izolatın ITS1-5.8S-ITS2 rDNA bölgesi dizi analizleri gerçekleştirilmiş ve izolatlar arasında ve alt gruplar içindeki genetik varyasyon belirlenmiştir. Üç farklı algoritma kullanılarak oluşturulan filogenetik analiz sonuçlarına göre R. solani AG 4 izolatları arasında HGI alt grubunun daha fazla çeşitlilik gösterdiği saptanmıştır. R. zeae izolatlarının kendi içinde iki alt dala ayrıldıkları tespit edilmiştir. BN Rhizoctonia AG-A izolatlarının ise iki soy hattına ayrıldığı belirlenmiştir. İzolatlar arasındaki genetik farklılığı belirlemek amacıyla ITS1-5.8S-ITS2 gen bölgesiyle yapılan değerlendirme sonucunda her anastomoz grubunu temsilen 9 izolat seçilmiştir Bu izolatların 18S rDNA bölgesine ait sekans verileri ve filogenetik analizlerine göre izolatların ayrımı tam olarak yapılamamıştır.
Özet (Çeviri)
In this study, 70 isolates of Rhizoctonia spp., which were obtained from pepper, tomato, potato, eggplant (Solanaceae), cabbage (Brassicaceae) and vetch (Fabaceae) plants grown in 15 districts of Samsun province, were grouped by the traditional methods. These fungal isolates were determined as belonging to the Rhizoctonia solani AG 4, AG 7, Rhizoctonia zeae, BN Rhizoctonia AG-A, AG-F, AG-K, AG-S according to anastomosis group reactions. Rhizoctonia AG-A, AG-F, AG-K and R.zeae isolates were recovered from vetch plant in this study. In addition, Rhizoctonia AG-S group and R. solani AG 7 isolates were isolated from eggplant and potato, respectively. Sequence of ITS1-5.8S-ITS2 rDNA regions were analyzed for the selected 20 isolates representing the isolates which were grouped on the basis of hyphal anastomosis reactions, and the genetic variations within sub-groups and among isolates were determined according to nucleotide sequence analyses. When considered variations in the trees of AG 4 isolates formed by using three different algorithms, sub-group HGI was found to be more variable than the other sub-groups. It was shown that both R. zeae and BN Rhizoctonia AG-A isolates were split into two sub-branches among themselves. In order to determine the genetic differences between isolates, nine isolates representing each anastomosis group were selected using ITS1-5.8S-ITS2 gene region data. From the trees generated using 18S rDNA sequence analysis, these isolates could not be differentiated exactly.
Benzer Tezler
- Samsun ilinde önemli bazı kültür bitkilerinde bulunan pythium türlerinin tesbiti ve patojeniteleri üzerinde araştırmalar
Identification and pathogenicity of pythium species associated with some important crops in Samsun
GÜRSEL HATAT
- Vicia grubu baklagillerde rhizobiyal simbiyont seçiciliğinin moleküler yöntemlerle araştırılması
Investigation of selectivity of rhizobial symbionts through molecular methods in legumes of Vicia group
EMİNE BANU AYDIN
- Resim iş öğretmenlerinin resim iş programlarına ilişkin görüşleri (Elazığ, Malatya ve Samsun örneği)
The ideas of art teachers on the programs of art lessons (Limited with Elazığ, Malatya and Samsun city centers)
AYHAN DİKİCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
1997
Eğitim ve ÖğretimFırat ÜniversitesiEğitim Bilimleri Ana Bilim Dalı
Y.DOÇ.DR. MEHMET GÜROL
- Samsun ilinde yetiştirilen tütün (Nicotiana tabacum L.) bitkisinden izole edilen rhizoctonia grubu fungusların karakterizasyonu
The characterisation of rhizoctonia group fungi isolated from tobacco plant (Nicotiana tabacum L.) cultivated in Samsun
CEM TOLGA GÜRKANLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
BiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM ÖZKOÇ
- Türkiye'de yetiştirilen bazı karakılçık buğday örneklerinin karakteristik özellikleri ve ekmek üretiminde kullanılması
The characteristic features of some local karakilçik wheat samples grown in Turkey and their usa in bread production
KÜBRANUR ÖZKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜLYA GÜL