Hepatosellüler karsinoma hücrelerinde lityumun genom düzeyine etkileri
Genome wide effects of lithium on hepatocellular carcinoma cells
- Tez No: 359765
- Danışmanlar: DOÇ. DR. Ş. ESRA ERDAL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 134
Özet
Hepatosellüler karsinoma (HCC) dünyada ölümle sonuçlanan kanser türleri arasında üçüncü sırada yer almaktadır. Yapılan çalışmalarda, hepatik kanser kök hücrelerin de (HpKKH) hepatokarsinogenezden sorumlu olabileceğini bildirilmiştir. Çalışmamızda lityumun HuH-7 hücrelerinde transkirptoma, biyolojik yanıtlara ve HpKKH'lere etkisi araştırıldı. HCC hücre hatlarında proliferasyon inhibisyonu yaratan lityum, HuH-7 hücrelerinde adezyonu azaltırken motilite ve invazyonu artırdı. Yapılan transkriptome analizlerinde, lityumun değiştirdiği genlerin büyük kısmının metabolizma ve hücre döngüsüyle ilişkili olduğu ortaya kondu. Aynı zamanda lityumun pluripotensi ile farklılaşma genleri üzerinde yarattığı etki ve yönlendirdiği biyolojik davranışlar, hücrelere daha az farklılaşmış daha pluripotent bir fenotip kazandırdığını gösterdi. Bunun yanında çalışmalarımızın sonunda, kolon kanser kök hücreleri markeri olarak bilinen LGR5'in, HCC'de bir Wnt/b-katenin hedef geni ve bir kanser kök hücre belirteci olduğu belirlendi. Yine çalışmalarımızda, EpCAM ve CD133 yüzey molekülleri kullanarak HuH-7 hücreleri içerisinden ayrımlanan hepatik kanser kök hücrelerde (HpKKH), OCT-4, KLF4, MYC ve SOX2 pluripotensi genlerinin daha yüksek düzeyde eksprese edildiğini gösterdi. Bununla birlikte, EpCAM+/CD133+ HpKKH'lerin, morfolojik ve davranışsal olarak lityuma maruz kalmış hücrelere benzediği ortaya kondu. Aynı zamanda bu hücrelerin EpCAM-/CD133- hücrelere göre daha az proliferatif, daha az adezif ve daha motil karakterde olduğu bulundu. Lityumun HpKKH'ler üzerinde etkisini araştırdığında, EpCAM-/CD133- hücrelerin proliferasyon ve adezyon davvranışları bakımından parental HuH-7 hücreleri gibi lityuma duyarlı olduğunu, buna karşın EpCAM+/CD133+ HpKKH'lerdeki adezyon, proliferasyon ve motilite gibi biyolojik davranışların lityuma yanıt olarak etkilenmediği görüldü. Tüm verilerimiz bir arada değerlendirildiğinde, Wnt/b-katenin yolağının HpKKH karakterini ve metabolizmasını yeniden programladığı ve geliştirilecek tedavi stratejilerinde hedef alınması gerektiği düşünülmektedir. Anahtar kelimeler; HCC, Lityum, HpKKH, Wnt/b-katenin sinyal yolağı
Özet (Çeviri)
Hepatocellular carcinoma (HCC) is the third most common cause of cancer mortality worldwide. Many studies have reported that hepatic stem cells are responsible for hepatocarcinogenesis. In this study, we did a thorough investigation to find out the genome wide and biological effects of lithium on HuH-7 cell line. Lithium caused proliferation inhibition on HCC cell lines, also reduced adhesion, increased motility and invasion in HuH-7 cells. The transcriptome analysis revealed the majority of lithium regulated genes related to metabolism and cell cycle. Importantly, effect of lithium on genes related to pluripotency and differentiation and the motility/invasion assays indicated that lithium treated cells gained a more pluripotent phenotype. We prove that LGR5 is a target gene of Wnt/b-catenin signalling in HCC which is known colon cancer stem cell marker. In addition, with using EpCAM and CD133 surface markers, we isolated HpCSC's from HuH-7 cell line and showed that this subpopulation have high pluripotency genes compared to the cells without these markers. Besides, we observed that EpCAM+/CD133+ cells were act similar to lithium treated cells. In this regard, EpCAM+/CD133+ cells were less proliferative and adhesive also more motile than EpCAM-/CD133- cells. We show that the EpCAM-/CD133- cells were sensitive to lithium similar to HuH-7 parental cells, whereas proliferation, motility and adhesion behavior of EpCAM+/CD133+ cells did not effected by lithium. Our study indicated that Wnt/b-catenin pathway effect metabolism and reprogrammed HpCSC?like properties and and it is of great importance that this is considered when developing new therapeutic strategies. Key Words; HCC, Lithium, HpCSC, Wnt/b-catenin signalling pathway
Benzer Tezler
- Elucidating the role of foxo transcription factors on lithium induced growth arrest in hepatocellular carcinoma cells
Foxo transkripsiyon fartörlerinin lityumun indüklediği karaciğer kanser hücrelerindeki bölünme durmasındaki rolünün saptanması
ESRA ŞEKERCİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NECLA BİRGÜL İYİSON
- Histon modifikasyonlarının hücre proliferasyonu üzerine etkileri
Effects of histone modifications on cell proliferation
SANEM TERCAN AVCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA ERDAL
- Hepatosellüler karsinoma hücre hatlarında mTOR (Mammalian target of rapamycin) gen ekspresyonunun plazmid bazlı mikrorna-7/kitozan kompleksleri ile baskılanmasına ilişkin in vitro çalışmalar
In vitro studies of mtor gene expression in plasma based microrna-7 / chitosan complexes in hepatocellular carcinoma cell lines
MELEK EVİRGEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyoteknolojiMarmara ÜniversitesiFarmasötik Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SUNA ÖZBAŞ TURAN
- Kinürenik asit ve kinaldik asit'in insan karaciğer kanseri (HepG2) hücre hattında in vitro antitümöral etkilerinin araştırılması
Investigation of the in vitro antitumoral effects of kynurenic acid and quinaldic acid in hepatocellular carcinoma (HepG2) cell li̇ne
PINAR ATALAY DÜNDAR
Doktora
Türkçe
2019
Tıbbi BiyolojiErciyes ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEFİSE NALAN İMAMOĞLU ŞİRVANLI
- Hepatosellüler karsinomada glukoz metabolizması ve c-met yolağının etkileşiminin irdelenmesi
Investigating the crosstalk of glucose metabolism and c-met pathway in hepatocellular carcinoma
YELİZ YILMAZ
Doktora
Türkçe
2020
Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SAFİYE NEŞE ATABEY
PROF. DR. SULTAN CİNGÖZ