Clostridium difficile toksini isteği ile gönderilen dışkı örneklerindeki vankomisin dirençli enterokok (VRE) kolonizasyonunun saptanması
Determining the vancomycin resistant enterococcus (VRE) colony from the faecal samples which have been sent to obtain the toxins of clostridium difficile.
- Tez No: 365439
- Danışmanlar: DOÇ. DR. DOÇ. DR. ZEYNEP ARZU İLKİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Clostridium difficile, enterokok, vankomisin direnci, kolonizasyon, Dışkı, Enterococcus, Toksinler, Vankomisin, İlaçlara direnç, İlaçlara direnç-mikrobiyal, Clostridium difficile, enterococcus, vancomycin resistance, colonization, Feces, Toxins, Vancomycin, Drug resistance, Drug resistance-microbial
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
C. difficile ve VRE uygunsuz antibiyotik kullanımıyla ilişkili en önemli nozokomiyal patojenlerdir. VRE kolonizasyonu özellikle hastanede yatan, immun yetmezlikli, kemoterapi alan hastalarda VRE enfeksiyonu oluşturma açısından önemli risk faktörüdür. Benzer risk faktörleri C. difficile için de önem taşımaktadır. Bu çalışmada, amaç hastanemiz mikrobiyoloji laboratuvarına rutin C. difficile toksini bakılması isteği ile gönderilen dışkılardaki VRE kolonizasyonunun belirlenmesidir. Gereç ve Yöntem: Toksin bakılması isteği ile gönderilen 158 dışkı örneğiyle çalışılmıştır. Çeşitli fenotipik ve biyokimyasal tanımlama işlemlerinden sonra 19 VRE izolatı saptanmıştır. Vankomisin ve teikoplanin minimum inhibitör konsantrasyonları (MİK) E-test ile belirlenmiş ve direnç genleri Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile araştırılmıştır. Bulgular: Toksin pozitif örneklerin (n:88) %17'sinde VRE pozitifliği saptanırken, toksin negatiflerde bu oran %5.7 olarak bulunmuştur. VRE'lerin tümü E.faecium olarak tanımlanmıştır. Toksin pozitifliğinin VRE kolonizasyonu açısından pozitif öngörü değeri (PÖD) %79, negatif öngörü değeri (NÖD) %47 olarak saptanmıştır. Sonuçlar: Elde ettiğimiz sonuçlara göre C. difficile toksin pozitif hasta örneklerindeki VRE kolonizasyonunun negatiflere göre anlamlı olarak (p<0.05) daha yüksek olduğu görülmüştür. VRE taraması hastaneler için ciddi bir maliyet yükü getirmektedir. Bu sebeple günümüzde bu taramalarda hastaların seçilerek özellikle hematoloji-onkoloji gibi servislerle sınırlandırılmasının maliyet etkinlik açısından gerekliliği tartışılmaktadır. Çalışmamızda elde ettğimiz %79 PÖD, VRE taraması için hasta seçiminde C. difficile toksin pozitif hastaların taranmasının anlamlı olacağını göstermektedir. Bu durum hastaneler açısından hem iş gücü, hem de maliyet kazancına yol açacaktır.
Özet (Çeviri)
C. difficile and VRE are the most important nosocomial pathogens which are related to the misuse of antibiotics. VRE colonization is the main cause for diarrhoea in patients with immune deficiency, hospitalized or undergoing chemotherapy. Similar factors for C. difficile is also important. In this study our aim was to determine the VRE colonization from the faecal samples sent to obtain the toxins of C. difficile. Methods: 158 faecal samples tested for C. difficile toxins. After various phenotypic and biochemical identification procedures were applied, 19 VRE were isolated. The minimum inhibiting concentrations (MIC) of vancomycin and teicoplanin were determined by E-test and their resistant genes were studied by Polymerase Chain Reaction (PCR) method. Results: VRE positivity was 17% in toxin positive samples, however it was 5.7% in negative ones. All of the VRE were identified as E.faecium. While the positive predictive value (PPV) of VRE colonization in toxin positives is 79%, the negative predictive value (NPV) is 47%. Conclusion: According to the results of our study, the rate of VRE colonization in toxin positive samples is significantly higher (P<0.05) than the negative ones. Screening of VRE cause a high cost for hospitals. Theese screening can be limited to special ward like hematology-oncology to reduce the cost for hospitals. Our results show that screening VRE in C. difficile toxin positive sample are remarkable. This will help the hospitals to reduce workload and cost.
Benzer Tezler
- Akdeniz Üniversitesi Hastanesinde yatan iki yaş ve üzeri hastalarda C.difficile ilişkili ishallerin toksijenik kültür, glutamat dehidrogenaz enzimi-toksin A/B elisa ve PZR ile araştırılması
Investigation of toxigenic clostridium difficile-associated diarrhea by culture, GHL enzyme, toxin A/B elisa and pcr at hospitalized patients with two years and older in Akdeniz University Medical School Hospital
ÖZLEM KOYUNCU ÖZYURT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
MikrobiyolojiAkdeniz ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BETİL ÖZHAK BAYSAN
- Toksin isteği ile gelen dışkılardan üretilen c.difficile kökenlerinde toksin varyantlarının araştırılması
Investigation of toxin variants in C.difficile strains isolated from stool samples submitted for toxin detection
UMUT DENİZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2009
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NURVER ÜLGER
- Hastanemizde 2012-2014 yılları arasında izole edilen Clostridium difficile kökenlerinin antibiyotik duyarlılık paternleri ve genotipik dağılımları
The antimicrobial susceptibility patterns and genotypes of clostridium difficile strains isolated at Marmara University Hospital between 2012 and 2014
ELVAN SAYIN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURVER ÜLGER
- Discovery of small molecules with inhibitory potential and therapeutic peptide design against clostridium difficile infection
Clostridium difficile enfeksiyonuna yönelik inhibitör potansiyeline sahip küçük molekül keşfi ve terapötik peptid tasarımı
DAMLA NUR ÇAMLI
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
Biyomühendislikİstanbul Medeniyet ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SALİHA ECE ACUNER ZORLUUYSAL
- İshalli ve asemptomatik kişilerin dışkılarında C. difficile ve toksinleri ile diğer enterik patojenlerin insidansı
The Incidence of C. difficile, C. difficile toxins and the other enteric pathogenic microorganisms in stool of patients with diarrhea and asemptomatic persons
PERVİN KARAER