Silika metodu ile kemikten DNA ekstraksiyonu
Silica based DNA extraction from bone
- Tez No: 386572
- Danışmanlar: PROF. DR. BEHNAN ALPER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Adli Tıp, Forensic Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Adli Tıp Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 50
Özet
Adli uygulamalarda ölüm olaylarının incelenmesinde en önemli aşamalardan birisi kişinin kimliğinin tespitidir. Kimliklendirme için çeşitli biyolojik delillerden DNA'ya ulaşmak mümkündür. Cesetlerin maruz kaldığı farklı fiziksel ve kimyasal faktörler sonrası DNA'nın en iyi korunabildiği ve kontaminasyondan en az etkilenen doku kemik dokusudur.Bu çalışmada kemik dokudan silika esaslı DNA ekstraksiyon metodu ile DNA elde edilebilirliğinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmada Adana Adli Tıp Kurumunda otopsisi yapılan olgulardan alınan 15 adet kosta kemiği kullanılmıştır. 6 ay oda sıcaklığında bekletilen kemik örneklerinde silika temelli ticari kit olan Qiagen DNA Mini Kit ile 16 STR (D8S1179, D21S11, D7S820, CSFIPO, D3S1358, THO1, D13S317, D16S539, D2S1338, D19S433, VWA, TPOX, D18S51, AMEL, D5S818 ve FGA) sisteminin tanımlanabilmesi için yeterli kalite ve kantitede DNA elde edilebilmiştir. Çalışmada kullanılan 15 taze kemik örneğinden DNA eldesinde dekalsifikasyona gerek olmadığı görülmüştür.Çalışmada kullanılan üç eski kemik örneğinin ikisinde dekalsifikasyonlu ve dekalsifikasyonsuz başarılı DNA ekstraksiyonu yapılamamıştır. Birinde ekstraksiyonda tanımlanabilir miktarda DNA bulunmamasına karşın 16 STR sisteminin çalışıldığı multiplex reaksiyonda relatif floresans ünitesi 50'nin altında olmakla birlikte D3S1358, THO1, D19S433, TPOX, AMEL ve D5S818 STR sistemleri tanımlanabilmiştir. Bu durum eski örneklerin toz haline getirilme aşamasında soğutma sistemli bir düzeneğin olmamasına bağlandı.Elde edilen sonuçlar kemik dokudan silika temelli DNA ekstraksiyonunun Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi Adli Tıp Anabilim Dalı Adli Seroloji ve Genetik Laboratuvarında rutin hizmette kullanılabilirliğini gösterilmiştir.
Özet (Çeviri)
Determining the identity of a dead person is one of the most important steps in the practise of Forensic medicine. DNA can be retrieved from a variety of biological material for the correct identification. DNA is best preserved and least likely to be contaminated in the bone tissue after a range of physical and chemical impacts on the corpse.In this study, the feasibility of a silica-based method of DNA extraction from bone has been investigated. A total 15 costal bones obtained from autopsy cases at the Adana Forensic Medicine Institute has been used. Sufficient amount of good quality DNA to successfully run a 16 STR (D8S1179, D21S11, D7S820, CSFIPO, D3S1358, THO1, D13S317, D16S539, D2S1338, D19S433, VWA, TPOX, D18S51, AMEL, D5S818 and FGA) test has been extracted with a silica-based commercial kit, Qiagen DNA Blood Mini Kit) from six months old bones left in room temperature. It was also observed that decalcification was not necessary for the extraction of DNA from 15 fresh bones.In three old bones, the DNA extraction failed with or without decalcification. In one case, although there was not a recogniziable amount of DNA, we were able to determine D3S1358, THO1, D19S433, TPOX, AMEL and D5S818 in a 16 STR multiplex reaction, despite the relative fleurosence unit being below 50. This is explained by not using a system with a cooler during grinding of old samples in this study.These results demonstrate that a silica-based metod of DNA extraction from bone can be employed for routine diagnostics at the Forensic Serology and Genetics Laboratory of the Çukurova University, Faculty of Medicine, department of Forensic Medicine.
Benzer Tezler
- Cam yüzeyler için fonksiyonel yüzey kaplama materyallerinin hazırlanması ve geliştirilmesi
Cam yüzeyler i̇çi̇n fonksi̇yonel yüzey kaplama materyalleri̇ni̇n hazirlanmasi ve geli̇şti̇ri̇lmesi̇
BİLGEN ARIKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Kimya MühendisliğiYıldız Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SENNUR DENİZ
- Silica coating of monodisperse hydrophobic magnetite nanoparticles through reverse microemulsion techniques
Monodispers hidrofobik manyetik nanoparçacıkların ters mikroemülsiyon metodu ile silika kaplanması
ZEYNEP ERGÜL
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
KimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiMikro ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MÜRVET VOLKAN
PROF. DR. NECATİ ÖZKAN
- Peroksidaz aktivitesine sahip nanopartikül/mikroküre kompozitlerinin sentezi ve glutatyon tayininde kullanılması
Synthesis of nanoparticle/ microsphere composites with peroxidase activity and their use in the determination of glutathione
SELEN YAĞMUR GÜNGÖR
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Kimya MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SÜLEYMAN ALİ TUNCEL
DR. FATOŞ ÇİĞDEM KİP
- Süperhidrofobik polimer kompozit filmlerin hazırlanması ve karakterizasyonu
Preparation and characterization of superhydrophobic polymer composite films
ALPER NERAT
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Metalurji MühendisliğiGebze Teknik ÜniversitesiMalzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ İLKE ANAÇ
- Tepki yüzey metodu ile fındık yağından bazı safsızlıkların silika aerojel ile adsorpsiyonunun optimizasyonu
Optimization of hazelnut oil impurities with silica aerojel by response surface methodology
PAZILAITI YASHENG
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEVİL YÜCEL