5-Fluorourasil molekülünün su komplekslerinin titreşim frekanslarının AB-Inito DFT yöntemi ile hesaplanması
The calculation of the vibrational frequencies of the 5-Fluorourasil molecule's H2O complexes by ab-initio and Density Functional methods
- Tez No: 394433
- Danışmanlar: PROF. DR. SEVİM AKYÜZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyofizik, Biophysics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Kültür Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 66
Özet
5-Fluorourasil (C4H3FN2O2) (5-Fluoro-1H,3H-pyrimidine-2,4-dione), molekülü en eski kemoterapi ilaçlarından biridir, ilk kez 1957 yılında sentezlenmiştir ve o günden beri katı tümörlerin tedavisinde kullanılmaktadır. Aynı zamanda urasil ve türevleri temel biyolojik süreçlerde önemli bir rol oynamaktadır. Bu çalışmada, kanser tedavisinde ilaç olarak kullanılan 5-fluorourasil molekülünün yapısı, yoğunluk fonksiyonu teorisi (DFT), B3LYP fonksiyoneli ve 6-311++G(d,p) baz seti ile optimize edilmiş, en düşük enerjili moleküler yapısı saptanmıştır. Daha sonra mümkün su kompleksleri oluşturularak en düşük enerjili konformasyonları saptanmıştır. 5-Fluorasil monomerinin ve iki düşük enerjili su komplekslerinin optimize geometrik parametreleri kullanılarak titreşim frekans ve kipleri hesaplanmış ve sonuçlar deneysel kırmızı altı spektroskopik sonuçlar ile karşılaştırılmıştır. Çalışmanın amacı fizyolojik ortamda bu molekülün davranışlarını incelemek için molekülün su ile yaptığı etkileşmeleri saptamaktır.
Özet (Çeviri)
5-Fluorourasil (C4H3FN2O2) (5-Fluoro-1H,3H-pyrimidine-2,4-dione), is one of the oldest chemotherapy drugs, was first synthesized in 1957 and it is being used since then for the treatment of solid tumors. Also, uracil and derivatives play important role in basic biological processes. In this study the molecular structure of the anticancer drug, 5-fluorouracil molecule, was optimized by using Density Functional theory, B3LYP functional and 6-311++G(d,p) basis set and the most stable geometry was determined . Afterwards, the possible water clusters of the molecule were formed and their energetically preferred conformations were investigated. The optimized structural parameters of the most stable monomer and two low energy water clusters were used in the vibrational wavenumber calculations. The vibrational wavenumbers and modes were calculated and compared with experimental IR spectra of solid 5-fluorouracil. The aim of this study is to investigate the interaction of 5-fluorouracil with water molecules in order to elucidate behaviors of the biological active molecule in physiological medium.
Benzer Tezler
- Proliferatif vitreoretinopati tedavisinde doğal molekül hispidulin kullanımının in vitro modelde araştırılması
Investigation of the use of natural molecule hi̇spi̇duli̇n i̇n the treatment of proliferative vitreoretinopathy i̇n an i̇n vi̇tro model
SULTAN KAYA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Göz HastalıklarıTrakya ÜniversitesiGöz Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ RÜVEYDE GARİP
- Mide kanserinde HSP inhibitörlerinin etkinliğinin incelenmesi
Investigation of HSP inhibitors' efficacy in gastric cancer
TUĞBA KULLE
Doktora
Türkçe
2024
Moleküler TıpSağlık Bilimleri ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YUSUF TUTAR
- 5-fluorourasil tayini için moleküler baskılanmış temelli sensör geliştirilmesi ve modellenmesi
Development amd modelling of moleculary imprinted sensors for determanation of 5-fluorouracil
HABİBE ŞENBABA
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
KimyaTekirdağ Namık Kemal ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YELDA YALÇIN GÜRKAN
DOÇ. DR. AYSU YARMAN
- Combined effects of chemotherapy and indocyanine green mediated photodynamic therapy on ex vivo human primer breast cancer cells
İndosiyanin yeşil molekülünün ex vivo insan primer meme kanseri hücreleri üzerindeki fotodinamik terapi ve birleştirilmiş kemoterapi etkisinin araştırılması
AYŞENUR KİRİŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
BiyofizikFatih ÜniversitesiBiyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HAŞİM ÖZGÜR TABAKOĞLU
- Pürin çekirdeği içeren bir bileşiğin sentezi, karakterizasyonu ve sitotoksik aktivite çalışmaları
Synthesis, characterization, and cytotoxic activity studies of a purine nucleus-containing compound
MEDİNE BOZGÖZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
KimyaErciyes ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İLHAN ÖZER İLHAN
DOÇ. DR. SENEM AKKOÇ