Şanlıurfa yöresinde koyun ve keçilerde anaplasma phagocytophılum'un moleküler yöntemlerle araştırılması
An investigation of anaplasma phagocytophilum on goats and sheeps with molecular methods in sanliurfa region
- Tez No: 396292
- Danışmanlar: PROF. DR. NAZİR DUMANLI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Fırat Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Parazitoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 35
Özet
Anaplasma phagocytophilum ruminant, kemirici, tek tırnaklı, kuş ve insanlarda granülositik anaplasmosise neden olan ve kenelerle nakledilen bir türdür.Bu araştırma, Şanlıurfa yöresinde koyun ve keçilerde A. phagocytophilum'un varlığı ve yaygınlığının belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Nisan-Temmuz 2013 tarihleri arasında koyun ve keçilerden alınan kan örneklerinde etkenin varlığı 16S SSU rRNA genine spesifik polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) kullanılarak araştırılmıştır. Polimeraz zincir reaksiyonu pozitif örnekleri temsilen seçilen bir örneğin 16S SSU rRNA geninin DNA dizilimi belirlenmiştir. Şanlıurfa yöresinde 134 koyun ve 74 keçi olmak üzere 208 hayvandan tam kan örneği alınmıştır. Laboratuvarda elde edilen total genomik DNA'lar A. phagocytophilum'un 16S SSU rRNA genini kısmi olarak amplifiye edenspesifik primerler ile PZR'ye tabi tutulmuştur. Bu çalışmada incelenen 208 kan örneğinin 9 (% 4.33)'unda A. phagocytophilum'un varlığını gösteren amplifikasyon ürünü elde edilmiştir. A. phagocytophilum pozitiflik oranının koyunlarda % 5.97 (8/134), keçilerde % 1.35 (1/74) olduğu saptanmıştır. Bir örneğin DNA dizi analizi belirlenmiş ve GenBank'a KJ183079 accession numarası ile kayıt edilmiştir. Sonuç olarak, bu çalışma ile Şanlıurfa yöresindeki koyun ve keçilerde PZR ve sekans analizi ile A. phagocytohilium varlığı ilk defa ortaya konmuş ve etkene ait epidemiyolojik veriler elde edilmiştir.
Özet (Çeviri)
Anaplasma phagocytophilum are tick born rickettsial organism and they cause granulocutic anaplasmosis in ruminants, equids, birds and humans. This study was performed to determine the presence and prevalence of A. phagocytophilum in sheep and goats in the Şanlıurfa region between April and July 2013. Polymerase chain reaction (PCR) using primers specific to the A. phagocytophilum 16S SSU rRNA gene of the bacterium was applied to blood samples. The amplified DNA fragments in PCR positive samples were sequenced in order to confirm their identity. Whole blood samples were taken from a total of 208 animals (134 sheep and 74 goats) in the Şanlıurfa region. The total genomic DNA was extracted in the laboratory and a part of the 16S SSU rRNA gene of A. phagocytophilum was PCR-amplified using the species-specific primers. PCR amplification indicated the presence of A. phagocytophilum in 9 animals (4.33 %). A. phagocytophilum was present in 5.97 % (8/134) of sheep and 1.35 % (1/74) of goats. The nucleotide sequence of a sample selected to represent the PCR positive samples was determined. The resulting DNA sequence was compared to other DNA sequences available in the GenBank using BLAST analysis and placed into GenBank under accession number as KJ183079. As a result, presence of A. phagocytophilum in the sheep and goats in the Şanlıurfa region was demonstrated for the first time using PCR and sequence analyses and epidemiologic data regarding the pathogen were also obtained.
Benzer Tezler
- Şanlıurfa yöresindeki küçükbaş hayvanların filogenetik yapılarının moleküler tekniklerle belirlenmesi çalışmaları
Studies on phylogenetic profiles of small ruminant animals in Sanliurfa region using molecular techniques
SELAHADDİN KİRAZ
- Van ili gevaş ilçesi'nde yetiştirilen keçilerde neospora caninum' un seroprevalansı
Seroprevalence of neospora caninum in GOATS in gevaş district of van
AHMET TOY
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Veteriner HekimliğiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiParazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BEKİR OĞUZ
- Güneydoğu Anadolu bölgesi Şanlıurfa yöresindeki küçükbaş hayvan barınaklarının yapısal yönden araştırılması ve geliştirilmesi
Searching and developing sheep barns constretively in Sanliurfa, southeast of Anatolia
ARMAN AMAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatHarran ÜniversitesiTarımsal Yapılar ve Sulama Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. GÖKHAN İSMAİL TUYLU
- Şanlıurfa yöresinde doğal olarak yetişen bademlerin (Prunus Amygladus L.) seleksiyonu
Selection of almond (Prunus Amygladus L.) narurally grow inSanliurfa region
YAKUP POLAT
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET KAZANKAYA
- Tek Tek dağları bölgesindeki doğal meraların yem değeri ile merada otlayan ivesi kuzuların besi performansının araştırılması
Investigation of the feed value of natural pasfures and the fattening performance of the lamb stitching in the area
FUAT TATLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ZiraatHarran ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ AYFER BOZKURT KİRAZ