Geri Dön

Just how good is third generation sequencing for complex genomes?

Başlık çevirisi mevcut değil.

  1. Tez No: 401420
  2. Yazar: ESMA KARAARSLAN
  3. Danışmanlar: DR. EDWARD HOLLOX
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: University of Leicester
  10. Enstitü: Yurtdışı Enstitü
  11. Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 72

Özet

Özet yok.

Özet (Çeviri)

The sequencing technologies have been pioneers in field of genomics. Sanger sequencing as a first generation sequencing (FGS) technique has been the first significant method for Human Genome Project. Numbers of publishes had done through this method but it had to be improved in terms of read length, time consuming and high cost. To reduce cost and increase throughput, second generation sequencing (SGS) techniques have appeared on market. However, still read length has been the main challenge for complex genome sequencing. In this case, third generation sequencing techniques (TGS) have provided large-scale sequencing and real time single molecule detection to exceed previous limitations. Our study covers of testing Pacific Bioscience Single Molecule Real Time Sequencing Technique (SMRT) as a TGS method to analyse both the single base and the molecular level of complex genomes, also assemble a contiguous BAC sequence across the macaque beta-defensin region, and perform a preliminary analysis of sequence variation. Analyses of restriction enzyme maps and BAC end sequencing have referred misassembling and also data analysis of gene content has confirmed sequence error in TGS. As a result, this study has demonstrated that SMRT technology has some gaps for sequence and assembling accuracy even though it provides long read length and direct assembly. Therefore, in future, enzyme kinetics can be improved to increase the accuracy of single molecule sequencing in real time. Furthermore, if higher level dimensional data is accurately analysed and assimilated, TGS will contribute towards a better understanding of large-scale DNA sequencing.

Benzer Tezler

  1. Bankacılıkta değişim yönetimi

    Change management in banking

    AYDIN ARGIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    BankacılıkMarmara Üniversitesi

    Bankacılık Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NAZIM EKREN

  2. Tarihi ve kültürel sürekliliğin fiziksel çevrede değişime yansıması ve Eskişehir örneği

    The Reflections of historical and cultural continuity on the changes of physical environment and the Eskişehir example

    MERAL NALÇAKAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1993

    Mimarlıkİstanbul Teknik Üniversitesi

    PROF. DR. MİNE İNCEOĞLU

  3. A tipi yatırım fonlarında etkin bir nakit yönetim stratejisi oluşturmada analitik hiyerarşi yaklaşımı

    Başlık çevirisi yok

    FERAL YOLAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    Mühendislik Bilimleriİstanbul Teknik Üniversitesi

    İşletme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. CEMİL ALBAYRAK

  4. Kıyı alanları planlaması bağlamında bütünleşik kıyı alanları yönetimi ve planlaması: İzmit körfezi (Kocaeli-Yalova) bütünleşik kıyı alanları planı örneği

    Integrated coastal zone management and planning in the context of coastal area planning: Izmit bay (Kocaeli-Yalova) example of integrated coastal zone plan

    ESRA ŞENTÜRK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Şehircilik ve Bölge PlanlamaMimar Sinan Güzel Sanatlar Üniversitesi

    Şehir ve Bölge Planlama Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ADEM ERDEM ERBAŞ

  5. Türk halk oyunlarının sahnelenmesinde ışık-kostüm ilişkisi

    Başlık çevirisi yok

    SEÇKİN ESEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1996

    Müzikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Y.DOÇ.DR. GÖKTAN AY