Geri Dön

The structural characterization of two proteins involved in the repair of general DNA damage

Başlık çevirisi mevcut değil.

  1. Tez No: 403392
  2. Yazar: JITKA ERYILMAZ
  3. Danışmanlar: Dr. TRACEY BARRETT
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Genetik, Radyoloji ve Nükleer Tıp, Genetics, Radiology and Nuclear Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2007
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: University of London - Birkbeck
  10. Enstitü: Yurtdışı Enstitü
  11. Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 196

Özet

Özet yok.

Özet (Çeviri)

Several modes of repair exist to correct altered/damaged or mispaired bases in DNA. In this thesis the main focus will be on two Nucleotide excision repair (NER) mechanisms that recognise lesions associated with UV damage. In bacteria, the main mechanism for the removal of such adducts is the UvrABC pathway, pivotal to which is the damage recognition element UvrB that forms part of a tracking complex with UvrA. The dynamics underlying this process and in particular, the transformation of UvrB into an active helicase that is key to the location of lesions, were poorly understood. In order to gain insights into this essential step of the UvrABC pathway, the crystal structure of a ternary complex involving UvrB from B. subtilis bound to both ADP and a thymine trinucleotide was determined. This structure has not only shown that UvrB cycles between DNA binding competent and incompetent states but demonstrates that these changes are intrinsically linked to ATP hydrolysis. In addition to mainstream NER, a limited number of organisms possess an alternative mechanism that is initiated by a single, broad specificity damage specific endonuclease, UVDE. The way in which damage was detected by this unique family of enzymes could only be speculated based on the available data. The crystal structures of two UVDE-DNA complexes were determined revealing elements essential for lesion recognition and processing. These include the identification of a non-specific nucleotide binding pocket shown to be key to DNA binding.

Benzer Tezler

  1. Çinko nanotanecik içeren polimer nanokompozit malzeme üretimi ve karakterizasyonu

    Fabrication and characterization of polymer nanocomposite materials incorporated zno nanoparticles

    ALEV AKBAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Kimya Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SADRİYE KÜÇÜKBAYRAK OSKAY

  2. The productıon and pegylatıon of recombinant human granulocyte colony-stımulatıng factor produced ın e. coli

    Rekombinant insan granulosit koloni stimülan faktörünün e. coli'de üretimi ve pegilasyonu

    NAZLI DİLARA ERDOĞDU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Biyokimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

  3. Vascular function in chronic end-organ damage: pharmacological characterization of vasomotor function in systemic vasculature

    Kronik uç-organ hasarında vasküler fonksiyon: Sistemik damarlarda vazomotor fonksiyonun farmakolojik karakterizasyonu

    NADİR ULU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2009

    Eczacılık ve FarmakolojiUniversity of Groningen (Rijksuniversiteit Groningen)

    Tıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ROBERT HENK HENNING

  4. Katkısız ve ZnO nanoparçacık katkılı NIPAM nanojellerininsentezlenmesi ve karakterizasyonu

    Synthesis and characterization of undoped and ZnO nanoparticles doped NIPAM nanogels

    OĞUZ GÜRCÜOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Fizik ve Fizik Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Fizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ESRA ALVEROĞLU DURUCU

  5. Substrate characterization of putative ancestral xyloglucan endotransglycosylase/hydrolases

    Atasal ksıloglukan endotransglikozilaz/hidrolazların substrat karakterizasyonu

    DİLARA TÜZÜN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Bilim ve TeknolojiYeditepe Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ANDREW JOHN HARVEY