Salmonella enterica serovar virchow suşlarında besinsel ve çevresel koşulların selüloz üretimi, kıvrımlı fimbriya sentezi ve biyofilm oluşumu üzerine etkisi
Effects of nutritional and environmental conditions on cellulose production, curli fimbriae biosynthesis and biofilm production of Salmonella enterica serovar virchow strains
- Tez No: 414085
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. NEFİSE AKÇELİK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 96
Özet
Çevresel ve besinsel koşullarının Salmonella Virchow suşlarının biyofilm üretimi üzerine etkisinin araştırıldığı çalışmada; toplam 16 S. Virchow susunun 15 adetinde rdar morfotipi tespit edildi. Bir suş ise bdar morfotipinde bulundu. Tüm suşlar 48, 72 ve 96 saat inkübasyon süreleri sonunda yüksek düzeyde biyofilm üreticisi olarak saptandı. Besinsel faktör olarak kullanılan tripton konsantrasyonları (0.5, 1, 1.5, 2, 4, 6, 8, 10g/L), biyofilm üretim düzeyinde herhangi bir değişikliğe neden olmazken farklı sıcaklık (20, 25, 30, 35, 37, 40 ⁰C) ve pH (4.5, 5.2, 5.9, 6.6, 7.3, 8, 8.7 ve 9.4) değerlerinde suşların biyofilm üretim düzeyleri değişim gösterdi. Bu denemeler sonucunda optimum biyofilm üretiminin pH 6.6' da ve 20 ⁰C'de gerçekleştiği belirlendi. Çevresel faktörlerinin biyofilm üretimi üzerindeki etkisi, Gompertz denklemi kullanılarak bir matematiksel model ile tanımlandı. Modelin tahmin kapasitesi farklı pH (5.3 ve 6.3) ve sıcaklık (23 ve 26 ⁰C) değerleri denenerek başarılı bir şekilde test edildi. Oluşturulan matematiksel modelde sıcaklığın yükselmesine bağlı olarak biyofilm miktarında azalma meydana geldiği belirlendi. Ayrıca pH değerinin yükselmesine bağlı olarak biyofilm miktarında artış gözlendi. Çevresel koşulların (sıcaklık ve pH) biyofilm yapısını oluşturan kimyasal bileşenlerin kompozisyonunu etkilediği DMC18 suşunda FTIR incelemeleri sonucunda belirlendi. Özellikle inkübasyon sıcaklığının artışına paralel olarak; protein, karbonhidrat ve nükleik asit piklerinde saptanan düşmeler veya karbonhidrat pikinin tespit edilememesi, çevresel etkilerin biyofilm morfotipinin ya da pelikül yapısının değişimine de yol açtığına işaret etmektedir.
Özet (Çeviri)
In this study, the effect of environmental and nutritional conditions on biofilm production of Salmonella Virchow strains was investigated and radar morphotype was determined at 15 out of 16 S. Virchow strains. Rdar morphotype was determined at only one of the tested strains. All strains produced high level of biofilm following the 48, 72 and 96h incubation periods. Tryptone concentrations (0.5, 1, 1.5, 2, 4, 6, 8, 10g/L), used as a nutritional factor, did not cause any differentiation at biofilm production levels of strains. Notwithstanding, at different temperature (20, 25, 30, 35, 37, 40 ⁰C) and pH (4.5, 5.2, 5.9, 6.6, 7.3, 8, 8.7 and 9.4) levels, biofilm production levels of strains have been changed. As a result of this experiment, optimum conditions for biofilm production were determined as pH 6.6 and 20 ⁰C. The effect of environmental factors on biofilm production was mathematically modeled using the Gompertz equation. The production capacity of model at different pH (5.3 and 6.3) and temperature (23 and 26 ⁰C) values was successfully tested. Using created mathematical model, it was determined that, the increased temperature cause reduction in biofilm production level. Furthermore, increase on pH value caused an increase of biofilm production. The effect of environmental conditions (temperature and pH) on composition of chemical components of biofilm produced by DMC18 strain was determined as a result of FTIR studies. In particular, during the increase at incubation temperature, the amount of carbohydrate, protein, lipid and nucleic acid was significantly decreased and also unable to determine the carbohydrate peak indicated that environmental conditions might lead changes at biofilm morphotype or biofilm structure.
Benzer Tezler
- Salmonella enterica serovar Typhimurium marT mutantlarının biyofilm oluşturma özellikleri açısından doğal tip s. Typhimurium 14028 ile karşılaştırılması
The comparision of Salmonella enterica serovar Typhimurium marT mutants and wild type s. Typhimurium 14028 according to their biofilm production abilities
BURCU YENER İLÇE
Doktora
Türkçe
2013
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiTemel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NEFİSE AKÇELİK
- Characterization of outer membrane proteins of Salmonella enteritidis in response to phenolic acids stress
Fenolik asit stresinde Salmonella enteritidis'in dış membran proteinlerinin karakterizasyonu
ÖZGÜN ÖYKÜ ÖZDEMİR
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. FERDA SOYER
- Salmonella enterica serovar typhimurium (S.typhimurium) ATCC 14028 suşuna ait antijenik FliC geninin klonlanması ve protein üretimi
Cloning and protein production of the antigenic FliC gene of Salmonella enterica serovar typhimurium ATCC 14028 strain
SELDA KILIÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
GenetikAtatürk ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ORHAN ERDOĞAN
- Salmonella enterica Serovar Typhimurium' da histidin operonu inaktive edilmiş bir mutant suşun proteomik analizi
Proteomic analysis of a histidine operon inactivated mutant strain of Salmonella enterica Serovar Typhimurium
İBRAHİM ERDOĞAN
- Salmonella enterica subspecies enterica serovar infantis suşlarında çoklu ilaç dirençliliğin genetik doğası
Genetic nature of multi drug resistance in Salmonella enterica subspecies enterica serovar infantis
DUYGU ABBASOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA AKÇELİK