Salmonella enterica Serovar Typhimurium' da histidin operonu inaktive edilmiş bir mutant suşun proteomik analizi
Proteomic analysis of a histidine operon inactivated mutant strain of Salmonella enterica Serovar Typhimurium
- Tez No: 318218
- Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA AKÇELİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biyoloji, Biotechnology, Biology
- Anahtar Kelimeler: Histidin, Salmonella, Histidine, Salmonella
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada, transpozon mutasyonu yolu ile histidin operonu inaktive edilmiş bir S. Typhimurium mutantı (S. Typhimurium ?his 87) ile kontrol suş olarak kullanılan S. Typhimurium LT2 suşu arasındaki proteomik düzeyde değişimler incelenmiş, söz konusu mutasyon koşullarında mutantta (Salmonella Typhimurium ?his 87' de) ifadesi olmayan protein spotları tanımlanmıştır. Yapılan çalışmalar sonucunda, S. Typhimurium LT2' de ifade edilen ancak S. Typhimurium ?his 87' de ifadesi olmayan 4 adet protein saptanmıştır. Bu proteinler; arjinin biyosentezi, amino asit açlığı, midenin düşük asidik koşulları ve anoksik koşullarda üretilmesi zorunlu olan arjinin--tRNA ligaz proteini, Salmonella' nın konakçı hücre içerisinde replikasyonu için uygun niş oluşumunu sağlayan SifA efektör proteini, konakçı hücre içerisinde hayatta kalma ve bakteriyel metabolizmada önemli görevleri olan GMP (guanozin monofosfat) sentaz proteini, ve konakçı hücrede gerçekleşen membran katlanmaları için gerekli olan guanin nükleotidi değişim faktörü sopE proteinleridir. Salmonella Typhimurium LT2 suşunda histidin operonu inaktive edilmiş mutant suşta, söz konusu mutasyonun polar etkileri sonucu üretimi engellenen proteinlerin, literatür verileri dikkate alınarak değerlendirildiğinde konak hücrede bakterinin sistemik enfeksiyonu başarılı bir şekilde gerçekleştirebilmesi için önemli proteinler oldukları belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, it has been analysed that the changes at the proteomic level between a Salmonella mutant (S. Typhimurium ?his 87) which its histidine operon was inactivated by transposon mutation technic and S. Typhimurium LT2 strain that has been used as a control strain. In this mutation conditions, it has been described that protein spots which have been non-expressed in mutant (S. Typhimurium ?his 87). As a result of the experiments, we have detected 4 proteins which is expressed in S. Typhimurium LT2 but non-expressed in mutant S. Typhimurium ?his 87. These proteins are; arginine--tRNA ligase which is very important and obligatory for arginine biosynthesis, amino acid starving, surviving in the low acidic and anoxic conditions in stomach, the second one is that Salmonella effector protein SifA which is essential for replication in the host, the third one is that GMP synthase (glutamine hydrolysing) which is very important for surviving in the host and bacterial metabolism, the fourth one is that guanine nucleotide exchange factor SopE which is very substantial for membrane rufflings in the host. When considered the literature datas, the proteins that are expressed in S. Typhimurium LT2 but as a result of polar effects of histidine operon mutation non-expressed S. Typhimurium ?his 87 very essential for successfully systemic infection in the host.
Benzer Tezler
- İzmir pazarlarında satılan taze köy peynirlerinin bazı nitelikleri ve özellikle zehirlenmeye neden olan bakteri içerikleri üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
NURSEL VAPURCU
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiSüt Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN YAYGIN
- Hidrojen peroksit ve kurutma sıcaklığının sıvı yumurtada salmonella typhimurium üzerine etkisi
Başlık çevirisi yok
FULYA TURANTAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiGıda Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ADNAN ÜNLÜTÜRK
- Hidrojen peroksitin düşük sıcaklıkta sıvı yumurtanın bakteriyolojik kalitesi üzerindeki etkisi
Başlık çevirisi yok
MÜGE KASAPUGİL
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ADNAN ÜNLÜTÜRK
- Farklı sıcaklıklarda depolanan yumurtaların mikrobiyolojik bozulması ve salmonellanın kabuktan geçme süresi
Başlık çevirisi yok
GÜNNUR TUNÇEL
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DENİZ GÖKTAN
- Bazı baharat ve ekstraktlarının gıda zehirlenmesi yapan bakteriler üzerine antimikrobiyal etkileri
Başlık çevirisi yok
ŞAHİKA AKTUĞ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiGıda Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MEHMET KARAPINAR
- Kokareçlerin hijyenik kalitesi ve belirli pişirme tekniklerinin mikroorganizmalar üzerine etkisi
Başlık çevirisi yok
SERTAÇ CEYLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DENİZ GÖKTAN