Geri Dön

Nöroblastom mikroRNA ilişkisi

Relationship between neuroblastoma and microRNA

PDF İndir

  1. Tez No: 417206
  2. Yazar: KEMAL ERGİN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. HATİCE NUR OLGUN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Onkoloji, Oncology
  6. Anahtar Kelimeler: microRNA, neuroblastoma, ganglioneuroma
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 100

Özet

Giriş ve Amaç: Nöroblastom tüm çocukluk çağı kanserlerinin % 8-10'unu oluşturur. MikroRNA (miRNA)'lar küçük ve kodlayıcı olmayan RNA'lar olup gen ekpresyonunun posttranskripsiyonel düzenlenmesinde ve bazı kanserlerin patogenezinde önemli bir rol oynamaktadırlar. Bu çalışmanın amacı; farklı klinik ve histolojik özellikler gösteren nöroblastom dokularında miRNA ekspresyon profilini saptamaktır. Gereç ve Yöntem: Çalışmada 17 adet hastanın arşiv parafin bloklarına ait toplam 24 adet farklı örnek kullanıldı. Bu dokular gruplandırılarak 5 ayrı analizde mikroarray ile mikroRNA profilleri karşılaştırıldı: I. analiz: İyi differansiye (n=6), andifferansiye (n=6) II. analiz: Kemoterapi öncesi (n=3), kemoterapi sonrası (n=3) III. analiz: İyi histoloji (n=10), kötü histoloji (n=8) IV. analiz: Nöroblastom (n=4), Ganglionörom (n=4) V. analiz: düşük risk (n=10), orta risk (n=6), yüksek risk (n=8) Biyoinformatik analizi sonrasında eş zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu ile validasyon yapıldı. Bununla birlikte yüksek ve düşük riskli yeni hastalara ait tümör dokularında valide mikroRNA'lar ile karşılaştırma yapıldı. Ayrıca klinik veriler ile farklı eksprese olan miRNA'lar açısından karşılaştırma yapıldı. Bulgular: I. analiz'de 25 adet, II. analiz'de 8 adet, III. analiz'de 3 adet, IV. analiz'de 4 adet, V. analiz'de düşük-orta risk için 7 adet, orta-yüksek risk için 1 adet ve düşük-yüksek risk için 14 adet farklı miRNA tespit edildi (p

Özet (Çeviri)

Introduction: Neuroblastoma tumors, presents % 8-10 of all childhood cancers. MicroRNAs (miRNA) are small and noncoding RNAs which play important roles at regulation of posttranscriptional gene expression and pathogenesis of some cancers. The aim of this study was to determine the miRNA expression profiles of neuroblastomas with different clinical and histological characteristics. Material and methods: In this study 24 samples from 17 patients paraffin blocks, were used. Tissues were seperated into groups and their microRNA profiles were compared by 5 different analysis: Analysis I: Well (n=6), poorly (n=6) differantiated Analysis II: Before (n=3), after (n=3) chemotherapy Analysis III: Favorable (n=10), unfavorable (n=8) histology Analysis IV: Neuroblastoma (n=4), ganglioneuroma (n=4) Analysis V: Low (n=10), middle (n=6), high (n=8) risk After bioinformatics analysis Real-time PCR was performed for validation. Validated microRNAs were compared of high- and low-risk new patients' tumors.‬ Clinical data were compared with differentially expressed microRNAs. Results: 25 miRNA in analysis I, 8 miRNA in analysis II, 3 miRNA in analysis III, 4 miRNA in analysis IV, 7 miRNA at low-middle risk, 1 miRNA at middle-high risk, 14 miRNA at low-high risk comparison in analysis V were found different (p < 0.01). These miRNA's targeted mostly the cancer pathway by the KEGG pathway analysis. ‬The markedly difference were at miR-132 and miR-490, comparing the clinical data and microRNAs. The most fold change was detected at miR-98-5p between the tissues of high- and low-risk patients. Conclusion: Our study can be informative for therapies which targets microRNAs and for biomarker studies. ‬

Benzer Tezler

  1. Tez No

    522547

    Alzheimer hastalığı tanısında APP ilişkili gen ve miRNA seviyelerinin biyolojik belirteç olarak kullanılmasının SH-SY5Y insan nöroblastoma hücrelerinde incelenmesi

    Analysis of the use of APP related gene and miRNA levels as biomarkers in SH-SY5Y neuroblastoma cells in the diagnosis of Alzheimer's disease

    EZGİ KESKE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    GenetikHaliç Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZLEM SAĞLAM UÇAR

  2. Tez No

    703882

    Hücre kültüründe aromataz/sirtuin-1 etkileşiminin miRNA ifade düzeyine olan etkisinin araştırılması'

    Investigation of the effect of aromatase / sirtuin-1 interaction on mirna expression level in cell culture

    YASEMİN KARTAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    FizyolojiHacettepe Üniversitesi

    Fizyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MURAT TİMUR BUDAK

  3. Tez No

    353856

    Eritropoetinin SHSY5Y hücre hattında mikroRNA ekspresyonu üzerine etkisi

    Effect of erythropoietin on the microRNA expression levels of SH-SY5Y cell line

    DOĞAN TUNALI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Moleküler TıpDokuz Eylül Üniversitesi

    Temel Nörolojik Bilimler Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞERMİN GENÇ

  4. Tez No

    873350

    The effect of green-synthesized copper oxide nanoparticles on SH-SY5Y neuroblastoma cells' viability and on the expression of miR-133b in an in vitro Oarkinson's disease model

    Yeşil sentezlenen bakır oksit nanopartiküllerinin SH-SY5Y nöroblastoma hücrelerinin canlılığı ve in vitro Parkinson hastalık modelinde miR-133b ekspresyonu üzerine etkisi

    MARWA AGHA KASSAB

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyomühendislikBahçeşehir Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ CANAN BAĞCI

  5. Tez No

    783012

    Investigation of the effects of photobiomodulation on exosomal micro-rnas in an in-vitro oxidative stress model

    Fotobiyomodülasyonun eksozomal mikroRNA'lar üzerindeki etkilerinin in vitro oksidatif stres modelinde araştırılması

    HOUDA MIKATI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    GenetikBahçeşehir Üniversitesi

    Nörobilim Ana Bilim Dalı

    Assist. prof. Dr. MEHMET OZANSOY

Geri Dön