Geri Dön

Buğday alanlarından izole edilen gram negatif bakterilerin identifikasyonu, acc deaminaz, nitrojenaz ve antagonistik aktiviteleri

Identification, acc deaminase, nitrogenase and antagonistic activities of gram negative bacteria isolated from wheat fields

  1. Tez No: 418624
  2. Yazar: ŞÜKRAN KARDAŞ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. GÜLTEN ÖKMEN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Biotechnology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 94

Özet

1-aminosiklopropan-1-karboksilat deaminaz enzimi, 1-aminosiklopropan-1-karboksilik asitin (ACC) bozulmasını kataliz etmektedir. ACC deaminaz aktivitesi, bitkilerde etilen seviyelerinin düşürülmesiyle bitki büyümesini desteklemede bakteriler için önemli bir belirteçtir. Enzim sınırlı sayıda bakteride bulunmuş ve bitkilerde stres kaynaklı etilen üretimini azaltarak stres koşulları altında bitki büyümesi ve gelişimini desteklemede önemli bir rol oynamaktadır. Bu çalışmanın amacı, yüksek ACC deaminaz, nitrojenaz ve antagonistik aktiviteli suşları araştırmaktır. Mevcut çalışmada, Çanakkale' den rizosfer toprakları ve buğday fidelerinden izole edilen 24 suş, ACC deaminaz aktivitesi için taranmış ve sekiz izolatın ACC deaminaz pozitif olduğu saptanmıştır. Gelişim morfolojisi, mikroskobik hücre özellikleri ve biyokimyasal özellikleri temelinde, sonuçlar sekiz suşun Pseudomonas, Enterobacter ve Serratia suşları olarak identifiye edildiğini göstermiştir. Bu bakteriler ACC deaminaz içerdiğinden tek azot kaynağı olarak ACC' i kullanabilir, enzim ACC' i amonyak ve α-ketobutirata hidroliz etmektedir. Bu çalışmada, sonuçlar buğday tarlalarından izole edilen tüm suşlar arasında ACC deaminaz aktivitelerinde bazı farklılıklar olduğunu göstermiştir. ACC deaminaz aktivitesi için sekiz bakteri analiz edilmiş, en yüksek ACC deaminaz aktivitesi Pseudomonas sp. CKB55' te (2833 nmol α-ketobütirat.mg-1.h-1) ve en düşükte Enterobacter sp. CKB17' de (418 nmol α-ketobütirat.mg-1.h-1) bulunmuştur. Daha sonra izolatların tümü, tuz kaynağı olarak NaCI kullanılarak tuz stresi için taranmıştır. En yüksek nitrojenaz aktivitesi Pseudomonas sp. CKB10' da (808 nmol etilen /mg.h) belirlenmiştir. Pseudomonas sp. CKB52, Erwinia caratovora ECC100' e karşı maksimum inhibisyon zonu göstermiş ve zon 11 mm idi. ACC deaminaz içeren bakterilerin çevre dostu olduğu ve bitki büyümesini uyarmak için bir potansiyel stratejiye izin veren, biyotik ve abiyotik stresi hafifleten ve sürdürülebilir tarımı sağlamada, özellikle etilen duyarlı bitkilerin üretimi için tavsiye edilmektedir.

Özet (Çeviri)

The enzyme 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase catalyzes the disruption of 1 aminocyclopropane-1-carboxylic acid (ACC). ACC deaminase activity is an important marker for bacteria to support plant growth by lowering ethylene levels in plants. The enzyme has been found in limited number of bacteria and plays a important role in supporting plant growth and development under stress conditions by reducing stress induced ethylene production in plants. The aim of the present study was to investigate the strains with high ACC deaminase, nitrogenase and antagonistic activity. In the present study twenty four strains isolated from rhizosphere soils and wheat seedlings from Canakkale were screened for ACC deaminase activity and eight isolates were determined to be ACC deaminase positive. Based on their development morphology, microscopic cell properties and biochemical properties, the results showed that eight strains were identified as Pseudomonas, Enterobacter and Serratia strains. These bacteria can utilize ACC as a sole nitrogen source because it contains ACC deaminase, which hydrolyzes ACC to ammonia and α-ketobutyrate. In this study, the results were shown that there are some differences in ACC deaminase activities among all strains isolated from wheat fields. Eight bacteria were analyzed for ACC deaminase activity, where highest ACC deaminase activity was found in Pseudomonas sp. CKB55 (2833 nmol α-ketobütirat.mg-1.h-1) and lowest in Enterobacter sp. CKB17 (418 nmol α-ketobütirat.mg-1.h-1). Then all of isolates were screened for salt stress using NaCl as salt source. The highest nitrogenase activity was determined in Pseudomonas sp. CKB10 (808 nmol ethylene/ mg.h). Pseudomonas sp. CKB52 showed maximum inhibition zone against Erwinia caratovora ECC100, and the zone was 11 mm. It is recommend that ACC deaminase-containing bacteria could be a environment￾friendly and promising potential strategy to promote plant growth, alleviate biotic and abiotic stresses and provide sustainable agriculture, especially for ethylene￾sensitive plants production.

Benzer Tezler

  1. Tarım alanlarından izole edilen pseudomonas SP. türlerinin herbisit degradasyonunun araştırılması ve fosfatlı bileşikleri çözebilen izolatların buğday bitkisinin gelişimine olan etkilerinin incelenmesi

    Investigation of the herbicide degradation of pseudomonas SP. species isolated from agricultural fields and the effects of phosphate solubilizing isolates on growth of wheat plants

    İLKAY İLHAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    GenetikGebze Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MİNE GÜL ŞEKER

  2. Bakteri kaynaklı ekzopolisakkaritlerin viskoziteye etkisinin belirlenmesi

    Determination of the bacterial sourced exopolysaccarides on viscosity

    YEŞİM SERİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEYNEP DİLEK HEPERKAN

  3. Farklı agro-ekolojilerdeki buğday ekim alanlarından izole edilen Fusarium poae ve F. equiseti izolatlarının patojenitesi ve mikotoksin oluşturma kapasitelerinin belirlenmesi

    Determination of pathogenicity and mycotoxin forming capacity of Fusarium poae and F. equisti isolates isolated from wheat culture from Central Anatolia region

    ABDULLAH ESAT ALTINIŞIK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    ZiraatOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BERNA TUNALI

  4. Türkiye'de mısır (Zea mays) ekim alanlarından izole edilen Fusarium verticillioides (=f.moniliforme), Fusarium proliferatum türlerinin bazı moleküler yöntemler ile tanılanması

    Identification of Fusarium verticillioides, Fusarium proliferatum species isolated from maze (Zea mays) cultivation areas in Turkey by some molecular methods

    ŞULE GÜRE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    ZiraatBursa Uludağ Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HİMMET TEZCAN

  5. Buğday ve arpada kök çürüklüğü hastalığına sebep olan fusarium türlerinin morfolojik ve moleküler karakterizasyonu

    Morphological and molecular characterization of fusarium species causing root rot diseases on wheat and barley

    DAMLA ŞEN ONSEKİZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    ZiraatBolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÖKSEL ÖZER