Geri Dön

Microrna dependent control and regulation mechanisms of autophagy in health and disease

Hastalıkta ve saglıkta otofajinin mikrornalar ile kontrolü

  1. Tez No: 420264
  2. Yazar: AYŞE KUMSAL TEKİRDAĞ KOŞAR
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. DEVRİM GÖZÜAÇIK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyomühendislik, Moleküler Tıp, Mühendislik Bilimleri, Bioengineering, Molecular Medicine, Engineering Sciences
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Sabancı Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 180

Özet

Otofaji, hücresel bir hayatta kalma mekanizması olup, hücre içindeki değişik stresler ile aktive olabilmektedir. Otofajinin kontrolden çıkması ise kanser,nörodejeneratif hastalıklar gibi patolojik durumların ortaya çıkmasına yol açmaktadır. Bu bağlamda, otofajinin kontrol edilmesini sağlayan yeni yolakların araştırılmasının önemi büyüktür. MikroRNAlar, protein kodlamayan küçük RNAlar olup, hücresel seviyede genleri kontrol etmektedirler. Gözüaçık laboratuvarınca yürütülen bir tarama sonucunda otofajinin kontrolünde önemli rol olan yeni mikroRNAlar keşfedilmiştir. Bu tez süresince yapılan detaylı analizler ile, stres ile aktive olan otofajiyi MIR376 aile üyelerinden MIR376A'nın ATG4C ve BECN1 genlerini ve bir başka aile üyesi olan MIR181A'nın ise ATG5 genini hedefleyerek kontrol ettikleri gösterilmiştir. Tez çalışması içerisinde bahsedilen mikroRNAların i) otofajiye olan etkilerinin anlaşılması ii) hedeflerinin belirlenmesi ve iii) hedeflerin bir çok in vitro test ile doğrulanması değişik kanser hücre hatlarında yürütülmüştür. Son olarak, MIR376 aile üyesi MIR376B'nin tumor oluşumu ve gelişimindeki rolünün in vitro ve in vivo testler aracılığı ile analizi yapılmıştır. Sonuç olarak, yapılan bu çalışmanın çıktıları: i) Otofajiyi kontrol eden yeni mikroRNAların tanımlanması ii) Bu mikroRNAların otofajiyi kontrolündeki işlevlerinin araştırılması ve iii) Kanser oluşumundaki in vitro ve in vivo rolleri şeklinde özetlenebilir. Elde edilen sonuçlar, otofajinin kontrolü için dinamik bir mekanizma olan mikroRNAların önemini vurgulamakta, hücrenin stresle baş etmesine yardımcı olan otofajinin kontrolünde yeni bir basamak daha ekleyerek bu önemli biyolojik olayın sağlıkta ve hastalık durumunda nasıl düzenlendiğinin anlaşılmasına yardımcı olmaktadır.

Özet (Çeviri)

Autophagy is a cellular survival pathway that can be activated via different stresses and dysregulation of autophagy might result in pathological states. Therefore, discovery of novel pathways regulating autophagy is crucial. miRNAs as non-protein-coding RNAs control cellular levels of genes and an unbiased screen carried out in Gozuacik laboratory revealed novel microRNAs regulating autophagy. During my PhD thesis, regulation of stress-induced autophagy through MIR376 family members and MIR181A were shown to be via targeting crucial autophagy genes: ATG4C, BECN1 and ATG5, respectively. Analysis of these miRNAs in terms their of i) effect on autophagic activity, ii) target prediction and iii) target validation through various in vitro tests in different cancer cell lines were carried out during my PhD. Besides, the role of MIR376B in tumorigenesis has been under investigation to enlighten the role of MIR376B in early stages of cancer formation in vivo. Altogether, the outcomes of my thesis are:1)Introduction of novel autophagy regulating miRNAs 2) Functional characterization of these miRNAs in the control of autophagic responses of cells and 3) Study of the role of autophagy regulating miRNAs in tumorigenesis in vitro and in vivo. Therefore, discovery of miRNA-mediated regulation of autophagy which provides a dynamic mechanism under various stress conditions adds another layer of regulation for critical cell death and survival decisions in health and disease.

Benzer Tezler

  1. Pankreatik β-hücre farklılaşmasında bazı histon deasetilazların rolü

    The role of some histone deacetylases in pancreatic β-cell differentiation

    EDİZ ÇOŞKUN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Biyolojiİstanbul Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SELDA OKTAYOĞLU

  2. Kokain kullanım bozukluğu olan erkek bireylerde periferik kandaki miRNA ekspresyon düzeylerinin araştırılması

    Investigation of miRNA expression levels in peripheral blood of males with cocaine use disorder

    SÜHEYLA AYFER ALKAÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Adli Tıpİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Fen Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SELDA MERCAN

  3. Psoriasisli hastalarda serum mikrorna analizi

    Analysis of serum microrna in patient with psoriasis

    LALE ATEŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    DermatolojiCelal Bayar Üniversitesi

    Dermatoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERAP ÖZTÜRKCAN

  4. Hepatosellüler karsinomada SIP1'in protein etkileşimlerinin ve ifadesini düzenlediği genlerin tanımlanması

    Defining the protein interactions of and regulation of target genes by SIP1 in hepatocellular carcinoma

    PELİN BALÇIK ERÇİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyolojiGebze Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TAMER YAĞCI

  5. Aterosklerozlu hastaların koroner arter plaklarında ve dolaşımlarındaki mikrorna-221/222 ifade düzeylerinin incelenmesi

    Evaluation of microrna-221/222 expression levels in patients with coronary artery in atherosclerotic plaque and circulation

    ASLIHAN ESRA BİLDİRİCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Tıbbi BiyolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SERDAL ARSLAN