Geri Dön

İzmir Körfezi'nden izole edilen Salmonella türlerinin tanılanması ve antibiyotik dirençliliklerinin belirlenmesi

Identification and determination of antibiotic resistance of Salmonella species isolated from İzmir Gulf

  1. Tez No: 420543
  2. Yazar: BERİL ARKAN DEMİRCAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. İHSAN YAŞA
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Salmonella, çoklu ilaç direnci, Sınıf 1 integronu, plasmid, İzmir körfezi, Salmonella, multiple drug resistance, Class 1 integron, plasmid, Gulf of Izmir
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 104

Özet

Bu çalışmada, İzmir Körfezi'nin kıyısal alanlarından ve kent merkezinde körfezin iç ve orta körfez olarak adlandırılan bölümlerine dökülen dere havzalarından olmak üzere toplam 75 farklı yerden alınan deniz suyu örneklerinde Salmonella sp. varlığı, ISO 6340:1995 standardı kullanılarak araştırılmıştır. API 20E testleri sonucunda 75 farklı örneğin 4 tanesi (%5.3 ü) Salmonella sp. olarak tespit edilmiştir. İzolasyonlar sonrası Kirby-Bauer Disk Difüzyon yöntemine göre antibiyotik dirençlilik testleri gerçekleştirilmiştir. Suşların tamamının en az 5 ya da daha fazla antibiyotiğe karşı dirençli olduğu belirlenmiştir. Antibiyotiğe direnç gösteren Salmonella suşlarının kromozomal ve plazmid DNA'larında, moleküler yöntemler kullanılarak, korunmuş bölge, Sınıf 1 integron analizleri (CS ve int genleri) ve 9 adet antibiyotik (Sulfonamid, ampisilin, aminoglikozid 1-2, trimetoprim, tetrasiklin, florfenikol, ofloksasin ve gentamisin) direnç geni analizleri yapılmıştır. Suşlarımızın bu çalışmada denenen antibiyotiklerden 6 tanesine karşı (tetrasiklin, sulfanomid, aminoglikozid, kloramfenikol, ofloksasin ve gentamisin) dirençli olduğu ve bu direncin hem kromozomal hem de plazmid kaynaklı olduğu tespit edilmiştir. 4 suşun en yüksek dirençlilik gösterdiği antibiyotik grupları sırasıyla aminoglikozid, kloramfenikol, sulfanomid ve ofloksasin olarak belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT ARKAN DEMİRCAN, Beril MSc in Biotechnology. Supervisor: Prof. Dr. İhsan Yaşa February 2016, 84 pages In this study, a total of 75 sea water samples obtained from different places of coastal areas of the Gulf of Izmir and river basins which flow into the called as inner and middle areas of the gulf were analyzed for presence of Salmonella sp. by using the ISO 6340:1995 standard. As a result of API 20E test, 4 of the (5.3%) 75 different samples were identified as Salmonella sp. After the isolations, antibiotic resistance tests were perfomed according to the Kirby-Bauer disk diffusion method. All strains were determined that resistant to at least 5 or more antibiotics. By using moleculer methods in chromosomal and plasmid DNA of antibiotic resistance strains of Salmonella, conserved sequences, Class 1 integron analysis (CS and int genes) and 9 antibiotic resistance genes (Sulfonamide, ampicillin, aminoglycosides 1-2, trimethoprim, tetracycline, florfenicol, ofloxacin and gentamicin) were analyzed. Our strains were determined resistant to 6 of the examined antibiotics (tetracycline, sulphonamide, aminoglycosides, chloramphenicol, ofloxacin and gentamicin) in this study and these resistance originate both chromosomal and plasmid. Antibiotic groups, which have the most resistance of 4 strains, were determined as respectively, aminoglycosides, chloramphenicol, sulphonamide and ofloxacin.

Benzer Tezler

  1. Denizel çevrelerden izole edilen Vibrio izolatlarından poli-beta-hidroksibütirat üretimi

    Production of poly-beta-hydroxybutyrate by Vibrio spp. isolated from marine envirenment

    BURCU BARUTOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyolojiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSMAİL KARABOZ

  2. İzmir körfezinde bazı pelajik balık türlerinde mikroplastik alımının incelenmesi

    Investigation of microplastic uptake by some pelagic fish species in the İzmir bay

    SEDA KIRKAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Su ÜrünleriEge Üniversitesi

    Çevre Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ASLI BAŞARAN

  3. Türkiye denizlerinde bulunan mazak kırlangıcı Trigloporus lastoviza (Bonnaterre, 1788) populasyonlarının genetik analizi

    Genetic analyses of streaked gurnard Trigloporus lastoviza (Bonnaterre, 1788) populations in Turkish marine waters

    MEHMET NUR GÜNDÜZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Su Ürünleriİskenderun Teknik Üniversitesi

    Su Ürünleri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MEVLÜT GÜRLEK

  4. Türkiye Ege ve Akdeniz sahilleri mürekkepbalığı (Sepia officinalis L. 1758) populasyonları: Genetik yapısı ve dinamiklerinin incelenmesi

    Cuttlefish (Sepia officinalis L., 1758) populations along turkish coast lines of the Aegean and Mediterranean seas: Genetic structure and population dynamics

    OLGAÇ GÜVEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Deniz BilimleriAkdeniz Üniversitesi

    Su Ürünleri Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BERİA FALAKALI MUTAF

  5. Secondary metabolites from marine derived actinobacteria and their bioactivities

    Denizel kaynaklı aktinobakterilerin sekonder metabolitleri ve bunların biyoaktiviteleri

    ÖZGE CAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Biyolojiİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDAL BEDİR