Cevizde (Juglans regia L.) DNA markörleri ile genetik haritalama

Genetic linkage mapping in walnut (Juglans regia L.) by DNA markers

PDF İndir

Tez No: 431030
Yazar: YILDIZ DOĞAN
Danışmanlar: PROF. DR. SALİH KAFKAS
Tez Türü: Doktora
Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
Yıl: 2016
Dil: Türkçe
Üniversite: Çukurova Üniversitesi
Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
Ana Bilim Dalı: Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
Sayfa Sayısı: 178

Özet

Bu çalışmada cevizde moleküler ıslaha geçişte temel oluşturacak ilk yoğun genetik bağlantı haritasının oluşturulması amaçlanmıştır. Maraş-12 ve Kaplan-86 ceviz çeşitlerinin melezlenmesi sonucu elde edilen F1 bireylerde genetik haritalama double pseudo-testcross tekniği uygulanarak gerçekleştirilmiştir. Genetik haritalama çalışmasında AFLP, SRAP ve SSR yöntemleri kullanılmış olup sırasıyla 360, 240 ve 319 primer çifti taranmıştır. Bu primer kombinasyonlarından 45 AFLP, 40 SRAP ve 122 SSR primer çifti haritalamada kullanılmıştır. AFLP analizlerinden 452, SRAP analizlerinde 383, SSR analizlerinde 129 markör açılım göstermiştir. Açılım gösteren markörlerden 379 AFLP, 294 SRAP ve 96 SSR haritalanmıştır. Primer çifti başına düşen haritalanan markör sayısı sırasıyla 8.42 (AFLP), 7.35 (SRAP), 0.79 (SSR) olarak belirlenmiştir. Maraş-12 çeşidi genetik haritası 492 markör (68 SSR, 191 SRAP, 233 AFLP) içermiş ve 1407 cM uzunluğa sahip olmuştur. Kaplan-86 çeşidi genetik haritasında ise 461 markör (57 SSR, 191 SRAP, 213 AFLP) yer almış ve 1426 cM uzunluğa sahip olmuştur. Markör yoğunluğu Maraş-12 genetik haritasında 2.86 iken, Kaplan-86 çeşidi genetik haritasında ise 3.09 olmuştur. Elde edilen bulgular sonucunda cevizde yoğun genetik haritalar elde edilmiştir.

Özet (Çeviri)

This study was carried out to construct the most dense genetic linkage map of walnut for future molecular breeding studies. An F1 population created by crossing Maraş-12 and Kaplan-86 walnut cultivars was used, and the 'double pseudo-testcross' mapping strategy was applied to construct the parental genetic linkage maps. AFLP, SRAP and SSR techniques were used in the analysis, and 360, 240 and 319 primer pairs were firstly screened, respectively. The 45 AFLP, 40 SRAP, 122 SSR markers were used in the analysis of F1 population, and the segregated 452 AFLP, 383 SRAP, and 129 SSR markers were scored. Of them, 379 AFLP, 294 SRAP, and 96 SSR markers were mapped. The number of mapped markers per primer pair was 8.42 in AFLP, 7.35 in SRAP, and was 0.79 in SSR. Maras-12 cultivar genetic map had 492 markers (68 SSRs, 191 SRAPs, 233 AFLPs) with 1407 cM total length, while Kaplan-86 genetic map had 461 markers (57 SSRs, 191 SRAPs, 213 AFLPs) with 1426 cM total map length. Marker density was 2.86 in Maraş-12 maternal map, while it was 3.09 in Kaplan-86 paternal map. In conclusion, the most dense genetic linkage maps were constructed in this study for walnut.

Benzer Tezler

Tez No
478722
Chandler ceviz çeşidi DNA dizilerini kullanarak polimorfik mikrosatellit markörlerin geliştirilmesi
Development of polymorphic microsatellites markers using DNA sequences of chandler walnut cultivar
EMRE ESER
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Ziraat Çukurova Üniversitesi
Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SALİH KAFKAS
Tez No
846657
Chandler x kaplan-86 F1 ceviz populasyonunda QTL-seqharitalama yöntemi kullanılarak hasat tarihi ile bağlantılıDNA markörlerinin geliştirilmesi
Development of DNA markers associated with harvest date using QTL-seq method in chandler x kaplan-86 F1 walnut population
MURAT KAZAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Biyoteknoloji Çukurova Üniversitesi
Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SALİH KAFKAS
Tez No
577802
Cevizde (Juglans regia L.) bazı fenolojik özelliklerle bağlantılı DNA markörlerinin ilişki haritalama yöntemi ile belirlenmesi
Determination of dna markers linked to some phenological traits with association mapping method in walnut (Juglans regia l.)
ŞAKİR BURAK BÜKÜCÜ
Doktora
Türkçe
2019
Ziraat Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET SÜTYEMEZ
Tez No
728084
Malatya ili meyve ağaçlarında şerbetçi otu cücelik ve şeftali latent mozaik viroidlerinin araştırılması ve tespit edilen izolatların moleküler karakterizasyonu
Investigation of hop stunt and peach latent mosaic viroids in fruit trees in Malatya province and the molecular characterization of the identified isolates
FEYZA TUNCEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Ziraat Malatya Turgut Özal Üniversitesi
Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HİKMET MURAT SİPAHİOĞLU
Tez No
740699
Ceviz (juglans regia l.) için mikrosatellit (ssr)primerlerin geliştirilmesi
Development of microsatellite (ssr) markers inwalnut (j.regia l.)
HAYAT TOPÇU
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Biyoteknoloji Çukurova Üniversitesi
Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SALİH KAFKAS

Geri Dön