Topraktan izole edilen Bacillus türlerinin biyokalsifikasyon özelliklerinin belirlenmesi
Determination of biocalcification features of Bacillus species isolated from soil
- Tez No: 432317
- Danışmanlar: DOÇ. DR. FATMA ÖZTÜRK KÜP
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 112
Özet
Çalışmada üreaz aktivitesine sahip Bacillus türlerinin topraktan izolasyonu, morfolojik ve moleküler tanımlanmaları ve kireç biriktirme (biyokalsifikasyon) özelliklerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. İnşaat alanlarından alınan toprak ve çimento örneklerinden Bacillus ve Staphylococcus türlerine ait toplam 14 bakteri izole edilmiştir. İzolatların tanımlanması 16S rRNA dizi analizi ile yapılmıştır. Yapılan tanımlama sonucuna göre 3 izolatın Staphylococcus pasteuri, 11 izolatın ise Bacillus cinsine ait olduğu belirlenmiştir. İzolatların üreaz aktiviteleri fenol-hipoklorid metoduna göre gerçekleştirilmiştir. CaCO3 birikimi katı ve sıvı besiyerinde belirlenmiştir. CaCO3 kristalleri taramalı elektron mikroskobu (SEM) ile incelenmiştir. Bacillus ve Stahyplococcus türlerine ait izolatların üreaz enzim aktiviteleri kontrol grubu Sporosarcina pasteurii karşılaştırlmıştır. Karşılaştırma sonucunda F1, F2 ve F3 olarak kodlanan Staphylococcus pasteuri türlerinin spesifik üreaz aktivitesi sırasıyla 9,2848 ±0,00, 9,0933±0,00 ve 9,0859 U/mg olarak tespit edilmiştir. Bacillus cinsine ait olan türler arasında en yüksek aktiviteye sahip olan tür 8,50999±0,00 U/mg değeri ile F10 (Bacillus mycoides) izolatı olarak belirlenmiştir. Bacillus türleri içerisinde en düşük spesifik aktiviteye sahip olan bakterinin ise 2,7510±0,04 U/mg değeri ile F14 (Bacillus thuringiensis) izolatı olduğu tespit edilmiştir. Taramalı elektron mikroskobu (SEM) görüntüleri sonucunda izolatların kalsit birikimi gerçekleştirdiği gözlemlenmiştir
Özet (Çeviri)
This study aimed to determine isolation of Bacillus species having urease activity from soil, morphological and molecular identification and on lime deposition (biocalcification) features. Total 14 bacteria belong to Bacillus and Staphylococcus species were isolated samples of soil and cement from construction sites. Identification of the isolates was carried out with 16S rRNA sequencing analysis. According to the identification results were identified as 3 strains Staphylococcus pasteuri and 11 strains belong to the genus Bacillus. Urease activity of the isolates was carried out according to the phenol-hypochlorite method. CaCO3 accumulation was determined in solid and liquid media. CaCO3 crystals were analyzed in the scanning electron microscope (SEM). Urease enzyme activity of the isolates were compared to with control group Sporosarcina pasteurii. According to results, specific urease activity of F1, F2 and F3 were detected as 9,2848±0,00, 9,0933±0,00 ve 9,0859±0,04 U/mg respectively. F10 (Bacillus mycoides) was determined as species having the highest activity among the species belonging to the genus Bacillus with specific urease activity 8,50999±0,00 U/mg. The bacterium having the lowest specific activity was determined F14 (Bacillus thuringiensis) with specific urease activity 2,7510±0,04 U/mg value. Result images of scanning electron microscope (SEM) was observed that the accumulation calcite of isolates.
Benzer Tezler
- Rize ili topraklarından izole edilen Bacillus türlerinin bakteriyosin içeriklerinin, aktarılabilir antibiyotik ve ağır metal dirençlerinin belirlenmesi
Bacteriocin contents of Bacillus isolated from soil of Rize province, determination of transferable antibiotic and heavy-metal resistance
ŞEYMA ŞENSOY KARAOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyolojiRecep Tayyip Erdoğan ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ELİF SEVİM
- Topraktan izole edilen Bacillus megaterium EBD 9-1 suşundan fitaz geninin E.coli'de klonlanma çalışmaları
Cloning studies in E. coli of phytase gene from Bacillus megaterium EBD 9-1 strain isolated from soil
BEHİCE ZEREN
- Bazı yem bitkilerinin toprak mikroflorasına etkisi, topraktan izole edilen Bacillus türlerinin bazı özelliklerinin belirlenmesi
Effect of some feed plants on soil microflora and determination of some features of Bacillus species isolated from soil
FADİME TOPÇAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN DIĞRAK
- Balıklarda probiyotik olarak kullanılabilecek bakterilerin toprak solucanından izolasyonu ve enzim üreten bakterilerin kısmi karakterizasyonu
Isolation and partial characterization of enzyme producing bacteria from earthworm for potential use as probiotics in fish
BERİTAN BATUR
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyoteknolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ FATMAGÜN AYDIN
- Isolation of bacillus thuringiensis and investigation of crystal protein genes
Bacillus thuringiensis izolasyonu ve kristal protein genlerinin araştırılması
FATOŞ TUBA ÇETİNKAYA
Yüksek Lisans
İngilizce
2002
Biyoteknolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. HATİCE GÜNEŞ
PROF.DR. ŞEBNEM HARSA
Y.DOÇ.DR. ALİ FAZIL YENİDÜNYA