Bazı yazlık ekmeklik buğday çeşitlerinde genetik farklılığın ssr markörleriyle belirlenmesi
Determination of genetic diversity of summer bread wheat varieties using ssr markers
- Tez No: 433089
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MEHMET ALP FURAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 72
Özet
Tahıllar içerisinde buğday, ilk çağlardan beri kültürü yapılan ve stratejik önemi yüksek olan besin kaynağıdır. Dünya nüfusunun yaklaşık %35'inin temel besin kaynağı olarak da buğday kullanılmaktadır. Dünya'da nüfusun artmasıyla birlikte birim alandan alınan verimi arttırma ihtiyacı doğmuştur. Buğdayda birim alandan alınan verimi arttırmak çeşitli ıslah yöntemleri ile mümkün olabilir. Gen kaynaklarının genetik benzerlik-farklılıklarının bilinmesi bitki ıslahı açısından oldukça önemlidir. Bitkilerin genetik yapılarının tanımlanmasında protein markörleri, morfolojik markörler ve DNA markörleri kullanılmaktadır. Son yıllarda buğdayda yapılan çalışmalarda moleküler markör yöntemleri sıklıkla tercih edilmektedir. Bu çalışmada, Türkiye'nin farklı bölgelerinden toplanan 23 adet yerel ekmeklik buğday çeşidi arasındaki farklılığın moleküler analizler ile belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla 103 SSR (mikrosatelit) primeri denenmiş bunlar arasından ayırt edilir bant veren 32 si seçilerek kullanılmıştır. 32 adet SSR primeri kullanılmıştır. 23 adet ekmeklik buğday çeşidinin DNA'ları izole edilmiş.ve Polimeraz Zincir.Reaksiyonu.(PZR).işlemiyle mikrosatelit belirleyicileri kullanılarak spesifik DNA bölgelerinin çoğaltılması sağlanmıştır. Reaksiyon sonucu elde edilen PZR ürünleri kapiler jel elektroforezinde görüntülenmiştir. DNA fragmentlerinin değerlendirilmesi, PCR ürünlerinden elde edilen bantların baz uzunluklarının belirlenmesi işlemi Qiaxcell Screengel yazılımı ile elde edilmiştir. Var olan bantların allel bölgelerine göre binomial veriler bantların baz uzunluklarından elde edilmiştir. Sonuçlara göre 179 allel, 5 polimorfik bant elde edilmiştir. NTSYS-pc istatistik paket programı aracılığıyla genotiplere ait dendrogram oluşturulmuştur. Elde.edilen dendograma göre çalışmada kullanılan ekmeklik buğday çeşitleri 2 ana gruba ayrılırken, bu ana gruplar da kendi aralarında alt gruplara ayrılmıştır. Matriks değerleri hesaplanarak çeşitler arasındaki farklılık değerlendirildiğinde, genetik olarak birbirine en yakın akraba çeşitler GAP Uluslararası Tarımsal Araştırma ve Eğitim Merkezinden ıslah edilen Nurkent çeşidi ile Çukurova Tarımsal Araştırma Enstitüsünden ıslah edilen Yüreğir89 olarak belirlenmiştir. Sonuçlar, SSR primerlerinin ekmeklik buğdayda genetik farklılığın belirlenmesinde kullanılabileceğini göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Wheat in grain, is a food source with high strategic importance and it has been cultured since ancient times. Wheat is used for food source of approximately %35 in the world populations. With the increase of population in the world, it was necessary to increase the yield per unit area. Increasing yield per unit area of wheat, can be possible by various breeding methods. Knowing the genetic similarities - differences of plant genetic resources is very important for breeding. Morphological, protein and DNA markers have been used to characterize plant genomes. In recent years, molecular marker methods are often preferred in wheats. This study, aimed to determine the differences among 23 local bread wheat varities collected from the various part of Turkey by molecular analysis. For this purpose, 103 SSR primers (microsatellite) were tested and 32 primers have been selected. DNA of 23 bread wheats were isolated and specific DNA regions were amplified by PCR using each microsatellit markers. PCR products were illustrated in capillary gel electrophoresis. Evaluation of DNA fragments, an operation of determining the base length of the tape obtained from the PCR product obtained with the software Qiaxcell Screengel. Binomial data were obtained from the band according to the base length of alleles of existing tape. According to the results, 179 alleles and 5 polymorphic bands were obtained. Dendogram of genotypes were obtained via statistical NTSYS-pc software package. According to the dendogram, bread wheats were grouped into two main sections, and these main sections were separated into several sub-groups. Based on matrix values, the most similar genotypes of varieties were Nurkent, improved from GAP International Agricultural Research Institute, and Yüregir89, improved from Çukurova Agricultural Research Institute. These results indicate that SSR markers could be used in genetic diversity of bread wheat.
Benzer Tezler
- Anaç olarak kullanılabilecek bazı ekmeklik buğday çeşit ve hatlarının bazı özelliklerinde genetik varyasyonun saptanması
An assessment on genetic variation in some of agronomic characteristics of bread wheat crossing block
EMİNE DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
ZiraatHarran ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ABDULLAH ÖKTEM
PROF.DR. AYHAN ATLI
Y.DOÇ.DR. İRFAN ÖZBERK
- Bazı yazlık yerel ve tescilli ekmeklik buğday çeşitlerinde azotlu gübrelemenin verim ve verim özellikleri üzerine etkileri
The effects of nitrogen fertilization on yield and yield properties of some summer local and registered bread wheat cultivars
ALAATTİN GELİŞKEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ZiraatVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ FEVZİ ALTUNER
- Buğdayda (Triticum aestivum L.) in vitro androgenesi̇s ve somati̇k embri̇yogenesi̇s
In vitro androgenesis and somatic embryogenesis in wheat (Triticum aestivum L.)
AHMAD RATIB SHARAFAT
Doktora
Türkçe
2024
BiyoteknolojiAkdeniz ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ESİN ARI
- Kuru koşullarda bazı ekmeklik buğday (Triticum aestivum L.) çeşitlerinde farklı ön bitkilerin verim ve kalite özellikleri üzerine etkisi
The effect of different previous crops on yield and quality parameters of some bread wheat (Triticum aestivum L.) cultivars in dry conditions
ALAETTİN KEÇELİ
Doktora
Türkçe
2012
ZiraatAnkara ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SAİME ÜNVER İKİNCİKARAKAYA
- Determination of Fusarium species associated with crown rot of wheat in Turkey and assessment of resistance status of some wheat genotypes to Fusarium culmorum
Türkiye'de buğdayda kök boğazı çürüklüğü ile ilişkili Fusarium türlerinin tespiti ve bazı buğday genotiplerinin Fusarium culmorum'a dayanıklılık durumlarının belirlenmesi
ELFINESH SHIKUR GEBREMARIAM
