Geri Dön

Detailed analysis of voxel based morphometry

Voksel bazlı morfometrinin detaylı analizi

  1. Tez No: 436575
  2. Yazar: ÖZLEM ÖZMEN OKUR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. CENGİZHAN ÖZTÜRK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mühendislik Bilimleri, Engineering Sciences
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
  10. Enstitü: Biyo-Medikal Mühendislik Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 115

Özet

Voksel Tabanlı Morfometri, VTM, farklı insan gruplarının beyin MR imgeleri arasındaki yapısal değişikliği ortaya çıkarmaya çalışan ve en çok kullanılan beyin mor- fometri metodlarından biridir. VTM'de beyin imgeleri bir bütün olarak ve tamamen otomatik yöntemlerle işlenir. VTM analizi, imgelerin ortak bir şablona kaydedilmesi, bu imgelerin doku gruplarına ayrılması (gri madde, ak madde ve beyin-omurilik sıvısı), seçmeli modülasyon (dokuların, ortak şablona kaydedilmesi sırasında değişen hacimlerinin, özgün hacimlerine döndürülmeleri), yumuşatma (verilerin dağılımının normalleşebilmesi ve imgelerin doğrusal olmayan şekilde kaydedilmesinden kaynaklı hataların azaltılması) ve voksel bazında istatistiki hesaplamalar gibi aşamalardan oluşmaktadır. Birçok çalışmada gösterildiği gibi, bu aşamalarda ya da bu aşamaların parametrelerinde yapılan değişiklikler, VBM analizi sonuçlarını da değiştirebilmektedir. VBM analizinin nasıl yapılacağına dair bazı kısa kılavuzlar olsa da, bu tez, VBM'in ana aşamalarını kısaca açıklayıp, bu aşamalarla ilgili literatürde çıkmış tartışmaları bir araya getirerek, VBM kullanıcılarını, VBM'in yanlış sonuçlara götürebilecek özellikleri konusunda uyarmaya çalışmaktadır. Aynı zamanda, diğer morfometri metodlarına da kısaca değinerek, VBM'in bu alanda nerede durduğuna ilişkin bir fikir verilmeye çalışılmaktadır. Bu tezde, özellikle, modülasyon ve istatistik aşamasında maskeleme stratejisi konusu araştırılmıştır ve modülasyonun kullanılmamasının ve istatistiki hesaplamalarda, ortalama imgeye bağlı maskeleme kullanılmasının, VBM'in fark bulma yeteneğini yükselttiği gösterilmiştir. Ayrıca, bu tez kapsamında, VBM ile; matematikçiler, SSPE hastaları ve çözücü kullanıcıları ile normal denekler arasında olmak üzere, üç farklı klinik çalışma yapılmıştır.

Özet (Çeviri)

Voxel Based Morphometry, VBM, is one of the most widely used brain morphometry methods which aims to reveal the structural differences between the brain MR images of different populations. It is a whole brain and fully automatic approach in which all the images are registered onto a common template and then segmented into grey matter, white matter and cerebrospinal fluid. After an optional modulation step (regaining the original volume which is shrinked or enlarged during the registration), smoothing takes place in order to make the data more normally distributed and to diminish the inexact nature of the nonlinear registration. Finally, voxel-wise statistical operations are performed between the groups of the images. As revealed in several studies, changes in these steps and changes in their parameters might influence the resulting statistics. Although some short guidelines exist for conducting the processing stages, this thesis tries to explain each main step and gathers the discussions in the literature to make the VBM users aware of some pitfalls and limitations of VBM; and also gives brief descriptions about the other brain morphometry methods to give a view for where VBM stands at. In this thesis, the effect of modulation and masking strategy at the statistical stage were studied and concluded that not using the modulation and using average-based masking for the statistical part increased the detection power of VBM. Additionally, within the scope of this thesis, three clinical applications of VBM are performed and presented: Comparisons of the brain images of mathematicians, SSPE patients, and solvent abusers vs healthy controls.

Benzer Tezler

  1. İlk atak psikoz olgularında, kişinin birinci ve ikinci derece akrabalarındaki psikotik bozukluk hastalık öyküsünün beyin yapısına olan etkisinin araştırılması

    The effect of psychotic spectrum disorder family history on brain structure in patients with first episode psychosis

    MEHMET CAN ERATA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    PsikiyatriSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Çocuk Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜL KARAÇETİN

  2. Object-aware interactive perception

    Nesne farkındalıklı etkileşimli algılama

    ÇAĞATAY KOÇ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SANEM SARIEL UZER

    PROF. DR. SİNAN KALKAN

  3. Contractility analysis of left ventricular myocardium using phase contrast magnetic resonance images

    Sol karıncık kas hareketlerinin faz kontrast manyetik rezonans görüntüleriyle analizi

    ÖZLEM ÖZMEN OKUR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2004

    Tıbbi BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CENGİZHAN ÖZTÜRK

  4. A government phonology analysis of Turkish consonants

    Türkçe'deki sessiz harflerin bir yönetimsel sesbilim incelemesi

    ERCAN BALCI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2006

    DilbilimBoğaziçi Üniversitesi

    Dilbilim Ana Bilim Dalı

    DR. ANN DENWOOD

  5. Türkçe yazım denetleyen editör

    Turkish spelling checker editor

    K.MESUT YARIMBIYIKLI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1992

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik Üniversitesi

    DOÇ. DR. TAKUHİ NADİA ERDOĞAN