Expression analysis of transcription factors Elk-1 and Pea3
Elk-1 ve Pea3 transkripsiyon faktörlerinin ekspresyon analizleri
- Tez No: 438672
- Danışmanlar: PROF. DR. IŞIL KURNAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 73
Özet
Transkripsiyon faktörleri, DNA dizilerinin promotör ya da artırıcı bölgelerine bağlanarak gen anlatımını düzenleyen proteinlerdir. Bu düzenlemeyi tek başlarına ya da diğer proteinlerle kompleks oluşturarak gen anlatımını artırır ya da baskılarlar. Bu proteinler hücre büyümesinde, çoğalmasında ve apoptozda anahtar rol oynarlar. Elk-1, ETS ailesine üye olan bir transkripsiyon faktörü olup MAPK yolağı tarafından aktive edilen ve nöronal sağ kalım ve farklılaşmayı sağlayan c-fos gibi genleri düzenler. Pea3 transkripsiyon faktörü ise ETS domain ailesinin üyelerinden biri olan ve diğer üyeler gibi hücre çoğalması, farklılaşması, gelişmesi ve ölümünü içeren sinyal transdüksiyon yolağının nükleer hedefi olarak görev yapar. Düzenleyici olayların birçoğu ETS domain proteinlerinin MAPK yolağındaki fosforlanma olaylarını kapsar. Bu çalışmada, Elk-1 ve Pea3 transkripsiyon faktörlerinin fonksiyon ve gen anlatımlarını farklı yönlerden analiz etmeye çalıştık. Çalışmanın ilk aşamasında, farklı hücre hatlarında Elk-1 transkripsiyon faktörünün açık okuma penceresinde alternatif kırpılma formlarını tanımlamayı amaçlamış olup, ikinci kısmında ise, ileriki fosforilasyon analizlerinde kullanılmak üzere doğal ve mutant GST-Pea3 füzyon proteinlerinin anlatımlarını optimize ettik.
Özet (Çeviri)
Transcription factors are the proteins that regulate the gene expression via binding to the promoter or enhancer regions of DNA sequences. They perform this function alone or with other proteins in a complex, by promoting or suppressing expression. These proteins have a key role in regulation of cell growth, cell proliferation and apoptosis. Elk-1 is a member of ETS- domain transcription factor, which is activated by MAPK pathway and regulates immediately early genes such as c-fos gene, which provides neuronal survival and proliferation. Pea3 transcription factor family belongs to ETS domain transcription factor superfamily and acts as nuclear targets of signal-transduction pathways, including cell proliferation, differentiation, development and apoptosis like, the other members of ETS super-family. A wide variety of the regulatory events that involve ETS domain proteins require MAPK pathways in order to mediate the phosphorylation processes. In this study, we tried to analyze expression and function of two different transcription factors, namely Elk-1 and Pea3 from different aspects. In the first part of the study, we aimed to identify the alternative splicing forms in open reading frame of transcription factor Elk-1 in different cell lines. In the second part of the study, the purpose was to optimize expression of wildtype and mutant GST-Pea3 fusion proteins for further phosphorylation analyses.
Benzer Tezler
- Promoter elements analysis of katanin p80 gene
Katanin p80 geninin promotor elementlerinin analizi
GÜHER IŞIK CESUR
Yüksek Lisans
İngilizce
2009
Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ARZU KARABAY KORKMAZ
- Molecular and computational investigation of intrafamilial transcriptional regulatory network of ETS family transcription factors
ETS ailesi transkripsiyon faktörlerinin aile-içi transkripsiyonel regülasyon ağının moleküler ve hesaplamalı incelemesi
YİĞİT KORAY BABAL
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. IŞIL KURNAZ
- The interaction of Elk-1 with kinesin motor protein in neurons
Elk-1'in kinesin motor proteini ile nöronlarda etkileşimi
BETÜL ERTURAL
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. IŞIL KURNAZ
- Analysis of neuroprotection-related gene expression changes by Elk-1 activity under hypoxic conditions
Hipoksik koşullar altında Elk-1 aktivitesine bağlı nörokorunmaya yönelik gen ifadesi değişimlerinin analizi
ERAY ŞAHİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
BiyomühendislikYeditepe ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BAYRAM YILMAZ
PROF. DR. IŞIL KURNAZ
- Cl-387,785'in malignant mezotelyoma hücrelerinde anti-karsinojenik özelliklerinin incelenmesi
Başlık çevirisi yok
FATMA SAĞIR
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyolojiGebze Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ASUMAN DEMİROĞLU ZERGEROĞLU