Kolorektal kanserlerde metastazı kontrol eden post-genomik süreçler
Post-genomic processes that control colorectal cancer metastasis
- Tez No: 440204
- Danışmanlar: DOÇ. DR. YASEMİN BASKIN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Onkoloji, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Onkoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 161
Özet
Kanserin oluşumu ve metastatik fenotip kazanarak ilerlemesi, sadece genetik mutasyonların oluşumuna bağlı olmayan kompleks bir süreçtir. Peritoneal sıvı akışları, sıvı gerilimleri, mikroçevrenin asiditesi veya aşırı proliferasyon gösteren tümör kitlesinin etkisiyle değişen anormal intertisyel sıvı paternleri gibi tümör mikroçevresinin fiziksel özellikleri, kanser hücresinin proliferasyonu, immün sistemden kaçışı, epitelyal-mezenşimal transisyon ve metastaz gibi patofizyolojik fonksiyonları etkilemektedir. Tümör mikroçevresinin fiziksel parametreleri ile değişiklik gösteren fenotipik değişiklikler mikrofluidik sistemler ile hedeflenebilmektedir. Bu araştırmanın amacı, mikrofludik kültür teknikleri kullanarak vücuttaki sürekli sıvı akışının ve sıvı geriliminin kolorektal kanserin metastatik davranışı üzerine olan etkisini post-genomik düzeyde anlamaktır. Çalışmada, sürekli sıvı akışına maruz kalan kolorektal kanser hücreleri (HCT-116 ve HT-29) üzerinde E-kaderin, N-kaderin ve vimentin belirteçlerine ait boyamalar ile epitelyal ve mezenşimal fenotipler karakterize edildi. Sürekli sıvı akışının etkisiyle istatistiksel olarak anlamlılık göstren transkriptom ve miRNA analiz sonuçları ile hedef molekül ve yolak analizleri gerçekleştirildi. Sürekli sıvı akışına maruz kalan kolorektal kanser hücrelerinde, E-kaderin ekpresyonundaki azalma, N-kaderin ve vimentin ekpresyonundaki artış (p 0.05) ile EMT-benzeri fenotip gösterildi. Sürekli sıvı akışının ve sıvı gerilimin etkisiyle değişim gösteren miRNA ve mRNA ekspresyon profilleriyle gerçekleştirilen gen ontolojianalizlerinde, anjiyogenez, apoptoz ve antijen sunumu proseslerinin EMT ile indüklenen metastazı destekleyecek şekilde değiştiği saptandı. Sürekli sıvı akımıyla dinamizm kazanan mikroçevre, epitelyal-mezenşimal transisyon, anjiyogenez, apoptozun düzenlenmesi ve antijen sunumu gibi kanserin ilerlemesini sağlayan fonksiyonları etkilemektedir. Hücrenin biyolojik süreçlerine etki ederek terapötik sonuçları da etkileyebilme yetisi olan intertisyel sıvı akışı ve sıvı gerilimin her kanser tipine bağlı olarak sebep olduğu değişiklikler ve bunlara at moleküler mekanizmalarının açığa çıkarılması ile potansiyel terapötik hedeflerin oluşması söz konusudur.
Özet (Çeviri)
The formation and progression of cancer with a metastatic phenotype, have a complex matter, which is not simply based upon genetic mutations. Dynamic physical conditions, such as peritoneal fluid flow, shear forces, asidity of microenvironent or aberrant interstitial fluid flow patterns driven by un-controlled tumor bulk; impose significant pathophysiologic functions, such as proliferation, immune-escaping, epithelial-mesenchymal transition and metastasis. Hence novel microfluidic strategies can target phenotypic changes driven by physical parameters of tumor microenvironment. The aim of this study, to understand the effect of continuous fluid flow on metastatic behaviour of colorectal cancer cells in terms of post-genomic regulations. First, we characterized the epithelial and mesenchymal phenotypes (with E-cadherin, N-cadherin and Vimentin markers) of colorectal cancer cells (HCT-116 and HT-29) under continuous flow. Target prediction and pathway analysis were further performed to better understand the effect of continuous flow at trancriptome and miRNA level. Cancer cells under flow condition demonstrated EMT-like phenotype, with a statistically significant decrease in E-cadherin and increase in N-cadherin and vimentin expressions. It was observed with mRNA and miRNA expression profiles analysed by bioinformatic analysis; angiogenesis, apoptosis and antigen presentation proceses were altered by the effect of continuous fluid flow and shear stress in support of EMT-induced metastasis. Continuous fluid flow driven dynamic microenvironment, affects main processes of cancer cell such as epithelial-mesenchymal transition, angiogenesis, apoptosis and antigen presentation. Although the effects of interstitial fluid flow, that can effect the biological behaviour of cancer cell and therapeutic results; is not fully understood; determination of interstitial fluid flow driven alterations and mechanisms can be positive therapeutic targets.
Benzer Tezler
- Kolorektal kanserlerde miR520a-3p/b/d-3p/e ve miR302a/b ekspresyon profilinin çıkarılması
Expressi̇on profi̇le of miR520a-3p/b/d-3p/e and miR302a/b i̇n colorectal cancer
ABDULKADİR YASİR BAHAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
PatolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiCerrahi Tıp Bilimleri Bölümü
YRD. DOÇ. DR. HAMİDE SAYAR
- Synthesis of dye-conjugated PD-L1 targeted peptides for use in pet/ct in diagnosis of lung cancer
Akciğer kanseri teşhisi için PET/CT sistemlerinde kullanılacak PD-L1 proteini hedefli boya takılı peptitlerin sentezi
SAADET YEŞİLMEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Biyokimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ONUR ALPTÜRK
DR. ÖZGÜR YILMAZ
- Neoadjuvan tedavi almamış mide adenokarsinomlarında tümör tomurcuklanmasının klinikopatolojik veriler ve hasta yönetimine etki eden immünohistokimyasal belirteçle ile ilişkisinin karşılaştırılması
Comparison of tumor budding in gastric adenocarcinomas not receiving neoadjuvant therapy with clinicopathological data and immunohistochemical markers affecting patient management
GÖZDE İLHAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
PatolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiPatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ARMAĞAN GÜNAL
- Safran ekstratı olan krosetin'in baş-boyun kanser hücreleri üzerindeki etkisinin incelenmesi
Investigation of effect of crocetin extracted from saffron on head and neck cancer cell lines
BİLGE KALYONCU
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
GenetikTurgut Özal ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA GÜNDÜZ
- Kolorektal karsinogeneziste MikroRNA'nın rolü
MicroRNA's role in colorectal carcinoma
FERDA KÖKSAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
GastroenterolojiÇukurova Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HİKMET AKKIZ