Miyeloproliferatif neoplazilerde gen ekspresyon değişimleri
Gene expression changes in myeloproliferative neoplasms
- Tez No: 443998
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. SELÇUK SÖZER TOKDEMİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Miyeloproliferatif Neoplazi (MPN), JAK2, Polisitemia Vera, Kök Hücre, CD133, CD34, Myeloproliferative neoplasms (MPN), JAK2, Polistemia Vera (PV), Stem cell, CD133, CD34
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 96
Özet
Amaç. Miyeloproliferatif Neoplaziler (MPN), BCR-ABL negatif olan, kemik iliğinde bir veya birden fazla kan hücresinin yüksek oranda proliferasyonuna sebep olan klonal kök hücre hastalığıdır. JAK2V617F mutasyonunun varlığı MPN tanı kriterlerinden biridir. Bu çalışmada amaç, MPN'de sık görülen JAK2V617F'in primitif kök hücre kompartmanlarındaki karakterinin belirlenip mutasyonun başladığı ilk hücrelerin CD133 ve CD34 yüzey markerları aracılığıyla immünofenotipini belirlemek, MYC ve F2R genlerinin belirlenen hücre kompartmanlarındaki durumunu tespit etmektir. Yöntem. 11 hasta ve 4 kontrol kordon kanı mononükleer hücrelerinden (MNH), CD133 ve CD34 antikorları kullanarak hücre ayırıcı yardımıyla CD133+CD34-, CD133-CD34+, CD133+CD34+, CD133-CD34- kompartmanları izole edildi. MNH ve izole edilmiş kompartmanların DNA'larında JAK2V617F allel durumunun belirlenmesi amacıyla allel spesifik nested PZR, RNA'larında ise, MYC ve F2R genlerinin anlatım düzeylerinin belirlenmesi amacıyla kantitatif PZR yapıldı. Bulgu. Kök hücre kompartmanları ve MNH'lerinde JAK2V617F karakterinin belirlenmesi için yapılan nested PZR sonucunda MNH'lerinde mutasyon taşıyan hastaların kök hücre kompartmanlarında farklı karakterde mutasyon taşıyabildiği görülmüştür. MNH'lerinde mutasyon taşımayan hastaların ise kök hücre kompartmanlarında mutasyon olmadığı görülmüştür. MNH'ler ve kök hücre kompartmanlarında F2R gen ekspresyon analizi sonucunda primitif özellikte olan CD133+CD34-, CD133-CD34- kompartmanında artmış gen anlatımı görülmektedir. MYC gen ekspresyon analizi sonucunda ise primitif özellikte olan CD133+ CD34- ve CD133+CD34+ kompartmanında artmış gen anlatımı olduğu belirlenmiştir. Sonuç. Kök hücre kompartmanlarında mutasyon karakterinin belirlenmesi ile elde edilen bulgular MPN'in kök hücre kaynaklı olduğunu destekler niteliktedir. Özellikle F2R geninin primitif özellikte olan kök hücre grubunda ekspresyon artışı olduğu tespit edilmiştir. Bu sonuçlar bize MPN 'nin CD34+ den daha primitif hücre grubundan kaynaklandığını ve F2R 'in kanserogenez oluşumunda ve trombotik komplikasyonların gelişmesinde etkili olabileceğini düşündürmektedir.
Özet (Çeviri)
Objective. Myeloproliferative Neoplasm (MPN) is clonal disease which causes proliferation of one or several types of BCR-ABL negative bone marrow cell. The presence of JAK2V617F is one of the criterias of MPN diagnosis. The aim of this study is to determine the presence of JAK2V617F and the expression levels of MYC and F2R genes in primitive stem cells compartments isolated according to CD133 and CD34 cell surface markers. Method. CD133+CD34-, CD133-CD34+, CD133+CD34+, CD133-CD34- compartments of mononulear cells (MNCs) from 4 cord blood and 11 patient samples were obtained with cell sorter using CD133 and CD34 antibodies. MNCs and respective compartments were used for DNA to assess JAK2V617F by allel spesific nested PCR and RNA to the assess the MYC and F2R's expression levels by quantitavie real time PCR. Findings. Nested PCR results indicate that JAK2V617F positive MNC exhibit different genotype characteristics in stem cell compartments. The analysis of F2R gene expression in CD133-CD34- and CD133+ compartments were found to have elevated F2R gene expression. MYC gene expression analyses revealed that this gene was elevated in CD133+ and CD133+CD34+ cells which are primitive stem cell compartments. Result. Characterization of genotypes of stem cell compartments indicate that MPN is originating from primitive stem cells. In particular, expression of F2R was found to be elevated in primitive stem cell compartments. These results are indicating that MPN is originating from primitive stem cells in a developmental stage preceding CD34+ and that F2R may have critical role in carsenogenesis and trombic complication formations.
Benzer Tezler
- JAK2V617F mutasyonunun altın nanoflares kullanılarak tespiti
Detection of JAK2V617F mutation using gold nanoflares
ERHAN APTULLAHOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Biyoteknolojiİstanbul ÜniversitesiGenetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SELÇUK SÖZER TOKDEMİR
- Kronik miyeloid lösemi dışı klasik miyeloproliferatif neoplazilerde aktivasyonla indüklenmiş sitidin deaminazın ekspresyon düzeyinin genetik instabilite ve JAK2V617F mutasyonu ile ilişkisinin araştırılması
Activation induced cytidine deaminase expression level in myeloproliferative neoplasms and relationship between activaton induced cytidine deaminase level and genetic instability, JAK2V617F mutation
HASAN HERMENCİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
Genetikİstanbul Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AKİF SELİM YAVUZ
- Philadelphia negatif klasik kronik myeloproliferatif neoplazilerde JAK2V617F gen mutasyonunun sıklığı ve klinik önemi
Frequency and clinical significance of JAK2V617F gene mutation in philadelphia negative classical chronic myeloproliferative neoplasms
EZGİ ŞAHİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Hematolojiİstanbul Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İPEK YÖNAL HİNDİLERDEN
- Polisitemia vera'da sitokin sinyal yolağının etkisi
Effect of cytokine signaling pathway in polycythemia vera
CEMİL ALTUNAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Genetikİstanbul ÜniversitesiGenetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SELÇUK SÖZER TOKDEMİR
- Esansiyel trombositemi ve primer miyelofibrozis olgularında ASXL1, IDH1, IDH2 gen mutasyonları ve JAK2V617F allel yükü ile klinik seyir arasındaki ilişki
Impact of ASXL1, IDH1, IDH2 mutations and JAK2V617F allele burden in essential thrombocythemia and primary myelofibrosis on clinical course
İPEK YÖNAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
Hematolojiİstanbul Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA DENİZ SARGIN