Türkiye endemiği Thermopsis turcica'da farklı gelişim evrelerindeki çiçeklerin karşılaştırmalı proteomik analizleri
Comparative proteomics analyses of flowers at different development stages in Thermopsis turcica, endemic to Turkey
- Tez No: 446420
- Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA YILDIZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Afyon Kocatepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 63
Özet
Çiçek gelişimi birçok çevresel uyarıcı ve içsel sinyal tarafından kontrol edilen karmaşık bir fizyolojik olaydır. Şimdiye kadar birkaç moleküler çalışma çiçek gelişimi ile ilgili fizyolojik süreçler hakkında önemli bilgiler sağlamış olmasına karşın çiçek gelişimi sırasında meydana gelen proteom değişimleri hakkında çok az bilgi bulunmaktadır. Bu nedenle, bu çalışmada tek bir çiçekte 3-4 serbest karpele sahip sıra dışı legüm türü ve Türkiye endemiği Thermopsis turcica Kit Tan, Vural & Küçüködük bitkilerinde çiçek gelişimi sırasında gerçekleşen proteom değişimleri araştırılmıştır. Çiçek tomurcukları ve tamamen açmış çiçeklerinden protein ekstraksiyonu yapılmış ve iki-yönlü jel elektroforezi (2-DE) ile bu proteinler ayrıştırılmıştır. Görüntü analizleri çiçek gelişimi sırasında 66 protein beneğinin farklı şekilde ifade olduğunu ortaya çıkarmıştır. Bu proteinlerden 32'si MALDI-TOF/TOF (matrix-assisted laser-desorption ionization-time of flight/time of flight) kütle spektrometrisi (MS) ve veri tabanı taraması ile başarılı bir şekilde tanımlanmıştır. Çiçek gelişimi sırasında farklı şekilde ifade olan bu proteinlerin transkripsiyon ve protein metabolizması, enerji ve karbonhidrat metabolizması, bitki savunma sistemi, fotosentez, hücre çeperi, sekonder metabolizma ve amino asit metabolizmasında fonksiyon gördüğü belirlenmiştir. Bununla birlikte, tanımlanan birçok proteinin ifade seviyesinin tamamen açmış çiçeklerde azalan yönde düzenlendiği bulunmuştur. Protein metabolizması, şeker metabolizması ve stres savunması ile ilişkili birçok proteinin çiçek gelişimi sırasında düzenlenmesi bu proteinlerin gelişimsel regülasyondaki muhtemel rollerini göstermektedir. Bu sonuçlar, çiçek gelişimi sırasında meydana gelen proteom değişimleri hakkında yeni bilgiler sağlamıştır.
Özet (Çeviri)
Flower development is a complex physiological phenomenon which is affected by many environmental stimuli and endogenous signals. To date, several molecular approaches have provided a comprehensive view of the physiological processes associated to flower development, but little is known about proteome changes. Therefore, we investigated the proteome alterations during flower development in endemic Thermopsis turcica Kit Tan, Vural & Küçüködük, an unusual legume species with 3-4 free carpels in a single flower. Proteins were extracted from the flower buds and fully opened flowers, and separated by two-dimensional gel electrophoresis (2-DE). Image analysis revealed that 66 protein spots were differentially expressed throughout flower development. Among them, 32 protein spots were successfully identified using MALDI-TOF/TOF (matrix-assisted laser-desorption ionization-time of flight/time of flight) mass spectrometry (MS) and database search. Functional annotation of these flower proteins revealed their involvement in transcription and protein metabolism, energy and carbohydrate metabolism, plant defense, photosynthesis, cell wall, secondary metabolism, and amino acid metabolism. Moreover, most of these proteins were down-regulated at the latter stage of flower development. Regulation of many proteins related to protein metabolism, sugar metabolism and stress defense suggest their possible roles in a developmental manner. These results have given new insights to the proteome alterations during flower development.
Benzer Tezler
- Studies on molecular and genetic characterization of the genes responsible for the multicarpellary gynoecium in Thermopsis turcica
Thermopsis turcica'da çoklu karpel oluşumundan sorumlu olan genlerin moleküler ve genetiksel karakterizasyonu üzerine çalışmalar
DİLEK TEKDAL
Doktora
İngilizce
2015
Bilim ve TeknolojiSabancı ÜniversitesiBiyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET SELİM ÇETİNER
- Türkiye endemiği Thermopsıs turcica'dan APETALA1 ve APETALA2 genlerinin klonlanması ve karakterizasyonu
Cloning and characterization of APETALA1 and APETALA2 genes from turkish endemic thermopsis turcica
ALPEREN DEDEOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA KARGIOĞLU
- Türkiye endemiği Thermopsıs turcica'dan leafy geninin izolasyonu ve karakterizasyonu
Isolation and characterization of leafy gene from thermopsis turcica, endemic to Turkey
BÜŞRA KAHRAMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SÜLEYMAN CENKCİ
- Türkiye endemiği çok karpelli Thermopsis turcica'dan APETALA3 ve PISTILLATA gen homologlarının klonlanması ve karakterizasyonu
Cloning and characterization of APETALA3 and PISTILLATA gene homolog in multi-carpellated Thermopsis turcica a turkish endemic
ALİ KIYAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SÜLEYMAN CENKCİ
- Farklı Thermopsis turcica ekstrelerinin HepG2 hücre hatlarında antikanser, sitotoksik, genotoksik mekanizmalarının gen ekspresyon analizleri yöntemiyle değerlendirilmesi
Evaluation of anti-cancerous, cytotoxic, genotoxic mechanisms via gene expression analysis of various extracts from Thermopsis turcica in HepG2 cell line
MUHAMMAD MUDDASSIR ALI
Doktora
Türkçe
2017
BiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İBRAHİM HAKKI CİĞERCİ