Geri Dön

İdrar kültürlerinden izole edilen escherichia coli suşlarında p fimbria varlığı ve antibakteriyellere karşı duyarlılıklarının incelenmesi

The investigation of p fimbriae presence in escherichia coli strains isolated from urine samples and their antibacterial resistance

PDF İndir

  1. Tez No: 458195
  2. Yazar: EMEL İNEGÖL PAYKOÇ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Adnan Menderes Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 107

Özet

Üriner sistem enfeksiyonlarından (ÜSE) sıklıkla izole edilen patojenler arasında yer alan Escherichia coli'nin en önemli virulans faktörlerinden birisi piyelonefrit ile ilişkili fimbria (pap) olan P fimbrialardır. Bu çalışmada; ÜSE'li hasta idrarlarından E. coli'nin izolasyonu, izolatların antibiyotik dirençliliklerinin, genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) enzimlerinin ve P fimbria varlıklarının incelenmesi amaçlandı. Çalışmada materyal olarak idrar örneklerinden bir yıl boyunca izole edilen 133 E. coli kullanıldı. Bakterilerin izolasyonları konvansiyonel yöntemlerle yapıldıktan sonra, identifikasyonları polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile doğrulandı. Fenotipik olarak 7 antimikrobiyal aileye ait 20 antibiyotiğe karşı direnç profilleri disk difüzyon yöntemi (DDT) ile, GSBL enzim varlığı ise çift disk sinerji testi (ÇDST) ile araştırıldı. Genotipik olarak GSBL genlerinin (blaTEM, blaCTX, blaOXA, blaSHV) ve P fimbria genlerinin (papA, papG) varlığı incelendi. Ki Kare testi; i. GSBL üreten ve üretmeyen ii) papA ve papG taşıyan ve taşımayan izolatlarda antibiyotik duyarlılık ve dirençlilik durumları arasındaki ilişki karşılaştırmak için kullanıldı. DDT sonucunda izolatların %50.30'ünün siprofloksasine, %42.10'inin trimetoprim sulfametaksazole, %13.55'inin sefazoline dirençli oldukları belirlenirken, kullanılan diğer 17 antibiyotiğe karşı direnç oranlarının %0.75 ile %9.80 arasında değiştiği tespit edildi. İzolatların %49.7'si fenotipik, %59.4'ü genotipik olarak GSBL pozitif olduğu belirlendi. İzolatlarda blaTEM %32.3, blaCTX %31.6, blaOXA %21.0, blaSHV %2.3 oranında saptandı. İzolatların %27.0'sinde toplam 51 pap geni (%12.0 papA, %26.3 papG) belirlendi. Ki Kare testi neticesinde i) GSBL üreten ve üretmeyen izolatlarda siprofloksasin ve trimetoprim-sülfametaksazol antibiyotikleri açısından ii) siprofloksasin direnci ile papG varlığı açısından gruplar arasında anlamlı farklılık saptandı. Bundan sonraki çalışmalarda, ÜSE'larından izole edilen GSBL pozitif E. coli'lerin plazmitleri araştırılıp, bu plazmitlerin GSBL üretimine katkıları incelenebilir.

Özet (Çeviri)

The most important virulence factor of Escherichia coli that it's commonly isolated from urinary tract infections (UTI) is pyelonephritis associated P fimbriae (pap). In this study, after the isolation of E. coli from patients with UTI, the investigation of the presence of P fimbriae, extended spectrum β-lactamase (ESBL) enzymes, and antimicrobial resistance of isolates were aimed. The material of the study was consisted of 133 E. coli strains isolated from urine samples in a one year period. After the isolation of microorganisms with conventional methods, identification was performed with polymerase chain reaction (PCR). The presence of ESBL enzyme and antibiotic resistance profiles to 20 antibiotics as which phenotypically belong to 7 antimicrobial families were investigated with disc diffusion test (DDT) and double disc synergy test (DDST), respectively. The presence of ESBL genes (blaTEM, blaCTX, blaOXA, blaSHV) and P fimbriae genes (papA, papG) were also investigated. Chi-square test was used to compare the antibiotic resistance and sensitivities of i) ESBL producing and non-producing and ii) papA and papG bearing and non-bearing isolates. It was determined that 50.30%, 41.90% and 13.80% of isolates were resistant to ciprofloxacine, trimethoprime sulphamethoxazole, cefazoline, respectively, while antibiotic resistances for other 17 antibiotics varying between 0.75% and 9.80% according to DDT. It was determined that 49.7% of isolates were found as ESBL positive as phenotypically, while 59.4% were genetically positive. The percentages of genes detected with PCR were 32.3%, 31.6%, 21.0%, 2.3% for blaTEM, blaCTX, blaOXA, blaSHV, respectively. A total of 51 pap genes (12.0% papA, 26.3% papG) were detected in the 27.0% of total isolates. The statistically significance was found between i)ESBL producing and non-producing isolates for ciprofloxacine, trimethoprime sulphamethoxazole ii) between ciprofloxacin resistance and the presence of papG in Chi-square test. Further studies should be designed to investigate the plasmids of ESBL positive E. coli stains isolated from UTI and whether plasmids are responsible for ESBL production.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    539760

    Yoğun bakım hastalarının idrar kültürlerinden izole edilen escherichia coli suşlarında fimh single nükleotid polimorfizmi araştırılması

    Investigation of fimh single nucleotide polymorphism in escherichia coli strains isolated from urinary cultures of intensive care patients

    SEMA KOÇYİĞİT KALCAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AZİZ RAMAZAN DİLEK

  2. Tez No

    118463

    Üriner sistem infeksiyonlu olgulardan izole edilen escherichia coli suşlarında siprofloksasin, trimetoprim-sulfametoksazol direnci ve genişlemiş spektrumlu beta laktamaz sıklığının araştırılması

    Başlık çevirisi yok

    MEHMET ÖZDEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıFırat Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AHMET KALKAN

  3. Tez No

    887954

    Molecular identification and antimicrobial resistance profiles of Escherichia coli isolated in urine cultures from Shamiya State Hospital (Iraq)

    Şamiye Devlet Hastanesi (Irak) idrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli'nin moleküler tanımlanması ve antimikrobiyal direnç profilleri

    ALI HAMEED NEAMAH ALHUSSEINI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    MikrobiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Moleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET OĞUZ ÖZTÜRK

  4. Tez No

    728845

    İdrar kültürlerinden izole edilen escherichia coli ve klebsiella pneumoniae suşlarında fosfomisin direncinin agar dilüsyon yöntemi ile belirlenmesi

    Determination of phosphomyine resistance in escherichia coli and klebsiella pneumoniae isolated from urinary cultures by agar diluation method

    FUNDA POLAT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞE ÖZKAÇMAZ

  5. Tez No

    508433

    İdrar kültürlerinden izole edilen siprofloksasin dirençli ve duyarlı escherichia coli suşlarında fosfomisin trometamol duyarlılığı ve bu duyarlılığın iki farklı yöntemle in vitro araştırılması

    The sensitivity to fosfomycin tromethamine of ciprofloxacin sensitive and/or resistant escherichia coli strains those isolated from urine cultures, and comparison of two different methods in detection of fosfomycin tromethamine sensitivity

    SELDA CANVER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    MikrobiyolojiKırıkkale Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. JÜLİDE SEDEF GÖÇMEN

Geri Dön