Geri Dön

Structure analysis of the human Notch1-ankyrin domain via X-ray crystallography and targeting notch transcription complex assembly by using potential therapeutic ligand interaction

İnsan Notch-1 ankyrin domaininin X-ışını kristallografisi ile yapı analizi ve potansiyel terapotik ligand etkileşimleri kullanarak Notch transkripsiyon kompleksinin oluşumunun engellemesinin hedeflenmesi

  1. Tez No: 461653
  2. Yazar: ELİF ERDEM
  3. Danışmanlar: DOÇ. KURTULUŞ GÖLÇÜK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyofizik, Biophysics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 60

Özet

Notch-1 proteininin Ankyrin kismi, Notch transkripsiyon kompleksinin olusumu ve hucre icerisindeki notch yolagi icin onemli bir domaindir. Bu calismada N-terminali ve C-terminali kisaltilmis olan Ankyrin protein fragmenti; protein kristallestirilmesi optimizasyonu, protein yapisi ve Notch transkripsiyon kompleksinin olusumunu engelleme potansiyeli olan kimyasal fragmentler ve proteinler arasindaki muhtemel bir etkilesimin X-ray kristalografisi kullanilarak tespiti hedeflenmistir. Calismada Rekombinant protein ekspresyon ve purifikasyonu, afiniti kromatografisi, HPLC, FPLC, SDS-PAGE karakterizasyonu ve X-ray kristalografisi icin gerekli screen'ler ile kokristalizasyon teknikleri kullanilmistir.

Özet (Çeviri)

Notch-1 Ankyrin domain is important for Notch Transcription Complex assembly as well as Notch intracellular transcription pathway. In this study, N-termini and C-termini shortened Ankyrin protein fragments were used for optimizing protein crystallization conditions, detecting proteins structure and detection of any potential interaction with the putative fragments which may bind to Ankyrin protein and potentially disrupt the assembly of the Notch transcription complex. In this study, recombinant protein expression, protein purification via affinity chromatography, size exclusion chromatography, characterization via SDS-PAGE, spectrophotometry and initial screening, refinement, co-crystallization, X-ray diffraction and Structure analysis were employed.

Benzer Tezler

  1. Özel geometriyle pürüzlendirilmiş ve hafifletilmiş kalça implantının tasarımı ve lazer sinterleme yöntemi ile imalatı

    The design of roughened and lightened hip implant with special geometry and manufacturing by laser sintering method

    YUNUS EMRE DELİKANLI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyomühendislikSüleyman Demirel Üniversitesi

    Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET CENGİZ KAYACAN

  2. Radius intramedüller çivilerde farklı sabitleme pozisyonları ile oluşan mekanik etkilerin sonlu elemanlar yöntemi ile incelenmesi

    Investigation of mechanical effects caused by various fixation positions on radius intramedullary nails using finite element method

    HALİM KOVACI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyoteknolojiAtatürk Üniversitesi

    Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYHAN ÇELİK

  3. Lazer ergitme yöntemi ile kişiye özel hafifletilmiş gerçek kafatası parçası implant imalatı

    Fabrication of customized diminish real-skull part implant by laser melting method

    KORAY ÖZSOY

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Makine MühendisliğiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET CENGİZ KAYACAN

  4. Dijital panoramik radyografilerde mandibular morfometrik parametrelerin cinsiyet tayininde kullanılabilirliğinin farklı sınıflandırıcılarla karşılaştırılması

    Comparing the usability of mandibular morphometric parameters in digital panoramic radiography in gender determination with different classifiers

    HANİFE PERTEK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Mühendislik Bilimleriİstanbul Teknik Üniversitesi

    Elektronik ve Haberleşme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA ERSEL KAMAŞAK

  5. Doğal gaz boru hatlarında orbital kaynak teknolojisi kullanılarak yapılan kaynakların mekanik ve mikroyapı özelliklerinin incelenmesi

    Characterization of microstructure and mechanical properties of girth welds welded with orbital welding technology in the natural gas pipelines

    HANİFE DİDEM GENÇKAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Metalurji Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Metalurji ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİLİZ ŞAHİN