Structure analysis of the human Notch1-ankyrin domain via X-ray crystallography and targeting notch transcription complex assembly by using potential therapeutic ligand interaction
İnsan Notch-1 ankyrin domaininin X-ışını kristallografisi ile yapı analizi ve potansiyel terapotik ligand etkileşimleri kullanarak Notch transkripsiyon kompleksinin oluşumunun engellemesinin hedeflenmesi
- Tez No: 461653
- Danışmanlar: DOÇ. KURTULUŞ GÖLÇÜK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyofizik, Biophysics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 60
Özet
Notch-1 proteininin Ankyrin kismi, Notch transkripsiyon kompleksinin olusumu ve hucre icerisindeki notch yolagi icin onemli bir domaindir. Bu calismada N-terminali ve C-terminali kisaltilmis olan Ankyrin protein fragmenti; protein kristallestirilmesi optimizasyonu, protein yapisi ve Notch transkripsiyon kompleksinin olusumunu engelleme potansiyeli olan kimyasal fragmentler ve proteinler arasindaki muhtemel bir etkilesimin X-ray kristalografisi kullanilarak tespiti hedeflenmistir. Calismada Rekombinant protein ekspresyon ve purifikasyonu, afiniti kromatografisi, HPLC, FPLC, SDS-PAGE karakterizasyonu ve X-ray kristalografisi icin gerekli screen'ler ile kokristalizasyon teknikleri kullanilmistir.
Özet (Çeviri)
Notch-1 Ankyrin domain is important for Notch Transcription Complex assembly as well as Notch intracellular transcription pathway. In this study, N-termini and C-termini shortened Ankyrin protein fragments were used for optimizing protein crystallization conditions, detecting proteins structure and detection of any potential interaction with the putative fragments which may bind to Ankyrin protein and potentially disrupt the assembly of the Notch transcription complex. In this study, recombinant protein expression, protein purification via affinity chromatography, size exclusion chromatography, characterization via SDS-PAGE, spectrophotometry and initial screening, refinement, co-crystallization, X-ray diffraction and Structure analysis were employed.
Benzer Tezler
- Özel geometriyle pürüzlendirilmiş ve hafifletilmiş kalça implantının tasarımı ve lazer sinterleme yöntemi ile imalatı
The design of roughened and lightened hip implant with special geometry and manufacturing by laser sintering method
YUNUS EMRE DELİKANLI
Doktora
Türkçe
2017
BiyomühendislikSüleyman Demirel ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET CENGİZ KAYACAN
- Radius intramedüller çivilerde farklı sabitleme pozisyonları ile oluşan mekanik etkilerin sonlu elemanlar yöntemi ile incelenmesi
Investigation of mechanical effects caused by various fixation positions on radius intramedullary nails using finite element method
HALİM KOVACI
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
BiyoteknolojiAtatürk ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYHAN ÇELİK
- Lazer ergitme yöntemi ile kişiye özel hafifletilmiş gerçek kafatası parçası implant imalatı
Fabrication of customized diminish real-skull part implant by laser melting method
KORAY ÖZSOY
Doktora
Türkçe
2016
Makine MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET CENGİZ KAYACAN
- Dijital panoramik radyografilerde mandibular morfometrik parametrelerin cinsiyet tayininde kullanılabilirliğinin farklı sınıflandırıcılarla karşılaştırılması
Comparing the usability of mandibular morphometric parameters in digital panoramic radiography in gender determination with different classifiers
HANİFE PERTEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Mühendislik Bilimleriİstanbul Teknik ÜniversitesiElektronik ve Haberleşme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA ERSEL KAMAŞAK
- Doğal gaz boru hatlarında orbital kaynak teknolojisi kullanılarak yapılan kaynakların mekanik ve mikroyapı özelliklerinin incelenmesi
Characterization of microstructure and mechanical properties of girth welds welded with orbital welding technology in the natural gas pipelines
HANİFE DİDEM GENÇKAN
Doktora
Türkçe
2014
Metalurji Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiMetalurji ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FİLİZ ŞAHİN