Chilo iridescent virüs 458R açık okuma zincirinin moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of chilo iridescent virus 458R open reading frame
- Tez No: 461868
- Danışmanlar: PROF. DR. ZİHNİ DEMİRBAĞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genel Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 73
Özet
Chilo iridescent virüs (CIV), Iridoviridae familyasının Iridovirus cinsine ait biyokontrol ajanı olarak kullanım potansiyeline sahip bir böcek virüsüdür. Ayrıca, aşı geliştirme ve teröpatik ajan olarak kullanılabilme potansiyeline sahipir.. Virüsün bu alanlarda verimli şekilde kullanımı ise moleküler olarak aydınlatılması ile gerçekleştirilebilir. Bu tez kapsamında yapılan biyoinformatik analizler ve literatür araştırması sonucunda, CIV 458R geninin virüsün hücreye tutunma, hücreye giriş, viral replikasyon ve/veya viriyon inşası süreçlerinden biri ya da birkaçında görev yapıyor olabileceği düşünülmüştür. Genin fonksiyonel analizine yönelik planlanan çalışmalara temel oluşturması bakımından bu tezde ilk adım olarak 458R'nin transkripsiyonel analizi yapıldı, genin transkripsiyonu sonucu oluşan mRNA'nın translasyon olmayan uç bölgeleri belirlendi. Bu çalışmalar sonucunda, 458R'nin geç gen olduğu ve enfeksiyonu takiben 12 ila 24. saatler arasında transkripsiyonun başladığı belirlendi. mRNA'nın başlangıç kodonunun hemen yukarısındaki 53 nükleotidlik kısımın 5', stop kodonunun hemen aşağısındaki 40 nükleotidlik kısmın ise 3' translasyon olmayan bölgeleri oluşturduğu tespit edildi. Bu çalışmada, CIV enfeksiyonunda ve/veya yeni viriyon oluşumunda görevli olması muhtemel bir açık okuma zincirinin transkripsiyonel analizi yapılmıştır.
Özet (Çeviri)
Chilo iridescent virus (CIV), belongs to genus Iridovirus of family Iridoviridae, is an insect virus possessing potential use as biocontrol agent. Also, this virus has potential to be utilized for vaccine development and therapeutic purposes. Efficient utilization of the virus for these purposes can be possible by analyzing the virus at molecular level. As a result of the bioinformatics analysis and literature research performed within the scope of this thesis, it is thought that 458R gene encoded by CIV may be playing role in one or more steps such as attachment, entering to the cell, viral replication and/or virion assemble process. For functional analysis of the gene, the transcriptional analysis of 458R and determination of the untranslated regions of synthesized mRNA were determined in this thesis. In a consequence of these study, it was determined that 458R is a late gene and transcription of the gene is started between 12 and 24. hours post infection. It was determined that 5′ untranslated region is located at the 53 nucleotides upstream of start codon of mRNA and 3′ untranslated region is located at the 40 nucleotides downstream of stop codon of mRNA. In this study, transcriptional analysis of an open reading frame, playing a role in CIV infection and/or new virion formation, was carried out.
Benzer Tezler
- Chılo ırıdescent virüs'e ait yapısal proteinler arasındaki moleküler etkileşimler
Molecular interactions between structural proteins of chilo iridescent virus
EMİNE ÖZŞAHİN
Doktora
Türkçe
2015
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZİHNİ DEMİRBAĞ
- Chilo iridescent virüs muhtemel apoptosis inhibitör genlerinin araştırılması ve fonksiyonel analizi
Functional analysis of a putative inhibitor genes of apoptosis (IAP) encoded by Chilo iridescent virus
İKBAL AGAH İNCE
Doktora
Türkçe
2007
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZİHNİ DEMİRBAĞ
- Chilo iridescent virus (CIV) 118 L geninin bakülovirüs vektör sisteminde ifadesi ve antikor geliştirilmesi
Expression of Chilo iridescent virus (CIV) gene of 188 L in baculovirus expression vector system and development of antibody
SEVDE SEHER DABAĞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZİHNİ DEMİRBAĞ
- Chilo ıridescent virüs replikasyonunun başlamasında rol oynayan hücresel proteinlerin belirlenmesi
Determination of cellular proteins playing a role in the start of chilo iridescent virus replication
KÜBRA ZENGİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. REMZİYE NALÇACIOĞLU
- Chılo ırıdescent virüs (cıv)'e ait matriks metalloproteinaz genlerinin (136r & 165r) bakülovirüs vektör sisteminde ifadesi ve ürünlerinin aktivite tayini
Expression of chilo iridescent virus (civ) matrix metalloproteinase genes (136r & 165r) in baculovirus expression vector system and determination of the activities of the products
AYDIN YEŞİLYURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. REMZİYE NALÇACIOĞLU