Geri Dön

Kanatlı kökenli escherichia coli'lerin filogruplandırılması

Phylogrouping of escherichia coli strains originated from poultry

PDF İndir

  1. Tez No: 462843
  2. Yazar: MEHMED OMEROVIC
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. HAMİT KAAN MÜŞTAK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 42

Özet

Filogruplandırma, E. coli suşlarının karakteristik özelliklerinin anlaşılması, enfeksiyonların önlenmesi, kontrol edilmesi ve yeni tedavi yöntemlerinin belirlenmesinde önemli rol oynamaktadır. Bu çalışmada kanatlı kökenli E. coli (APEC ve AFEC) suşlarının filogruplandırılması amaçlandı. Çalışmada identifiye edilen 150 adet APEC ve 150 adet AFEC suşunun filogruplandırılması kuadrupleks PCR (Clermont ve ark., 2013) metodu ile araştırıldı. Filogruplandırma sonucu incelenen 150 adet APEC suşunun 4'u A (% 2,66), 43'ü B1 (% 28,66), 38'i B2 (% 25,33), 2'si C (% 1,33), 18'i E (% 12), 5'i F (% 3,33), 1'i Clade I (% 0,66), 2'si negatif (% 1,33) olarak gruplandırıldı ve gruplandırılmayan 37 (% 24,66) suş tespit edildi. İncelenen 150 adet AFEC suşunun 5'i A (% 3,33), 8'i B1 (% 5,33), 16'si B2 (% 10,66), 16'si C (% 10,66), 1'i D (% 0,66), 27'si E (% 18), 9'u F (% 6), 3'ü Clade I veya Clade II (% 2) olarak gruplandırıldı ve gruplandırılmayan 51 (% 34) suş tespit edildi. Escherichia coli enfeksiyonlarının önlenmesi amacıyla geliştirilecek olan aşılarda mutlaka yersel suşların kullanılması ve bu suşlara ait özelliklerin belirlenmesi gerektiği anlaşıldı. Bununla birlikte genotipik olarak çok çeşitlilik gösteren E. coli suşlarının, özellikle APEC suşlarının, daha detaylı genotipik analizler yapılarak yeni filogrupların araştırılması gerektiği düşünüldü.

Özet (Çeviri)

Phylogrouping has a major role to understand the characteristic features of E. coli strains, control and establishment of new treatment methods. This study was aimed to phylogrouping the strains of E. coli (APEC ve AFEC) of avian origin. A total of 150 samples of APEC and 150 samples of AFEC were analyzed and phylogrouped using quadruplex PCR (Clermont et al., 2013) method. Among the APEC samples under study, 4 (% 2,66) belonged to group A, 43 (% 28,66) belonged to group B1, 38 (% 25,33) belonged to group B2, 2 (% 1,33) belonged to group C, 18 (% 12) belonged to E, 5 (% 3,33) belonged to group F, 1 (% 0,66) belonged to Clade I, 2 (% 1,33) were negative and 37 (% 24,66) was ungrouped. On the other hand among AFEC samples under study, 5 (% 3, 33) belonged to A group, 8 (% 5,33) belonged to B1, 16 (% 10,66) belonged to B2 group, 16 (% 10,66) belonged to C group, 1 (% 0,66) belonged to D group, 27 (% 18) belonged to E group, 9 (% 6) belonged to F group, 3 (% 2) belonged to Clade I or Clade II and 51 (% 34) were ungrouped. The applications of local vaccine strains is unique in order to prevent E. coli infections, but firstly the characteristics of these strains should be determined. In addition, regarding E. coli strains, especially APEC, which show genotypic diversity, more research needs to be done to investigate new phylogroups.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    852136

    Bor bileşiklerinin kanatlı patojenleri üzerindeki antimikrobiyal etkinliklerinin araştırılması

    Investigation of the anti-bacterial efficiencies of boron compounds on some poultry pathogens

    DUNYA ALKHAZRAJI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BARIŞ SAREYYÜPOĞLU

  2. Tez No

    454092

    Tavuk kökenli enterococcus faecıum ve lactobacıllus türlerinin probiyotik özelliklerinin araştırılması

    Investigation of probiotic properties of chicken originated enterococcus faeciumand lactobacillusspecies

    YAĞMUR KOÇAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ALPER ÇİFTCİ

  3. Tez No

    617814

    Türkiye'de üretilen hayvansal gıdalar için gıda güvenliği bilgi sistemi ile rasff'ın karşılaştırılması

    Comparison of rasff and food safety information system in Turkey for animal sourced food products

    MUSTAFA FEYZULLAH AKYÜZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Veteriner HekimliğiErciyes Üniversitesi

    Veteriner Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim dalı

    PROF. DR. ZAFER GÖNÜLALAN

  4. Tez No

    462842

    Kanatlı kökenli salmonella infantis suşlarının MLST ile filogenetik analizi

    Phylogenetic analysis of salmonella infantis strains from poultry by MLST

    SEYYİDE SARIÇAM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. H.KAAN MÜŞTAK

  5. Tez No

    131776

    Kanatlılardan izole edilen salmonella suşlarının florokinolon grubu antibiyotiklere duyarlılıklarının ve minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) değerlerinin karşılaştırılması üzerine çalışmalar

    Conparison of antibiotic susceptibilities and minimum inhibitor concentration (MIC) values of avian salmonella icolates against fluoroquinolones

    ÖĞÜT KÖSE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. N. YAKUT ÖZGÜR

Geri Dön