Karayaka koyun ırkının genetik karakterizasyonu
The genetic characterization of Karayaka sheep breed
- Tez No: 462862
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET AKİF ÇAM
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Ziraat, Biotechnology, Genetics, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Zootekni Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 126
Özet
Bu tez çalışmasında, Türkiye yerli çiftlik hayvan gen kaynaklarından biri olan Karayaka koyun ırkının genetik karakterizasyonunun yapılması ve koyun populasyonları arasındaki genetik ilişkilerin 9 adet mikrosatellit markör kullanılarak ortaya konması amaçlanmıştır. Türkiye Karadeniz bölgesi kıyı şeridi illerinden; Samsun, Ordu, Giresun ve Tokat il ve ilçe köylerinden Karayaka koyun ırkına ait 206 baş koyundan alınan kan örnekleri çalışma materyali olarak kullanılmıştır. Genomik DNA, ticari kit kullanılarak elde edilmiştir. Mikrosatellit lokuslar Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) metoduyla çoğaltıldıktan sonra lokus başına 16 ve her populasyon için 144 adet örnek seçilerek toplam 576 adet PCR sonrası ürün DNA fragment analiz cihazında genotiplendirilmiştir. Karayaka koyun ırkında lokus başına ortalama gözlemlenen allel sayısı (Na), allelik zenginlik (Ar), gözlenen heterozigotluk (Ho), beklenen heterozigotluk (He), polimorfik bilgi içeriği (PBİ) ve akrabalı yetiştirme katsayısı (FIS) değerleri sırasıyla Na=16.44, Ar=9.887, Ho=0.301, He=0.817, PBİ=0.866 ve FIS=0.633 olarak belirlenmiştir. Populasyon düzeyinde gözlenen (Ho) ve beklenen heterozigotluk (He) değerleri sırasıyla 0.171 (Giresun) ile 0.376 (Ordu) ve 0.775 (Tokat) ile 0.845 (Ordu) aralığında değişmiştir. Karayaka koyununda tespit edilen %66.9'luk genetik varyasyonun (FIT) %63.0'nün populasyonlar içindeki genetik farklılıktan (FIS) %10.5'inin ise populasyonlar arasındaki genetik farklılıktan (FST) (P
Özet (Çeviri)
This thesis study is aimed at investigating the genetic characterization and to determine the genetic relationships between populations in the Karayaka sheep breed, one of the farm animal genetic resources of Turkey, using nine microsatellite markers. Blood samples collected from unrelated 206 head of Karayaka sheep in its breeding tract raised in Samsun, Ordu, Giresun, and Tokat provinces in the Black Sea Region of Turkey were used as study material. The genomic DNA was isolated by using an extraction kit. Microsatellite loci were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) method, and then a total of 576 Post-PCR products to band quality were chosen from among agarose gel results, and selected samples were genotyped by a DNA fragment analysis instrument. The average number of alleles (Na), allelic richness (Ar), observed heterozygosity (Ho), expected heterozygosity (He), polymorphism information content (PIC), and inbreeding coefficient (FIS) for all populations was estimated respectively as Na=16,44, Ar=9,887, Ho=0,301, He=0,817, PIC=0,866, and FIS=0,633. The observed and expected heterozygosity ranged from 0,171 (Giresun) to 0.376 (Ordu) and 0,775 (Tokat) to 0,845 (Ordu), respectively. It was determined that 10,5% of the total genetic variation (FIT=66,7%) in Karayaka sheep corresponded to genetic differences among populations (FST) (P
Benzer Tezler
- Bioinformatic analyses in microsatellite-based genetic diversity of Turkish sheep breeds
Türk koyun ırklarının genetik çeşitliliklerinin mikrosatelit belirteçler kullanılarak biyoenformatik yöntemlerle incelenmesi
HANDE ACAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2010
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoenformatik Bölümü
PROF. DR. İNCİ TOGAN
- Türkiye'de yetiştirilen bazı koyun ırklarında MHC (Major histocompatibility complex) gen bölgesinde genetik varyasyonun belirlenmesi
The identification of genetic variation in MHC (Major histocompatibility complex) gene region in some Turkish sheep breeds
FATMA İLHAN
- Surveillance of prion protein (PrP) gene polymorphisms in Turkish native sheep breeds
Türkiye yerli koyun ırklarında prion protein (PrP) geni polimorfizmlerinin taranması
BEGÜM UZUN
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İNCİ TOGAN
- Karayaka koyunlarının et verimlerinin ıslahında yerli ve yabancı ırklardan yararlanma imkanları
Utilization possibilities from commun and exotic races to improve meat yields at the breeding of Karakaya Sheeps
MUSTAFA OLFAZ
- Koyun yetiştiriciliğinde yerleşik ve yarı göçer üretim sisteminin hayvan refahı ve verim özellikleri üzerine etkileri
Effects of settled and semi-nomatic production systems in sheep breeding on animal welfare and productivity characteristics
ERHAN ÇEVİKKOL
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
ZiraatOndokuz Mayıs ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET AKİF ÇAM