Genetic diversity of native and crossbreed sheep breeds in Anatolia
Anadolu yerli melez koyun ırklarının genetik çeşitliliği
- Tez No: 153270
- Danışmanlar: PROF. DR. İNCİ TOGAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Genetic variation, microsatellite, sheep, Turkish breeds
- Yıl: 2004
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 138
Özet
oz ANADOLU YERLİ VE MELEZ KOYUN IRKLARININ GENETİK ÇEŞİTLİLİĞİ Koban, Evren Doktora, Biyoloji Bölümü Tez Yöneticisi: Prof. Dr. İnci Togan Aralık 2004, 125 sayfa Bu çalışmada, Türk koyun ırklarında mevcut genetic çeşitlilik Mikrosatelit DNA lokusları kullanılarak incelenmiştir. Devlet üretim çiftlikleri, üniversite üretim çiftlikleri ve yerel yetiştiricilerin elinde bulunan sürülerden yerli ve melez onbir Türk ırkı (Akkaraman, Morkaraman, Kıvırcık, İvesi, Dağlıç, Karayaka, Hemsin, Narduz, Kangal, Konya Merinosu, Türkgeldi) ile bireyleri Irak'tan getirilmiş yabancı bir ırkı (Hamdani) temsil eden toplam 423 örnek bu çalışmada kullanılmıştır. Öncelikle üretim çiftliklerinden toplanan populasyonlardan akrabalık derecesi yüksek bireylere ait veriler yakınlık (kinship) analizinin sonuçları doğrultusunda çıkartılmıştır. Genetik varyasyonun ölçütlerinden beklenen heterozigotluk (He) 0.686 ile 0.793 arasında, ortalama gözlenen alel sayıları (OAS) ise 5.8 ile 11.8 arasında değişmiştir. Türkiye üzerinde alel frekans dağılımları Neolitik Gruplarca Yayılma Modeli'nin beklediği gibi bir değişim göstermemiştir. Fst indeksi Akkaraman, Karayaka ve Dağlıç'ta aynı ırkın farklı populasyonlarındaki farklılaşmayı ölçmek için kullanılmıştır ve yetiştirme çiftliğinden alınan Akkarmanl'in diğer iki vıAkkaraman populasyonundan istatistiki önemle (P
Özet (Çeviri)
ABSTRACT GENETIC DIVERSITY OF NATIVE AND CROSSBREED SHEEP BREEDS IN ANATOLIA Koban, Evren Ph.D., Department of Biology Supervisor: Prof. Dr. İnci Togan December 2004, 125 pages In this study the genetic diversity in Turkish native sheep breeds was investigated based on microsatellite DNA loci. In total, 423 samples from 1 1 native and crossbreed Turkish sheep breeds (Akkaraman, Morkaraman, Kıvırcık, İvesi, Dağlıç, Karayaka, Hemsin, Norduz, Kangal, Konya Merinosu, Türkgeldi) and one Iraqi breed (Hamdani) were analyzed by sampling from breeding farms and local breeders. After excluding close relatives by Kinship analysis, the genetic variation within breeds was estimated as gene diversities (He), which ranged between 0.686 and 0.793. The mean number of observed alleles (MNA) ranged between 5.8 and 11.8. The allele frequency distribution across Turkey showed no gradient from east to west expected in accordance with the Neolithic Demic Diffusion model. The differentiation between different samples of Akkaraman, Dağlıç and Karayaka breeds was tested by Fst index. Akkaraman 1 sample from the breeding farm was IVsignificantly (PO.0Q1) different from the other two Akkaraman samples. Deviation from HW expectations observed for Akkaraman 1, İvesi, Morkaraman and Hemsin breeds. AMOVA analysis revealed that most of the total genetic variation (-90%) was partitioned within the individuals. In parallel to this observation, when factorial correspondence analysis and shared alleles distances were used to analyze the relationship between the individuals of the breeds, there was no clear discrimination between breeds. Moreover, NJ tree constructed based on Da genetic distance, and PC analyses were used to analyze among breed differentiation. Delaunay Network drew 4 genetic boundaries (two of them being parallel to geographic boundaries) between breeds. All the results indicated that Kıvırcık was the most differentiated breed. Finally, Mantel Test and Bottleneck analysis did not reveal a significant result. Kıvırcık breed, among all native Turkish breeds, was found to be the genetically closest to the European breeds based on the loci analyzed. The genetic variation in Turkish breeds was not much higher than that of European breeds, which might be a consequence of the recent sharp decrease in sheep number.
Benzer Tezler
- Bazı yerli ve melez evcil kaz populasyonlarında genetik çeşitliliğin mikrosatellit markörler yardımıyla belirlenmesi
Genetic diversity in some native and crossbreed domestic goose populations by microsatellite markers
ZEYNEP DEMİRTAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatOndokuz Mayıs ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. LEVENT MERCAN
- Kamerun yerli ve melez sığırlarında mtDNA sitokrom B geni haplotip çeşitliliğinin analizi
mtDNA cytochrome B gene haplotype diversity among native and cross breed cattle in Cameroon
SEÇİL ÜNALDI
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiEge ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EVREN KOBAN BAŞTANLAR
- Kamerun yerli ve melez sığırlarında mtDNA D-loop bölgesinin haplotip çeşitliliğinin analizi
mtDNA D loop region haplotype diversity among native and cross breed cattle in Cameroon
ÇİSEL NİSAN
- Türkiye yerli keçi ırklarının mitokondrial DNA çeşitliliği ve filocoğrafyası
Mitochondrial DNA diversity and phylogeography of turkish native goat breeds
BENGİ ÇINAR KUL
- İki doğal kayabalığı türünün (neogobius fluviatilis ve proterorhinus semilunaris) marmara bölgesi'nin bazı göllerinde yaşayan popülasyonlarının biyo-ekolojik özellikleri ve genetik çeşitliliklerinin tespiti
Determi̇nati̇on of the geneti̇c vari̇abi̇li̇ty and the bi̇oecologi̇cal charactari̇sti̇cs of the populati̇ons of two nati̇ve speci̇es of two goby fi̇sh (neogobius fluviatilis and proterorhinus semilunaris) li̇vi̇ng i̇n some lakes i̇n Marmara regi̇on
ERDİ GÖKHAN TEPEKÖY
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Su ÜrünleriMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ SERHAN TARKAN