Geri Dön

Büyük yoğun çekirdek veziküllerinde depolanan mikrorna'ların NGS kullanılarak araştırılması

Investigation of micrornas stored in large danse core vesicles using NGS

  1. Tez No: 466322
  2. Yazar: RAMAZAN YİLDİZ
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. YONGSOO PARK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Tıbbi Biyoloji, Biology, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Dizi analizi, Dizi analizi-RNA, Gen ifadesi, Mikro RNA, Nörotransmitter ajanlar, RNA, Sinaptik veziküller, Vezikül, Sequence analysis, Sequence analysis-RNA, Gene expression, Micro RNA, Neurotransmitter agents, RNA, Synaptic vesicles, Blister
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Temel Sinirbilimler Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Nöronlarda nörotransmitter içeren veziküller, bir membran füzyon işlemi ile hücre dışı bir hedefe nörotransmitter vermek üzere nanomakineler (sinaptik veziküller, çap olarak 45 nm) 'dir. Nöronal hücrelerin veziküler iki türü vardır: sinaptik veziküller ve büyük yoğun çekirdekli veziküller (LDCV'ler). Klasik nörotransmitterlere ek olarak, 21-24 nükleotid uzunluğundaki mikro RNA'lar (miRNA'lar) çeşitli hücresel işlevlerde bulunur. MiRNA'lar ekstraselüler miRNAlar olarak adlandırılan nöronların hücre dışı hücrelerine salınabilir ve hem fizyolojik hem de patolojik koşullarda hücresel iletişimde rol oynar. MiRNA'lar üretildikleri hücredeki gen ekspresyonunu düzenlese de, miRNA son zamanlarda nöronların dışında keşfedilmiştir. Büyük ilgi duymasına rağmen, miRNA'ların vezikül füzyonu tarafından salgılanan moleküler mekanizması ve veziküllerde depolanabilen miRNA'lar bilinmemektedir. Çalışmamızda, sığır adrenal bezinden elde edilen LDCV'ler saflaştırılmış ve daha sonra RNA izole edilmiştir. Çalışmamızda miRNA'ların saflaştırılmış LDCV'lerde depolandığını gözlemledik. Son olarak, yeni nesil sekanslama (NGS) kullanarak LDCV'lerde depolanan miRNA'ların dizilişini analiz ettik.

Özet (Çeviri)

Vesicles containing neurotransmitters in neurons are nanomachines (synaptic vesicles, 45 nm in diameter) to give neurotransmitters to an extracellular target by a membrane fusion process. There are two types of vesicles of neuronal cells: synaptic vesicles and large dense-core vesicles (LDCVs). In addition to classical neurotransmitters, microRNAs (miRNAs) with 21-24 nucleotides long are found in a variety of cellular functions. miRNAs can be released into extracellular cells of neurons called extracellular miRNAs and play a role in cellular communication in both physiological and pathological conditions. Although miRNAs regulate gene expression in the cell in which they are produced, miRNA has recently been discovered outside of neurons. Despite great interest, the molecular mechanisms by which miRNAs are secreted by vesicle fusion and miRNA can be stored in vesicles are unknown. In our study, LDCVs obtained from the bovine adrenal gland were purified and then RNA was isolated. We observed that miRNAs are stored in purified LDCVs. Finally we analyzed the sequencing of miRNAs stored in LDCVs using next-generation sequencing (NGS).

Benzer Tezler

  1. Büyük yoğun çekirdek veziküllerinde miR-375 'in araştırılması

    Investigation of miR-375 by large dense core vesicle

    ALİ CAN GÜMÜRDÜ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. YONGSOO PARK

  2. Mobil telefon kullanımına bağlı oluşan 900-1800 mhz radyo frekans dalgalarının meydana getirdiği elektromanyetik alanın iliak kanat kemik mineral yoğunluğuna etkisi

    The effect of electromagnetic fields on bone mineral density of iliac bone produced by 900-1800 mhz radio frequency waves dependent on cellular phone usage

    BEŞİR ANDAÇ AKSOY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Ortopedi ve TravmatolojiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Ortopedi ve Travmatoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. NEVRES HÜRRİYET AYDOĞAN

  3. Geçici olarak yığılan nötron yıldızlarının çekirdek soğumasının X-ışını verileriyle araştırılması

    Probing core cooling of transiently accreting neutron stars with X-ray data

    KAIYISAIER TUERXUNMAIMAITI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Astronomi ve Uzay Bilimleriİstanbul Üniversitesi

    Astronomi ve Uzay Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ KAI OLIVER SCHWENZER

  4. Yenidoğan yoğun bakımda bebeği yatan annelerin annelik memnuniyeti ve ilişkili faktörler

    Maternal experience of the mothers whose babies are in neonatal intensive care unit and related factors

    SEDA İLHAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Hemşirelikİstanbul Okan Üniversitesi

    Hemşirelik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURSAN ÇINAR

  5. Derin öğrenme tabanlı görüntü gürültü giderme için yoğun bağlantı kullanan yeni yaklaşımlar

    Densely connected structures in deep learning based image denoising

    VEDAT ACAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Elektronik ve Haberleşme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ENDER METE EKŞİOĞLU