Affinity of glycopeptide nanofibers to growth factors and their effects on cells
Büyüme faktörlerinin şekerli nanofiberlere afinitesi ve bu nanofiberlerin hücrelere etkileri
- Tez No: 472897
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MICHELLE MARIE ADAMS, YRD. DOÇ. DR. AYŞE BEGÜM TEKİNAY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Malzeme Bilimi ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 76
Özet
Büyüme faktörleri, doku yenilenmesi sırasında önemli görevler almaktadırlar. Bu nedenle büyüme faktölerinin etkili bir biçimde hedeflenen bölgeye ulaştırılması doku yenilenmesi çalışmaları için önem taşımaktadır. Büyüme faktörlerinin glikozaminoglikanlarla etkileşimleri, fonksiyonlarını doğru bir şekilde yerine getirmeleri için önemli bir basamaktır. Bu sebeple, glikozaminoglikan benzeri yapıların büyüme faktörlerinin sunulması için tasarlanan yapı iskelelerinde kullanımları doku yenilenmesi için umut vaat eden bir yaklaşımdır. Bu çalışmada, glikozaminoglikanların monomerlerine benzer şekerli peptit nanofiberlerin, vasküler endotelyal büyüme faktörü (VEGF), fibroblast büyüme faktörü (FGF-2) ve sinir büyüme faktörüne (NGF) olan afinitesi ve bu peptit nanofiberlerin hücrelere olan etkileri araştırılmıştır. Şeker içeren nanofiberler NGF'e kuvvetle bağlanma gösterirken, VEGF ve FGF-2 moleküllerine afinitelerinin daha az olduğu gözlemlenmiştir. VEGF ve FGF-2, heparin bağlanma domaini içerdiği ve heparinde yüksek miktarda sülfat molekülü bulunduğu için, bu nanofiberlerin yapısına sülfatlı peptit amfifil molekülünün eklenmesi, bu büyüme faktörlerine olan afinitesini artırmıştır. Büyüme faktörlerinin şekerli nanofiberlere afiniteleri göz önüne alınarak, bu nanofiberlerin endotel ve NGF'e yanıt veren PC-12 hücrelerine olan etkileri incelenmiştir. Sonucunda endotel hücreleri ekstra büyüme faktörüne ihtiyaç duymadan tüp benzeri yapılar oluşturmuş ve PC-12 hücreleri yüksek oranda nörit uzatmışlardır. Bu sonuçlar değerlendirildiğinde, üretilen şekerli yapı iskeleleri, yeni damar oluşumu gereken durumlarda ve periferik sinir yaralanmalarının onarımında, büyüme faktörlerinin etkili sunulması için in vivo çalışmalarda uygun birer platform sağlayabilirler.
Özet (Çeviri)
The development of scaffolds for growth factor delivery is a promising approach for tissue regeneration applications due to their crucial roles during regeneration. Growth factor secretion and interactions with glycosaminoglycans are essential steps for the regulation of cellular behavior. Therefore, glycosaminoglycan-mimetic scaffolds provide a great opportunity to modulate the effects of growth factor actions on cell fate. In this thesis, sugar-bearing peptide amphiphile molecules were characterized and tested for VEGF, FGF-2 and NGF affinity. ELISA-based affinity analyses revealed that glycopeptide nanofibers had high affinity to NGF; however, glycopeptides alone were not enough to interact efficiently with VEGF and FGF-2. Since VEGF and NGF contain heparin-binding domains, the addition of a sulfonated peptide amphiphile increased the affinity of the nanofiber network to these growth factors. Glycopeptide-sulfonate nanofibers were also found to promote in vitro tube formation through their VEGF and FGF-2 affinity. VEGF release profiles of HUVECs indicated that increasing concentration of VEGF may provide autocrine signaling and enhance tube formation without any exogenous pro-angiogenic factor addition. In addition, when NGF-responsive PC-12 cells were cultured on glycopeptide nanofibers, they extended their neurites to an extent comparable with a widely-used positive control molecule (poly-L-lysine). These results suggest that glycosaminoglycan-mimetic glycopeptide nanofiber networks can be used as efficient growth factor presentation platforms for tissue regeneration applications to induce angiogenesis or peripheral nerve regeneration.
Benzer Tezler
- Staphylococcus aureus klinik izolatlarında metisilin direncinin belirlenmesinde farklı yöntemlerin karşılaştırılması
Comparison of different methods for detection of methicillin resistance in clinical isolates of staphylococcus aureus
MURAT TELLİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2005
MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. AHMET BÜLENT SÜMERKAN
- Kortikosteroidlerin globuline (CBG) bağlanma eğiliminin üç boyutlu kanitatif yapı aktivite ilişkisi olarak elektron topolojik metodla (ETM) incelenmesi
Study of the binding affinity of for corticosteroid-binding globulin (CBG) using the electron topolojigalmethot (ETM) as three-dimensinonal quantitative structure-activty relationship
EMEL ÖZTÜRK
- Protein izolasyonu için immobilize metal afinite kromatografisi bazlı kesikli sistemlerin geliştirilmesi
Development of immobilized metal affinity chromatography based batch systems for protein isolation
BUKET ÇELİKKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Mühendislik BilimleriHacettepe ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SÜLEYMAN ALİ TUNCEL
- Veri madenciliği kullanarak ache enzimiyle etkileşen moleküllerin bağlanma eğiliminin tahmini
Prediction of binding affinity of molecules interacting with ache enzyme using data mining
MERVE YENEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolNecmettin Erbakan ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZLEM ERDAŞ ÇİÇEK
- 2-fenilindol türevlerinin göreceli bağlanma eğilimlerinin 6D QSAR analizi olarak CoMCET programıyla incelenmesi
Study of relative binding affinity of 2-phenylindole derivatives using CoMCET praograme as 6D QSAR analyse
KADER ŞAHİN