Comparison of drought stress response of potato varieties at the transcriptomic level
Farklı patates çeşitlerinin kuraklığa tepkilerinin transkriptom seviyesinde karşılaştırılması
- Tez No: 474237
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ZAHİDE NESLİHAN ÖZTÜRK GÖKÇE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Niğde Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 94
Özet
S.tuberosum L. esas olarak lifli kök sistemi nedeniyle kuraklığa duyarlıdır. Yüksek sıcaklık ve kuraklık dönemLeri verimin yaklaşık % 30 oranında düşürebilmektedir. Öte yandan patatesin kuraklık tepkimesi hakkında diğer bitkilerden, özellikle buğday ve model organzimalara kıyasladığımızda daha az bilgi bulunmaktadır. Yalnızca 12,000 patates cDNA klonu içeren mikrodizileme ile sınırlı sayıda çalışma vardır. Bu tezin amacı kuraklığa toleranslı ve kuraklığa hassas iki çeşit patates bitkisinde fizyolojik ve transkriptomdeki değişikliklerin kuraklık uygulamasının sonunda kuraklığa tepkimelerini karşılaştırılmaktadır. Kuraklik stresinin fizyolojik etkileri iki patates çeşidinde değerlendirilmiş ve kuraklık stresine tepki olarak transkriptlerdeki ve metabolik yolaklardaki değişiklikler yüksek verimLi dizileme ile elde edilen yaprak transkriptomunun biyoinformatik analizleri kullanarak araştırıldı. Kuraklığa toleranslı ve kuraklığa hassas iki patates çeşidinin yaprak transkriptomLarı kullanılarak metabolik farklılıklar belirlenmiş ve karşılaştırılmıştır. Kuraklık toleranslı ve hassas patates çeşitleri su eksikliğine maruz bırakılmış ve fizyolojik ve transkriptomik düzeyde değerlendirilmiştir. Her iki çeşitteki örneklerinin yaprak transkriptomLarını belirlemek için yeni nesil dizileme yaklaşımı uygulanmıştır.
Özet (Çeviri)
Solanum tuberosum L. is sensitive to drought mainly due to its fibrous root system. High temperature and drought episodes may cause yield decrease to almost 30%. Data on drought stress response of potato when compared to other crops, especially wheat, and model organisms, on the other hand is quite limited. There are a few works limited to microarrays that include only 12,000 potato cDNA clones. Therefore the aim of thesis is to differentiate physiological and transcriptomic changes in response to drought in tolerant and sensitive potato varieties. Physiological effects of drought stress were evaluated in two potato varieties and the changes in transcripts and metabolic pathways in response to drought stress were investigated via bioinformatics analysis of leaf transcriptome generated by next generation sequencing. Leaf transcriptomes were used to compare drought tolerant and sensitive potato varieties in response to water stress to identify metabolic differences between the varieties. Next generation sequencing approach was performed to identify leaf transcriptomes of drought stressed and control samples of both cultivars.
Benzer Tezler
- Proteome analysis of Brachypodium distachyon leaves under drought stress
Kuraklık stresi altında Brachypodium distachyon yapraklarının proteom analizi
ÖZGE TATLI
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Kuraklık toleransları farklı olan cicer (nohut) genotiplerinde askorbat ve glutatyon uygulamalarının antioksidan sistem üzerine etkilerinin araştırılması ve genomik varyasyonlarının karşılaştırılması
Investigation of effects on antioxidant system of ascorbate and glutathione treatments to chickpea genotypes which have different tolerance to drought, and comparison of genomic variations
SERTAN ÇEVİK
- Bazı sert çekirdekli meyve anaçlarının kuraklık, sıcaklık stresi ile geri kazanım uygulamalarına morfolojik, fizyolojik ve biyokimyasal tepkilerinin sürdürülebilirlik açısından incelenmesi
Investigation of sustainability of the responses, morphologicalphysiological and biochemical to recovery applications withdrought, heat stress of some stone fruit rootstocks
MERAL DOĞAN
- Evaluation of drought tolerance of Triticum araraticum and Triticum timopheevii: A neglected GGAA genome
Triticum araraticum ve Triticum timopheevii'nin kuraklık toleransının değerlendilmesi: Göz ardı edilen GGAA genomu
ZAIN ALI
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
ZiraatÇukurova ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAKAN ÖZKAN
- Kuraklık stresinde miRNA cevaplarının domateste araştırılması
Investigation of miRNA responses of tomato under drought stress
AYBÜKE EKŞİOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Biyolojiİstanbul Kültür ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZGE ÇELİK