Asmada (Vitis vinifera L.) mapk genlerinin real-time PCR ile ifade analizi
Expression analysis of mapk genes in Vitis vinifera using real-time PCR
- Tez No: 479766
- Danışmanlar: DOÇ. DR. BİRSEN ÇAKIR AYDEMİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Ziraat, Biotechnology, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 78
Özet
MAPK genleri, tüm ökaryot canlılarda evrimsel süreçte korunmuşlardır. Genel olarak, MAPK'lar sitokinez, farklılaşma, çoğalma, hücre gelişimi, abiyotik ve biyotik yanıt, patojen savunması ve hormonal tepkiler gibi temel fonksiyonlarda önemli rol oynayan çok yönlü protein ailesidir. Bu çalışmada, tanelerde farklı gelişim dönemlerinde, yapraklar, ve sülüklerden toplam RNA'lar izole edilmiş, ve bu RNA'lardan cDNA sentezi gerçekleştirilmiştir. VvMAPKK ve VvMAPKKKK alt ailelerine ait genlerin ifade analizi için bu genlere özgü toplam 12 primer (5 MAPKK, 7 MAPKKKK) dizayn edilmiş ve bu primerler kulanılarak Real-time PCR analizi gerçekleştirilmiştir. VvMAPKK ve VvMAPKKKK genlerinin ifadeleri farklı tane gelişim dönemlerinde regüle olmuş, olgunlaşma döneminde bütün genlerin ifade düzeylerinde azalma gözlemlenmiştir. VvMAPKK ve VvMAPKKKK genlerinin ifade profilleri ile, meyvede tam olgunlaşma döneminde, hücre gelişimi ve farklılaşmasının baskılanması arasındaki korrelasyon saptanmıştır. Bu genlerin tanelerin büyüme ve gelişme dönemlerinde fitohormonlar ile bağlantılı yolaklarda rol oynayabileceği düşünülmektedir. Sonuç olarak, bu çalışma VvMAPKK ve VvMAPKKKK proteinlerinin gelişim dönemlerinde üstlendikleri roller ve yer aldıkları fizyolojik olayların belirlenmesi açısından bir ön bilgi sağlamaktadır.
Özet (Çeviri)
MAPK genes are evolutionary highly conserved ancient cascades in all eukaryotes. Generally, MAPKs as a versatility protein family, control cell's fate by playing important roles in prominent functions including cytokinesis, differentiation, proliferation, cell development, abiotic and biotic responses, pathogen defense, hormonal responses. Moreover, these ubiquitous proteins have crosstalk ability with different pathways and also within each other which makes the study of them so complicated. In this research, total RNA from berries, leaves, clusters and tendrils during different developmental stages were extracted and after purification and cDNA synthesis their relative expression were analyzed with totally 12 primers (5 MAPKKs and 7 MAPKKKKs) using Real-time PCR. The expression of both VvMAPKK and VvMAPKKKK sub-family genes was regulated by growth and development in berries and downregulated during the ripening stage which can be related to decreased level of cell-development and cell-proliferation and consequently, decreased level of extra-cellular signals. All together this work provides a background to research about physiologic roles of VvMAPKKs and VvMAPKKKKs in different development stages. Besides, these proteins can play a role in the production of phytohormones, and different related cascades.
Benzer Tezler
- Asmada (Vitis vinifera L.) CRISPR/Cas9 genom düzenleme teknolojisi ile küllemeye (Erysiphe necator) dayanıklı bitkilerin geliştirilmesi
Development of powdery mildew (erysiphe necator) resistant plants in grapevine (Vitis vinifera l.) using CRISPR/Cas9 genome editing technology
SELCEN DOĞAN
Doktora
Türkçe
2024
BiyoteknolojiAkdeniz ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEDİM MUTLU
- Asmada (Vitis vinifera L.) erkencilikten sorumlu aday genleringenom düzeyinde belirlenmesi
Identification of candidate genes responsible for earlyripening in grape (Vitis vinifera L.) at genome level
ONUR ERGÖNÜL
Doktora
Türkçe
2023
BiyoteknolojiTekirdağ Namık Kemal ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İLKNUR KORKUTAL
PROF. DR. ALİ ERGÜL
- Asmada (Vitis vinifera L.) SSR markörleri kullanarak Botrytis cinerea'ya dayanıklık genlerinin kantitatif özellik lokus (QTL) haritalaması
Quantitative trait locus (QTL) mapping of resistance genes to Botrytis cinerea using SSR markers in grape (Vitis vinifera L.)
AYFER DALDAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyoteknolojiAkdeniz ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İLKNUR POLAT
- Asmada (Vitis vinifera L.) kromozom katlama uygulamaları ile otopoliploidinin uyarılması ve organogenez
Induction of autopolyploidy and organogenesis via chromosome doubling treatments in grapevine (Vitis vinifera L.)
ELİF CEREN PEHLİVAN
Doktora
İngilizce
2020
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BİRHAN KUNTER
- Asmada (Vitis vinifera L.) LEA2 ve WOX genlerinin biyoinformatik analizleri
Bioinformatics analysis of LEA2 and WOX genes in grapevine (Vitis vinifera L.)
MOHAMMAD SALEEM
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyomühendislikManisa Celal Bayar ÜniversitesiTarımsal Bilimler Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİNE DİLŞAT YEĞENOĞLU