Geri Dön

Sığır mastitislerine neden olan stafilokok türlerinin maldı-tof ms ile identifikasyonlarının yapılması

Identification of the staphylococcus species which cause cattle mastitis with maldi-tof MS

PDF İndir

  1. Tez No: 482961
  2. Yazar: TANSU TANIR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ŞÜKRÜ KIRKAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Adnan Menderes Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 85

Özet

Bu çalışmada, mastitisli sütlerden Stafilokok türlerinin izolasyonu ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi, izole edilen suşların API, VITEK, MALDI-TOF MS gibi ticari identifikasyon metodlarıyla tiplendirilmeleri ve sonuçların karşılaştırılması, tiplendirmenin ardından 16S rRNA primerleri ile yapılacak olan PCR sonucu Stafilokokal etkenlerin sekans analizi ile birlikte doğrulanması amaçlanmıştır. Aydın ili ve çevresindeki süt sığırcılığı işletmelerinde bulunan hayvanlardan klinik mastitis problemi gösterdiği belirlenen hayvanlara ait sütler steril koşullarda alınan, toplam 100 adet süt örneği Stafilokok varlığı yönünden incelenmiştir. Stafilokok türlerinin identifikasyonları biyokimyasal yöntemlere ilave olarak VITEK 2, VITEK (MALDI-TOF) MS, PCR ve Sekanslama ile yapılmıştır. Süt örneklerinin % 34'ünden Stafilokok izolasyonu yapılmıştır. Yapılan identifikasyon çalışmaları sonucunda, izolatların 7 (% 20,60)'si Staphylococcus aureus, 10 (% 29,40)'u Staphylococcus simulans, 8 (% 23,50)'i Staphylococcus epidermidis, 4 (% 11,80)'ü Staphylococcus saprophyticus, 2 (% 5,90)'si Staphylococcus chromogenes, 2 (% 5,90)'si Staphylococcus hyicus ve 1 (% 2,95) Staphylococcus arlettae olarak tiplendirilmiştir. Yapılan antibiyogram testi sonucunda identifiye edilen 34 Staphylococcus sp. izolatının Cefoxitin, Siprofloksasin, Vankomisin, Tigesiklin ve Fosfomisine % 100 ve Linezolide % 85.2 oranlarında duyarlı; Klindamisine %100 ve Tetrasikline %82.4 oranlarında dirençli olduğu görülmektedir. Sonuç olarak; MALDI-TOF MS proteomik biyokütle spektrofotometri yönteminin güvenilirliği doğrulanmış ve uygulanabilir olduğu ortaya koyulmuştur.

Özet (Çeviri)

The aim of this study was identification and antibiotic susceptibility of Staphylococcus species from mastitic milk, comparison of results by using commercial identification methods such as API, VITEK, MALDI-TOF MS, PCR and confirmed Staphylococcal agents with sequence analysis. A total of 100 milk samples taken in sterile conditions were investigated for the presence of Staphylococcus, which were found to have clinical mastitis problems in animals in the milk province of Aydın province and surrounding areas. Identification of Staphylococcus species was performed by VITEK 2, VITEK (MALDI-TOF) MS, PCR and sequencing in addition to biochemical methods. Staphylococcus sp. was isolated from 34 % of the milk samples. Seven (20.60 %) of the isolates were Staphylococcus aureus, 10 (29.40 %) were Staphylococcus simulans, 8 (23.50%) were Staphylococcus epidermidis and 4 (11.80 %) Staphylococcus saprophyticus, 2 (5.90 %) were Staphylococcus chromogenes, 2 (5.90 %) were Staphylococcus hyicus and 1 (2.95 %) were Staphylococcus arlettae. As a result of the antibiogram test, 34 Staphylococcus sp. isolates were sensitive to Cefoxitin, Ciprofloxacin, Vancomycin, Tigecycline and Phosphomycin in the ratio of 100 % and resistant to Linezolide, Clindamycin and Tetracycline in the ratio of 85.2%, 100 % and 82.4% respectively. As a result; the reliability of the MALDI-TOF MS proteomic biomass spectrophotometry method has been demonstrated to be verifiable and feasible.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    242024

    Sığır mastitislerinden izole edilen stafilokoklarda metisilin direnci ve slaym pozitifliği

    Methicillin resistance and slime positivity of staphylococci isolated from bovine mastitis

    SEYHAN KAYNARCA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    MikrobiyolojiAdnan Menderes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ

  2. Tez No

    715579

    Mastitis kökenli stafilokok suşlarının ebselene ve antibiyotiklere karşı duyarlılık durumlarının araştırılması

    Investigation of susceptibility of mastitis originated staphyloccus strains to ebselen and antibiotics

    GİZEM PİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ARZU FINDIK

  3. Tez No

    247367

    Sığır mastitislerinden izole edilen stafilokok suşlarının beta-laktamaz aktivitesi ve bazı antibiyotiklere karşı duyarlılıklarının saptanması

    To determine beta-lactamase activity and resistant against some antibiotics of stafilococcus strains isolated from bovine mastitis

    DURMUŞ ALİ SEVİNTİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    MikrobiyolojiKafkas Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. MİTAT ŞAHİN

  4. Tez No

    247636

    Sığır mastitislerinden izole edilen stafilokok suşlarının betalaktamaz aktivitesi ve bazı antibiyotiklere karşı duyarlılıklarının saptanması

    Başlık çevirisi yok

    DURMUS ALİ SEVİNTİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Veteriner HekimliğiKafkas Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MİTAT ŞAHİN

  5. Tez No

    123819

    Sığır mastitislerinden izole edilen stafilokokların yüzey özellikleri

    Surface characteristics of staphylococci isolated from bovine mastitis

    ERSAN KORUDAĞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    Veteriner HekimliğiAnkara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. K. SERDAR DİKER

Geri Dön