Geri Dön

Sporadik kolorektal kanser ile ilişkilendirilmiş aday tekli nükleotit polimorfizmlerinin Türk popülasyonu için değerlendirilmesi

Evaluation of candidate snps associated with sporadic colorectal cancer for Turkish population

PDF İndir

  1. Tez No: 485169
  2. Yazar: ZÜLAL BİLİCİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. HİLAL ÖZDAĞ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Onkoloji, Biotechnology, Genetics, Oncology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 86

Özet

Kanser, günümüzde tüm dünya ve Türkiye çapında yaygın olarak görülen, çeşitli genetik, epigenetik ve çevresel faktörlerin etkisi ile ortaya çıkan ve ölüme sebep olan bir hastalıktır. Kolorektal kanserin (KRK) görülme sıklığı Türkiye genelinde üçüncü, erkeklerde üçüncü ve kadınlarda ise ikinci sırada yer almaktadır. Kolorektal kanser içerisinde ise sporadik kolorektal kanser %70-80 oranına sahiptir. Genom boyu asosiyasyon çalışmaları (GBAÇ), kompleks hastalıkların ortaya çıkmasında rol oynayan genetik bileşenlerin belirlenmesi için kullanılan bir yöntemdir. Bu tez çalışmasında, Avrupa popülasyonlarında geniş örneklemler üzerinde yürütülmüş GBAÇ'larda KRK ile yüksek istatistiki güç ve anlamlılık ile ilişkilendirilmiş olan TNP'lerin (Tekli Nükleotit Polimorfizmleri) Türk popülasyonda da sporadik KRK ile ilişkili olup olmadığının ortaya çıkarılması hedeflenmiştir. Bu kapsamda olduğu belirlenen 9 TNP 1019 sporadik kolorektal kanser hastası ve 948 kontrolden oluşan örneklem için Kompetitive Allele Specific PCR (KASP) teknolojisi ile değerlendirilmiştir. Tez çalışması sonucunda, 7 TNP (rs1321311, rs4939827, rs16892766, rs3802842, rs10795668, rs4444235 ve rs961253) Türk toplumu için sırası ile 2x10-4, 7x10-3, 1x10-4, 4x10-3, 1,79x10-4, 1,62x10-4, 8x10-4 p değerleri ile anlamlı bulunmuştur. Bu tez çalışması ile Avrupa popülasyonlarında sporadik kolorektal kanser ile ilişkilendirilmiş TNP'lerin bir kısmının Türk toplumu için valide olduğu ilk kez gösterilmiştir.

Özet (Çeviri)

Cancer, a disease caused by the effects of various genetic, epigenetic and environmental factors, is widespread all over the world and Turkey today. Colorectal cancer (CRC) is the third most seen cancer in Turkey. It is the third most seen cancer in males and second in females. 70-80% of CRC cases are known to be sporadic. Genome wide association studies are used to identify genetic components that play a role in the emergence of complex diseases. Nine SNPs (Single Nucleotide Polymophizms) are selected among SNPs previously shown to be associated with CRC with high statistical significance in European population. The association between CRC and these 9 SNPs were analysed on 1019 sporadic colorectal cancer patients and 948 controls from Turkish population. As a result of the thesis study, 7 SNPs (rs1321311, rs4939827, rs16892766, rs3802842, rs10795668, rs4444235 ve rs961253) were found to be associated with CRC (p=2x10-4, 7x10-3, 1x10-4, 4x10-3, 1,79x10-4, 1,62x10-4, 8x10-4, respectively) for Turkish population. In this study SNPs associated with sporadic CRC in European population have been validated for the Turkish population for the first time.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    485159

    Sporadik kolorektal kanser ile ilişkilendirilmiş aday genlerin incelenmesi

    Investigation of candidate sporadic colorectal cancer related genes

    ÖZGE CUMAOĞULLARI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HİLAL ÖZDAĞ

  2. Tez No

    415008

    Kolorektal karsinoma ve öncü lezyonlarında mikrosatellit instabilitesinin immünhistokimyasal olarak değerlendirilmesi

    Immunohistochemical evaluation of microsatellite instability in colorectal carcinoma and precursor lesions of colorectal carcinoma

    SEHER YÜKSEL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    PatolojiAnkara Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BERNA SAVAŞ

  3. Tez No

    819541

    Generation of patient specific iPSC-derived healthy organoids from primary colorectal cancer patients with/without metastasis and transcriptome analysis

    Metastazlı ve metastazsız kolorektal kanser hastalarının indüklenmiş pluripotent kök hücrelerinden sağlıklı organoidlerinin geliştirilmesi ve transkriptom analizi

    ZEYNEP BÜŞRA ÖZER

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Kök Hücre ve (Rejeneratif) Yenileyici Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KAMİL CAN AKÇALI

  4. Tez No

    301039

    Sporadik kolorektal kanser vakalarında genom ebadında tek nükleotit polimorfizm profilinin belirlenmesi ile yeni genetik yatkınlık genlerinin ve kanserin gelişmesinde etken olan genlerin belirlenmesi

    Determination of new genetic predisposition genes and genes involved in cancer progression through genomewide SNP profiling in sporadic colorectal cancer cases

    DİLAY ÇIĞLIDAĞ DÜNGÜL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HİLAL ÖZDAĞ

  5. Tez No

    352469

    Sporadik kolorektal kanser vakalarında genom ebadında kopya sayısı değişimlerinin ve transkriptom profilinin belirlenmesi ile kanserin gelişmesinde ve ilerlemesinde etken yeni genlerin tanımlanması

    Identification of new gene and gene groups involved in cancer development and progression through genome-wide copy number variation analysis and transcriptome profiling in sporadic colorectal cancer cases

    NEVİN BELDER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HİLAL ÖZDAĞ

Geri Dön