Geri Dön

Genetic structures of Salix alba and Salix excelsa populations from two major river systems in Turkey

Türkiye' nin iki büyük nehir sisteminde bulunan Salix alba ve Salix excelsa türlerinin genetik yapıları

  1. Tez No: 489406
  2. Yazar: FUNDA ÖZDEMİR DEĞİRMENCİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ZEKİ KAYA
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 151

Özet

Salix alba, yenilenebilir enerji potansiyeli ile, sağlıklı bir nehir ekosisteminin önemli bir bileşeni olarak, Türkiye'de bulunan gösterge türlerdendir. Dünyadaki nehir temizliği ve ekosistem rehabilitasyon uygulamalarında en etkili fitoremediasyon aracı olarak kullanılır. Türkiye'deki iki nehir sisteminde (Göksu ve Kızılırmak Nehirleri) bulunan Salix alba popülasyonlarında etkin koruma ve ıslah programlarına bilgi sağlamak için 20 mikrosatellit belirteci ile populasyonların genetik yapısı çalışıldı. Salix excelsa, Salix alba' nın sinonimi olarak kullanıldığından ve S. alba' dan çok iyi ayrılmadığından, dört popülasyona ait 112 genotip S. alba Göksu Nehri'nden, beş popülasyona ait 147 genotip Kızılırmak Nehri'nden örneklenmiştir. Yalnızca bazı lokuslar, belirli bir populasyona ait null alellerin olduğunu göstermiştir. Alt popülasyonlarda önemli bir bağlantı dengesizliği ve klonal çoğalma gözlemlenmemiştir. Belirteçlerin etkinliği, Allelik zenginlik, Polimorfizm Bilgi İçeriği, Tanımlama Olasılığı, Shannon İndeksi ve beklenen heterozigotluk değerleri tüm lokusların oldukça polimorfik olduğunu gösterdi. Genetik yapı analizi, iki farklı nehir havzasındaki S. alba popülasyonlarının iki farklı kurucu popülasyonuna yüksek ait olma değeri ile sahip olduklarını açık bir şekilde ortaya koymuştur. Tüm popülasyonlar orta seviyede genetik çeşitliliğe sahiplerdir. En yüksek Fst değerleri en düşük sayıdaki göç eden birey sayısı ile birlikte Kızılırmak alt popülasyonlarında görülmüştür. Dolayısıyla, bu popülasyonlar genetik olarak diğer popülasyonlara daha uzaktır. Gruplama, Bayes, PCoA analiz ve AMOVA, iki nehrin dokuz farklı lokasyonundan 259 genotipi nehir sistemi içinde yüksek düzeyde, nehirler arasında daha düşük düzeyde gen akışı nedeniyle iki gruba ayırmıştır. Elde edilen veriler gelecek ıslah programlarında, S. alba türünün genetik kaynaklarının etkili korunma, yönetim ve kullanımında faydalı olacaktır. Artan habitat bozulması ve parçalanması dikkate alındığında, etkin in situ ve ex situ koruma çalışmaları, türün genetik potansiyelini korumak için gerçekleştirilmelidir.

Özet (Çeviri)

Salix alba (white willow) is an indicator species and an important component of an healthy riparian ecosystem with great renewable energy potential in Turkey. It is used as one of the most effective phytoremediation tool in the world for river cleaning and ecosystem rehabilitation efforts. Genetic structure of Salix alba populations in two river systems (Göksu and Kızılırmak Rivers) in Turkey were studied with the use of 20 microsatellites markers to provide information for effective conservation and breeding programs. Since Salix excelsa was used an a synonym of Salix alba and was not well differentiated from S. alba, 112 genotypes of S. alba belonging to the Göksu River from four populations and 147 genotypes belonging to the Kızılırmak River from five populations were sampled. Only some loci showed evidences of null alleles that are specific to a certain population. No significant linkage disequilibrium and clonal duplication were detected in populations. Effectiveness of markers were evaluated by Allelic richness, Polymorphic Information Content, Probability of identity, Shannon Index and expected heterozygosity measures which revealed that all loci were found to be highly polymorphic. Genetic structure analysis clearly revealed that S. alba populations in two different river systems represent two different founder populations with very high membership values. All populations maintain moderate level of genetic diversity. The highest pairwise Fst values with the lowest number of migrants were obtained from the Kızılırmak downstream populations. Therefore, these populations were genetically most distant to the remaining populations. Cluster, Bayesian, PCoA analysis, and AMOVA clustered 259 genotypes from nine different locations of two rivers to two major groups because of high level of gene flow within river systems, but less gene flow between river systems. The genetic structure data of the studied river systems will be useful for future breeding programmes, efficient conservation, management and utilization of genetic resources of S. alba. Under increasing habitat deterioration and fragmentation, efficient in situ and ex situ conservation studies should utilize and conserve the species' genetic resources.

Benzer Tezler

  1. Differential impacts of habitat fragmentation on genetic structure of two important riparian species (Salix alba & Populus nigra)

    Habitat fragmentasyonunun nehir ekosisteminin iki önemli ağaç türünün (Salix alba & Populus nigra) genetik yapıları üzerine farklı etkileri

    BİLGE DURGUT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    GenetikOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEKİ KAYA

  2. Çukurova bölgesinde bulunan kum sineği (Diptera: Psychodidae) populasyonlarının mevsimsel dinamiği ve genetik yapısı

    Seasonal dynamics and genetic structures of the sand fly (Diptera: Psychodidae) populations in Çukurova region

    ASLI BELEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SALİH BÜLENT ALTEN

  3. Determination of genetic diversity in Salix caprea populations from the Coruh river watershed

    Çoruh havzasında doğal yayılış gösteren Salix caprea populasyonlarının genetik çeşitliliğinin belirlenmesi

    YASİN TOKDEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEKİ KAYA

  4. A systematic approach with machine learning and a genetic algorithm for the microwave-assisted synthesis of antibacterial ZIF-8 nanoparticles

    Sistematik bir yaklaşım ile makine öğrenimi ve genetik algoritma kullanarak antibakteriyel ZIF-8 nanopartiküllerin mikrodalga yardımlı sentezi

    NİDA ÜK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Kimya Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SADRİYE OSKAY

  5. Chitosan microspheres and films used in controlled release

    Kontrollü salımda kullanılan kitosan mikroküreler ve filmler

    BEYZA UYLUKÇUOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2003

    KimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. ELVAN YILMAZ

    PROF.DR. NESRİN HASIRCI