Geri Dön

Meme kanserinde pık3ca ve tp53 gen mutasyonları ile sall4, pten ve pık3r1 gen ekspresyonları arasındaki ilişkinin belirlenmesi

Detection of pik3ca and tp53 gene mutations and association with sall4, pten and pik3r1 gene expression levels in breast cancer

PDF İndir

  1. Tez No: 508106
  2. Yazar: EBUBEKİR DİRİCAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA AKKİPRİK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Biyobelirteçler-tümör, Fosfatidilinozitoller, Gen ifadesi, Genler, Meme neoplazmları, Moleküler genetik, Mutasyon, Neoplazmlar, Prognoz, Sinyal nakli, Biomarkers-tumor, Phosphatidylinositols, Gene expression, Genes, Breast neoplasms, Molecular genetic, Mutation, Neoplasms, Prognosis, Signal transduction
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Marmara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: PI3K sinyal yolağı ve TP53 geni mutasyonlarının frekansı meme kanserinde yüksek olup, kanser gelişiminde önemli rol almaktadır. Bu çalışmada PIK3CA ve TP53 mutasyonlarının analizi ile PIK3R1, PTEN ve SALL4 gen ekspresyonu ve hastaların klinik parametreleri arasındaki ilişkinin araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Meme kanser örneklerinde PIK3CA ve TP53 gen mutasyonları HRM analizi ve sonrasında Sanger dizileme, PIK3R1, PTEN ve SALL4 genlerinin ekspresyon düzeyleri ise RT-PZR yöntemleri ile analiz edilmiştir. Bulgular: HRM analiziyle örneklerin 37/79'sinde PIK3CA ve 108/145'inde ise TP53 geni mutasyonları olabileceği gösterildi. Sanger dizilemeyle doğrulandığında, PIK3CA geninde 33(%42) ve TP53'te ise 55(%38) örnekte mutasyon saptandı. PIK3CA geni mutasyonlarının frekansı ER (+); TP53 ise N0, ER (+) ve HER2 (-) tümör örneklerinde yüksek ve anlamlı olduğu belirlendi (p=0.0083; p=0.0295; p=0.0078; p=0.0005). PIK3R1 ve PTEN gen ekspresyon seviyeleri tümörlü dokularda, sağlıklılara oranla daha yüksek, fakat SALL4 tümörlülerde düşük eksprese olduğu; TP53 mutasyonu taşıyanlarda ise, PIK3R1 gen ekspresyon seviyesinin yabanıl tiplere oranla düşük ekspresyon profili gösterdiği ve anlamlı olduğu gösterildi (p<0.0001; p=0.0059; p=0.0378; p=0.0169). PIK3CA mutasyonu taşıyan örneklerde PIK3R1, PTEN ve SALL4 ekspresyon düzeylerinin yüksek olduğu, ama bunun anlamlı bir fark olmadığı gösterildi (p=0.1561; p=0.7119; p=0.1684). PIK3R1 ekspresyon seviyesi ile G3 histolojik derece, ER (+), PR (+) ve HER2 (+) ve PTEN ekspresyonu ile ER (+) klinik parametreler arasında anlamlı farklar belirlendi (p=0.0030; p=0.0010; p=0.0019; p=0.0272; p=0.0048). SALL4, ER (+) hastaların %62'sinde amplifiye olmasına rağmen, anlamlı bir ilişki saptanamadı (p=0.0799). Sonuçlar: Bulgularımız, gelecekte PIK3CA, PTEN, SALL4, TP53 ve PIK3R1 genlerine meme kanserinde dikkat edilmesi gerektiği ve potansiyel prognoztik biyo-belirteç olabileceklerini göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Aim: In breast cancer (BCa) the frequency of PI3K signaling pathway and TP53 gene mutations are high and have role cancer development. The aim of the present study was to assess PIK3CA and TP53 mutations and PIK3R1, PTEN and SALL4 gene expression analysis and correlation with clinical parameters. Methods: PIK3CA and TP53 gene mutations in BCa samples were analyzed by HRM analysis followed by Sanger sequencing, and the expression levels of PIK3R1, PTEN and SALL4 genes were evaluated by RT-PZR methods. Results: With HRM analysis were showed that PIK3CA and TP53 mutations may be respectively 37/79 and 108/145 of samples. After Sanger sequencing, PIK3CA and TP53 gene mutations defined respectively 33 (42%) and 55 (38%) in samples. The frequency of PIK3CA mutations were high in ER (+) and TP53 gene mutations were high N0, ER (+) and HER2 (-) tumor samples and have significant (p=0.0083; p=0.0295; p=0.0078; p=0.0005). PIK3R1 and PTEN gene expression levels were higher in tumor than healthy tissue (p<0.0001; p=0.0059). But, SALL4 gene expression level was lower in tumor tissue (p=0.0378).With TP53 mutations patients, PIK3R1 gene expression level was lower than wild type patients and have significant (p=0.0169). With PIK3CA mutations patients, PIK3R1, PTEN and SALL4 gene expression levels were higher than wild type patients and have no significant (p=0.1561; p=0.7119; p=0.1684). PIK3R1 and PTEN expression levels have significant respectively in G3 histological grade, ER (+), PR (+), HER2 (+); and ER (+) (p=0.0030; p=0.0010; p=0.0019; p=0.0272; p=0.0048). Although SALL4 amplified in 62% of ER (+) patients and have no significant (p=0.0799). Conclusion: Our findings suggested that PIK3CA, PTEN, SALL4, TP53 and PIK3R1 genes should also be considered, and that these could be potential prognostic biomarkers in BCa patients.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    697977

    Herediter meme kanseri olgularında hücre sinyal iletiminde görev alan genlerdeki varyasyon sıklıklarının belirlenmesi ve tümör gelişimine etkisinin araştırılması

    Determination of variation frequencies of genes involved in cell signal transduction and investigation of its effect on tumor development in hereditary breast cancer cases

    CANSU UĞURTAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    GenetikKocaeli Üniversitesi

    Tıbbi Genetik ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NACİ ÇİNE

  2. Tez No

    887266

    Variant detection in inflammatory diseases

    İnflamatuvar hastalıklarda varyant belirlenmesi

    GİZEM ALKURT

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

  3. Tez No

    900755

    Premenopozal ve postmenopozal dönem meme kanser olgularında genomik varyasyon analizi

    Genomic variation analysis in premenopausal and postmenopausal breast cancer cases

    İBRAHİM HALİL ERDOĞDU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Sağlık EğitimiDokuz Eylül Üniversitesi

    Moleküler Patoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DUYGU GÜREL

  4. Tez No

    660750

    Meme kanserinde sık görülen gen mutasyonlarının tamoksifene yanıt ile ilişkisi ve prognostik önemi

    The relationship of common gene mutations in breast cancer with response to tamoxifen and its prognostic importance

    TUBA AVCILAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    GenetikMarmara Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. AHMET İLTER GÜNEY

  5. Tez No

    996090

    Meme kanseri kök hücrelerinde telomeraz inhibitörü BIBR1532 kullanımının otofajiyle ilişkisi

    Relationship of telomerase inhibitor BIBR1532 use with autophagy in breast cancer stem cells

    SİNEM ASLAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Tıbbi BiyolojiEge Üniversitesi

    Kök Hücre Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NUR SELVİ GÜNEL

Geri Dön