Psorodonotus venosus ve Anterastes babadaghi ( Orthoptera, Ttettıgonııdae ) türlerinde total mitokondriyal genom dizileri ve gen yerleşimlerinin belirlenmesi
Determination of total mitogenom sequences and gene location in Psorodonotus venosus ve Anterastes babadaghi ( Orthoptera, Tettigoniida )
- Tez No: 513662
- Danışmanlar: PROF. DR. BATTAL ÇIPLAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Zooloji, Biology, Genetics, Zoology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 77
Özet
Mitokondriyal genom (mitogenom) dizileri bir dizi nedenle yakın zamanda populasyon genetiği, filogeni, filocoğrafya ve benzeri evrimsel çalışmalarda yayın olarak başvurulan veri kaynakları arasındadır. Orthoptera Insecta'nın en fazla tür içeren takımlarından biridir ve özellikle son 2-3 yıl içerisinde çok sayı türün mitogenomu çıkarılmıştır. Sunulan tez çalışması Tettigoniinae (Orhoptera, Tettigoniidae) altfamilyasına ait Psorodonotus venosus ve Anterastes babadaghi türlerinin mitogenom dizilerinin yeni nesil dizileme yöntemi ile üretilmiş ve biyoinformatik yaklaşımlarla değerlendirilmiş verilerini içermektedir. Total mitogenom uzunlukları Psorodonotus venosus türünde 15842 baz çifti ve Anterastes babadaghi türünde 15883 baz çifti olarak saptanmıştır. Diğer ökaryotların çoğu-nun mitogenomlarına benzer şekilde bu iki türün mitogenomu 22 tRNA geni, 2 rRNA geni, 13 protein kodlayan gen ve bir A+T'ce zengin bölgeden oluşmaktadır. İki türün mitogenomunun 37 geninin yerleşimi atasal böcek mitogenomu olarak varsayılan Pancrustaceae mitogenomundaki yerleşime sahiptir. Protein kodlayan genlerde ortalama AT/GC oranı Psorodonotus venosus türünde % 68/32 ve Anterastes babadaghi türünde ise % 70/30 olarak hesaplanmıştır. Tez verileri şu sonuçlara işaret etmiştir: (i) Her iki türün mitogenomları toplam baz sayısı, ve gen sayısı ve içeriği yönüyle çokhücreliler için genel mitogenom tipi olarak tanımlanan ile aynı özelliklere sahiptir, (ii) Tettigoniinae altfamilyasının temsilcileri olan bu iki tür atasal altıüyeli gen yerleşimine sahiptirler, (iii) şimdiye kadar çalışılmış diğer türleri de dikkate alındığında Tettigoniinae altfamilyasında mitogenom gen yerleşimi korunmuş görünmektedir, (iv) her iki tür diğer orthopterlerde olduğu gibi AT ağırlıklı bir genoma sahiptir ve tRNA genlerinin uzunlukları, antikodonları ve komşu genlerle çakışma veya kodlanmayan ara dizilere sahip olma bakımından ve yine protein kodlayan genlerin uzunluk, başlama ve bitiş kodonları, komşu genlerin çakışması veya kodlanmayan baz dizilerine sahip olması altfamilya için tipik örüntülere sahiptir.
Özet (Çeviri)
DNA sequences of the mitochondrial genome frequently have been used as one of the main data sources in population genetics, phylogeny, phylogeography and other similar evolutionary studies. Orthoptera is one of the most species rich order of Insecta and mitochondrial genome of several species have been studies especially during last 2-3 years. This thesis includes data on mitochondrial genome of Psorodonotus venosus ve Anterastes babadaghi belonging to Tettigoniinae (Orhoptera, Tettigoniidae) obtained via next generation sequencing and evaluated by bioinformatics approaches. The total mitogenome of Psorodonotus venosus was 15842 base pairs and that of Anterastes babadaghi was 15883 base pairs. As in the most of the other eukaryotes the mitochondrial genome of these two species consists of 22 tRNA genes, 2 rRNA genes, 13 protein coding genes and the A+T rich control region. The arrangement of 37 genes in the mitochondrial genome of these two species is as in gene location in Pancrustacea which also considered as ancestral gene arrangement of Insecta. The AT/GC content in protein coding genes was % 68/32 and % 70/30 in Psorodonotus venosus and Anterastes babadaghi respectively. Data of this study indicates following results: (i) mitogenome of both species exhibit characteristics of multicelular organisms in several aspects, (ii) The gene location of mitochondrial genome of these two species representing Tettigoniinae is as in other hexapods, (iii) and this indicate that no gene arrangement has occurred in evolutionary history of Tettigoniinae, (iv) Both species have AT rich genome as in other orthopterans, and (v) the tRNA genes in Tettigoniinae exhibit some subfamily specific aspects such as the length and anti-codon of the genes and their overlapping or having non-coding bases with the adjacent genes, and (vi) similarly the length, the initial and stop codons of the genes and their overlapping or having non-coding bases with the adjacent genes in protein coding also exhibit subfamily specific patterns.
Benzer Tezler
- Anadolu yükselti zincirlerinin soğuk seven formların yayılış ve türleşmesindeki rolü: Psorodonotus brunner von wattenwyl 1861 cinsinin türleşme ve filocoğrafyası
Role of the anatolian altitudinal chains on distribution and speciation of the cold adapted lineages: Phylogeography and speciation of psorodonotus brunner von wattenwyl 1861
SARP KAYA
- Hakkari ilinde yayılış gösteren Tettigoniidae (Insecta, Orthoptera) familyasına ait türlerin morfolojik tür hipotezlerinin davranışsal verilerle sınanması
Testing the morphological species hypotheses of species belong the Tettigoniidae family (Insecta, Orthoptera) distributed in Hakkari province with behavioral data
CAHİT AVCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiHakkari ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET SAİT TAYLAN
- İzmir ilinde bulunan Tettigonidae ( Orthoptera ) familyası türleri üzerinde sistematik araştırmalar
Başlık çevirisi yok
EMRULLAH TAZEGÜL