Geri Dön

Investigation of cherry virus diseases in Niğde

Niğde ilinde kiraz virüs hastaliklarinin araştirilmasi

  1. Tez No: 514720
  2. Yazar: QURAT UL AIN SAJID
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİNUR ELÇİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Ziraat, Biology, Microbiology, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitkisel Üretim ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 88

Özet

Türkiye'nin en önemli sert çekirdekli meyve ağaçlarından biri olan kiraz (Prunus avium L.) Rosaceae ailesine aittir. Niğde ili 23.660 metrik tonluk kiraz üretimi ile önemli bir konuma sahiptir. Bu çalışmanın amacı, Niğde ili kiraz ağaçlarındaki olası virüslerin moleküler yöntemlerle araştırılmasıdır. Niğde'nin farklı bölgelerinden toplanan 90 örnek, Little cherry virus 1 (LChV1), Cherry necrotic rusty mottle virus (CNRMV), Apple mosaic virus (ApMV), Prune dwarf virus (PDV), Prune necrotic ring spot virus (PNRSV), Cherry green ring mottle virus (CGRMV), Cherry leaf roll virus (CLRV), Cherry mottle leaf virus (CMLV), Plum bark necrotic stem pitting associated virus (PBNSPaV), Cherry twisted leaf virus (CTLV), Apple stem grooving virus (ASGV), Little cherry virus 2 (LChV2), Cherry rusty leaf virus (CRLV), Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV), Apple stem pitting virus (ASPV) gibi farklı virüse spesifik primerler kullanılarak PCR aracılığıyla taranmıştır. PCR analizleri sonucunda LChV1 virüsü dışında herhangi bir enfeksiyona rastlanılmamıştır. LChV1' in genetik çeşitlilik analizi çalışmaları amacı için 4 farklı gen bölgesine özgü primerler kullanılmış ve tarama yapılmıştır. Fakat herhangi bir çoğalma gözlenememiştir. dsRNA analizleri sonucunda sadece bir örnekte şüpheli bir profil tespit edilmiş olup cDNA sentezi ve PCR analizleri sonucunda pozitif sonuç elde edilememiştir. Sonuçlarınteyidi amacı ile hassasiyeti daha yüksek olan TaqMan Real-Time PCR sistemi kurulmuş ve sadece bir örnekte LChV1'e karşı pozitif bir sonuç elde edilmiştir. Yapılan bu analizler sonucunda, taranan ağaçlarda düşük konsantrasyonda LChV1 tespit edilmiş olup genel itibari ile taranan diğer virüsler bakımından sağlıklı oldukları sonucuna varılmıştır.

Özet (Çeviri)

Cherry (Prunus avium L.) is one of the important stone fruit crops in Turkey belongs to familyRosaceae.Niğde is one of the important provinces in Turkeywith the production of 23.660 metric tons' cherries. The objective of this study is to determine the sanitary status of cherry plants grown in Niğde province.For this purpose, 90cherry plant samples collected from different parts of Niğde were screened against different viruses using their specific primers asLittle cherry virus 1(LChV1), Cherry necrotic rusty mottle virus(CNRMV), Apple mosaic virus(ApMV), Prune dwarf virus(PDV), Prune necrotic ring spot virus(PNRSV), Cherry green ring mottle virus(CGRMV), Cherry leaf roll virus(CLRV), Cherry mottle leaf virus(CMLV), Plum bark necrotic stem pitting associated virus(PBNSPaV),Cherry twisted leaf virus (CTLV), Apple stem grooving virus(ASGV), Little cherry virus 2 (LChV2), Cherry rusty leaf virus (CRLV), Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV), Apple stem pitting virus (ASPV). Based on the PCR analysis, no any amplification was observed, beside LChV1. To determine genetic diversity of LChV1 isolates, four different gene regions of LChV1 were screened and no any amplification was detected. dsRNA analysis revealed one suspicious profile and cDNA-PCR analysis using dsRNA as a template was also did not give any amplification. For the confirmation of those results, more sensitive TaqMan Real-Time PCR system was used and only one sample found to be positive to LChV1. It can be concluded that only low quantity of LChV1 infections were observed on some of the screened trees and none of them are infected by remained viruses which are used in this study.

Benzer Tezler

  1. Investigation of viral agents in walnut (Juglandis spp) trees byhigh throughput sequencing

    Ceviz (Juglans spp.) ağaçlarındaki viral etmenlerin yüksek kapasiteli dizleme ile incelenmesi

    BAHAR MAKBULE TEMELTÜRK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    ZiraatNiğde Ömer Halisdemir Üniversitesi

    Bitkisel Üretim ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÇİĞDEM ULUBAŞ SERÇE

  2. Ülkemiz kiraz üretim alanlarında görülen bazı virüs hastalıklarının araştırılması ve moleküler karakterizasyonu

    Investigation and molecular characterization of some virus diseases in cherry production areas in Turkey

    SİNEM ERDOĞAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    ZiraatAnkara Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİLİZ ERTUNÇ

  3. Hatay ili ceviz ve badem üretim alanlarında virüs hastalıklarının araştırılması

    Investigation of virus diseases in walnut and almond production areas in Hatay

    KISMET GÜRBÜZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    ZiraatHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLŞEN SERTKAYA

  4. İstanbul'un rekreasyon alanlarındaki bazı anıtsal ağaçlardaki virüs hastalıklarının saptanması ve virüslerin tanılanması üzerine araştırmalar

    Preliminary investigation on virus diseases of ornamental shade trees and the identification of their viruses in İstanbul

    YUSUF AKBİLEK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    ZiraatTekirdağ Namık Kemal Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAVVA İLBAĞI

  5. Aydın, Balıkesir ve İzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması, bulunma durumlarının belirlenmesi ve bazı meyve kalite özellikleri üzerine olan etkilerinin araştırılması

    The investigation on the detection of virus diseases in olive trees in Aydin, Balikesir and İzmir provinces, determination of their present status and effects on some fruit quality characteristics

    SERPİL ERİLMEZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    ZiraatEge Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMİH ERKAN