Geri Dön

Bioinformatic analysis of temperature-based activation of adipocytes

Sıcaklığa bağlı adipoz aktivasyonunun biyoinformatik analizi

  1. Tez No: 520330
  2. Yazar: HAMZA UMUT KARAKURT
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ PINAR PİR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Tıbbi Biyoloji, Biology, Biotechnology, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Obezite, Adipositler, Kahverengileşme, Transkriptomiks, Biyoinformatik, Ağ Modelleme, Obesity, Adipocytes, Browning, Transcriptomics, Bioinformatics, Network Modelli
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 127

Özet

Obezite; vücutta bulunan yağ miktarının belirli değerlerin üzerine çıkması olarak tanımlanan ve sağlık üzerinde olumsuz etkileri bulunan bir metabolik sendromdur. Obez hastaların sayısı, yanlış beslenme ve modern hayatın getirdiği hareketsizlik sonucunda üstel olarak artmaktadır. Obezite metabolik sağlığı olumsuz yönde etkilemekte, diyabet, kalp hastalıkları ve hatta kanser gibi hastalıklara sebep olmaktadır. Obeziteye bağlı olarak en fazla değişen doku olan adipoz dokusu, yağ depolayan beyaz adipositler ve daha az miktarda bulunan, yağ yakma ve ısı üretiminden sorumlu olan kahverengi adipositler gibi farklı türde hücreler içermektedir. Kahverengileşme süreci, beyaz adipositlere, kahverengi adiposit benzeri karakter kazandıran ve onları farklı bir adipoz doku hücresi olan bej adipozlara dönüştüren bir biyolojik prosestir. Beyaz adipositlere yağ yakma özelliklerinin kazandırılması, obezite için potansiyel bir terapötik kullanım alanıdır. Bu çalışmada, transkriptom ve epigenom verileri incelenmiş, bu veriler biyoinformatik analizlere ve ağ modelleme çalışmalarına tabi tutularak, kahverengileşme sürecinin moleküler yapısının daha iyi anlaşılması ve potansiyel ilaç hedeflerinin ortaya çıkarılması amaçlanmıştır. Verilerin istatistiksel analizi ve biyoinformatik araçlar kullanılarak analizi sonucunda bu kahverengileşme sürecinde potansiyel olarak önemli rol oynayan düzenleyiciler aydınlatılmıştır. Çalışmalar sonucunda, vitamin A ve D gibi kofaktörler ile, retinoik asit receptörleri, biyolojik saat sistemi bağlantılı proteinler gibi bazı potansiyel ilaç hedefleri bulunmuştur.

Özet (Çeviri)

Obesity is a syndrome defined by the increased amount of body fat. The number of obese patients increase exponentially due to malnutrition and physical inactivity caused by the modern day life. Obesity affects the metabolic health negatively and causes diseases such as diabetes, cardiovascular diseases and even cancer. Adipose tissue, the most significantly affected tissue in obesity, contains different types of cells such as white adipocytes which stores fat and brown adipocytes which are in short supply, burns fat and generate heat. The browning process is a biological process which makes white adipocytes gain brown-like characteristics and transform them into a distinct type of adipocytes called beige adipocytes. Providing fat burning characteristics to white adipocytes through browning is a potential treatment strategy for obesity. In this study, transcriptomics and epigenomics data were subjected to bioinformatics analysis and network modelling to understand the molecular mechanisms of the browning process and identify the potential drug targets to induce browning. Via statistical and bioinformatic analyses of high-throughput data, potentially important regulators in the browning process were identified. With this study, cofactors such as vitamin A and D, retinoic acid receptors and circadian clock-associated proteins were identified as potential drug targets.

Benzer Tezler

  1. Kabak bitkisinde ısı şoku proteini ve ısı şoku faktörü genlerinin biyoinformatik karakterizasyonu ve farklı abiyotik stres koşullarında ifade profilleri

    Bioinformatics characterization of heat shock protein and heat shock factor genes in zucchini and expression profiles in different abiotic stress conditions

    KEVSER BETÜL CEYLAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyoteknolojiKastamonu Üniversitesi

    Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET CENGİZ BALOĞLU

  2. Isı şoku protein genlerinin (HSP) bazı populus taksonlarında fonksiyonel genom analizi ve abiyotik stres koşullarında HSP genlerinin ifade seviyelerinin belirlenmesi

    Genome-wide survey of heat shock proteins (HSP) and expression analysis of HSP genes under abiotic stress conditions in some populus taxons

    ESRA NURTEN YER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    GenetikKastamonu Üniversitesi

    Orman Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEZGİN AYAN

    DOÇ. DR. MEHMET CENGİZ BALOĞLU

  3. İstanbul'daki ak dut (Morus alba l.) ve mavi atlas sediri [Cedrus atlantica (endl.) carr. cv. 'glauca'] polenlerinin alerjenik proteinleri

    Allergenic proteins of white mulberry (Morus alba l.) and blue atlas cedar [Cedrus atlantica (endl.) carr. cv. 'glauca'] pollens in Istanbul

    DEMİRHAN ÇETEREİSİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Allerji ve İmmünolojiİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NAZLI ARDA

    DOÇ. DR. ASLI GELİNCİK

  4. Development and structural determination of antiangiogenic recombinant antibody structures for cancer treatment

    Kanser tedavisine yönelik antianjiogenik rekombinant antikor yapılarının geliştirilmesi ve yapısal tayini

    MELİS DENİZCİ ÖNCÜ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Biyomühendislikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

    DR. AYLİN ÖZDEMİR BAHADIR

  5. Microbiota analysis in dishwashers by using the next generation sequencing

    Bulaşık makinalarındaki mikrobiotanın belirlenmesinde yeni nesil dna dizi analiz tekniğinin kullanılması

    DUYGU KAVADARLI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NEVİN GÜL-KARAGÜLER

    PROF. DR. MELEK TÜTER