Tuz stresi uygulanmış arpa bitkilerinde wrky transkripsiyon faktörlerinin ekspresyon analizi
Expression analysis of wrky transcription factors in barley under salt stress
- Tez No: 522525
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞE FEYZA TUFAN, DR. ÖĞR. ÜYESİ EMRE YÖRÜK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Haliç Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 69
Özet
Bu tez çalışmasında, Türkiye'de tarımı yapılan 15 arpa çeşidi (Hordeum vulgare L. cvs. Avcı 2002, Burakbey, Cervoise, Clarica, Epona, Escadre, Gazda, Karatay 94, Lord, Oliver, Premium, Ramata, Tarm 92, Tokak 157/37, Yesevi 93) farklı tuz konsantrasyonlarında (%0,5 ve %1,0) çimlendirildi ve çeşitlerin tuz stresine verdikleri erken yanıt fenotipik ve moleküler analizlerle incelendi. NCBI veritabanında arpada tanımlanmış olan 50 tane HvWRKY (2-61) transkripsiyon faktörü (TF) arasından literatür taraması ile daha önce tuz stresi ile ilişkisi tanımlanmamış olan aday TF'ler seçildi. Fenotipik analiz sonuçlarına göre, dayanıklı (Avcı 2002 ve Premium) ve hassas (Escadre) arpa çeşitleri seçildi ve çeşitlerin tuz stresine verdiği moleküler yanıt HvWRKY6, HvWRKY9, HvWRKY24, HvWRKY25, HvWRKY33, HvWRKY34, HvWRKY41, HvWRKY42 ve HvWRKY46 genlerinin ekspresyon analizleriyle karşılaştırmalı olarak incelendi. Gen ekspresyon analiz sonuçlarına göre, genel olarak HvWRKY genlerinin ekspresyon seviyelerinin tuz stresi ile birlikte anlamlı olarak indirgendiği gözlendi. Kontrol bitkilerine göre %1,0'lik NaCl stresi uygulanan bitkilerden Avcı 2002 çeşidinde HvWRKY6, HvWRKY9, HvWRKY24, HvWRKY34 ve HvWRKY42 genlerinin, Premium çeşidinde HvWRKY6, HvWRKY33, HvWRKY34 ve HvWRKY42 genlerinin, Escadre çeşidinde ise HvWRKY42 geninin ekspresyon seviyelerinin anlamlı olarak düştüğü tespit edildi.
Özet (Çeviri)
In this study, 15 barley varieties (Hordeum vulgare L. cvs. Avcı 2002, Burakbey, Cervoise, Clarica, Epona, Escadre, Gazda, Karatay 94, Lord, Oliver, Premium, Ramata, Tarm 92, Tokak 157/37, Yesevi 93), which are bred in Turkey were germinated under different salt stresses (0.5% and 1.0%) and the early response of varieties to salt stress was investigated by phenotypic and molecular analyses. The NCBI database contains 50 HvWRKY (2-61) transcription factors (TFs) that are defined in barley, and with literature survey, candidate TFs that were not previously studied in response to salt stress were chosen. According to the results of phenotypic analyses, tolerant (Avcı 2002 and Premium) and sensitive (Escadre) varieties were selected and their molecular response to salt stress were examined comparatively by the expression analyses of HvWRKY6, HvWRKY9, HvWRKY24, HvWRKY25, HvWRKY33, HvWRKY34, HvWRKY41, HvWRKY42 and HvWRKY46 genes. According to gene expression analyses results, it was generally observed that expression of HvWRKY genes were significantly reduced under salt stress. Expression levels of HvWRKY6, HvWRKY9, HvWRKY24, HvWRKY34 and HvWRKY42 genes in Avcı 2002; HvWRKY6, HvWRKY33, HvWRKY34 and HvWRKY42 genes in Premium; and HvWRKY42 gene in Escadre were significantly reduced in plants treated with 1.0% NaCl compared with control plants.
Benzer Tezler
- Tuz stresi etkisindeki arpa bitkilerinin gen anlatım profilleri
Gene expression profiles under salt stress in barley
CÜNEYT UÇARLI
Doktora
Türkçe
2016
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE FİLİZ GÜREL
- Buğday ve arpa da tuz ve bor toksisitesi toleransına nano-silisyumun etkisi
Effect of nano-silicon on the salt and boron toxicity tolerance on wheat and barley
GÖKSU GÖNÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatAnkara ÜniversitesiToprak Bilimi ve Bitki Besleme Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYDIN GÜNEŞ
- Triazol türevlerinin bazı arpa kültivarlarının tuz stresine karşı koruyucu etkisinin araştırılması
Investigation of protective effect of triazole derivatives to salt stress in some barley cultivars
AYŞEN DİLEK ÖZMEN
- Investigations on long non-coding RNAs in barley (Hordeum vulgare L.)
Arpa (Hordeum vulgare L.)'da uzun kodlama yapmayan RNA'lar üzerine çalışmalar
ELİF KARLIK
Doktora
İngilizce
2018
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NERMİN GÖZÜKIRMIZI
- Tuz stresi altında mikorizanın arpa ve mercimek gelişimi ile rizosfer enzim aktiviteleri üzerine etkisi
The effect of micorizan under salt stress on barley and lentil growth and rhizosphere enzyme activities
HALA AKSOY
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
MikrobiyolojiHarran ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÇİĞDEM KÜÇÜK