Coiled-coil domain containing 124 (CCDC-124) proteinine özgü monoklonal anti̇kor saflaştirilmasi, i̇mmün boyama ve bi̇yoki̇myasal metotlar i̇le anali̇zi̇
Coiled-coil domain containing 124 (CCDC-124) proteinine özgü monoklonal antikor saflaştırılması, immün boyama ve biyokimyasal metotlar i̇le analizi
- Tez No: 524851
- Danışmanlar: PROF. DR. UYGAR HALİS TAZEBAY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 63
Özet
CCDC-124 (Coiled-coil domain-containing 124) memeli hücrelerinde işlevi yeni açığa çıkmakta olan proteindir. Bu proteinin bazı hücre hatlarındaki hücre içi lokasyonu, hücre döngüsünün interfaz evresinde sentrozom; mitozun post-anafaz, telofaz ve sitokinez evrelerinde ise orta-cisimcik (midbody) olarak belirlenmiştir [1]. Geçmişte yapılan bilimsel çalışmalarda CCDC-124 proteini kodlayan genin susturulması durumunda hücreler üzerinde meydana gelen değişiklikler kısmi olarak araştırılmış ve bu durumun hücrelerin tam olarak bölünememesi ile sonuçlandığı ve çok çekirdekli hücrelerin meydana gelmesine neden olduğu ortaya konulmuştur [2]. CCDC-124 proteinin hücre içindeki işlevinin açığa çıkması amacıyla hibridoma teknolojisi kullanılarak CCDC-124 proteinine özgü hibridomalar üretilmiştir [3]. Yapılan bu tez çalışmasında ise özgüllüğü en yüksek olan 4B3 hibridoma klonu, affinite kromatografi tekniği kullanılarak monoklonal antikorlar saflaştırılmıştır.4B3 hibridoma klonundan saflaştırılan monoklonal antikorlar, His işaretli kolon ile saflaştırılan saf CCDC-124 proteini ve HeLa hücre hattından alınan lizatlarla ile birlikte Western Blotting ile analizi yapılmıştır. Yapılan bu analizde, kullanılan monoklonal antikorlar ile CCDC-124 proteininin 35 kDa ve 15 kDa civarında iki ayrı izoformu gözlemlenmiştir. CCDC-124'ün hücre içindeki lokalizasyonuna ilişkin yapılan immün boyama analizinde ise RPE PLK-1 GFP hücre hattında monoklonal antikorlar denenmiştir. Monoklonal antikor ile yapılan immün boyama çalışmalarında CCDC-124 proteinin, PLK-1 ile kolokalizasyonuna rastlanmış olup her ikisinin de sentrozomdaki lokasyonu görülmüştür.
Özet (Çeviri)
The exactly role of CCDC-124 (Coiled-coil domain containig 124) protein is poorly defined up to date. In some of the cell lines, it has been determined that during interphase, CCDC-124 is located inside the centrosome; while during mitosis, specifically post-anaphase, telophase, and cytokinesis, the protein is located at the midbody [1]. It has previously been shown that when the gene that encodes for the protein CCDC-124 is silenced, the cells failed to divide, which resulted in multinucleated cells [2]. In order to elucidate the precise role of CCDC-124 in the cells, hybridoma cells that are unique to CCDC-124 are generated [3]. In this study, the 4B3 monoclonal antibodies, which have very high specificity for CCDC-124 protein, obtained from the mice are purified via affinity chromatography. These purified 4B3 monoclonal antibodies along with purified CCDC-124 and the lysates obtained from the Hela cells, are used for western blotting. The western blotting results showed that the CCDC-124 protein was consist of two separated bands as 15kDa and 35kDa. Afterwards, in order to detect the cellular localization of CCDC-124 protein, the 4B3 monoclonal antibodies are used in RPE-PLK1 GFP cell lines by applying immunostaining technique. The immunostaining results demonstrated that the CCDC-124 protein is co-localized with polo-like kinase 1 (PLK-1), which verified the presence of CCDC-124 inside the centrosome.
Benzer Tezler
- Monoclonal antibody production for coiled-coil domain containing-124 CCDC-124 and its molecular characterization
CCDC-124 proteinine karşı mono-klonal antikor üretimi ve antikorun karakterizasyonu
İREM GÜRBÜZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2010
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. UYGAR H. TAZEBAY
- CRISPR\Cas9 yöntemi aracılığı ile insan CCDC 124 geni delesyonunun hücre bölünmesi üzerine etkileri
Effects of CRISPR\Cas9 mediated human CCDC124 gene deletion on cellular division
SİNEM GÜL
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
GenetikGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UYGAR HALİS TAZEBAY
- Characterization of the coiled-coil domain-containing protein 124 (CCDC124) as a novel centrosome and MIDBODY component involved in cytokinesis
Coiled-coiled domain-containing protein 124 (CCDC124)'ün sitokinezde rol oynayan yeni bir sentrozom ve orta-cisimcik (MIDBODY) proteini olarak tanimlanmasi
PELİN TELKOPARAN AKILLILAR
Doktora
İngilizce
2013
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK
DOÇ. DR. UYGAR HALİS TAZEBAY
- Cloning, expression and biochemical characterization of full size and truncated novel CCDC-124 protein in e. coli
E.coli'de tam boyutlu ve kesilmiş yeni CCDC-124 proteinin klonlaması, ekspresyonu ve biyokimyasal özellikleri
ASYAH ABBAS ABBOOD ABBOOD
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MÜNİR TUNÇER
- Coiled-coil domain containing protein 124 (Ccdc 124) artışının hücre fizyolojisine ve bölünmesine etkileri
Effects of coiled-coil domain contaning protein 124 (Ccdc 124) overexpression on cellular physiology and cell division
ÖZGE ARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. UYGAR HALİS TAZEBAY