Streptomyces coelicolor m145 ve streptomyces coelicolor A3(2)'nin δppk mutantlarının eldesi ve karakterizasyonlari
Construction and characterization of streptomyces coelicolor m145 and streptomyces coelicolor A3(2) δppk mutant strains
- Tez No: 524853
- Danışmanlar: PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Genetics, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 82
Özet
Enfeksiyon hastalıklarının ana kaynağı olan bakterilerin islahı konusunda karşılaşılan en büyük problem bakterilerin adaptasyon gösterip direnç kazandığı antibiyotiklerdir. Antibiyotik dirençliliğinin her geçen gün arttığı gerçeğine rağmen, antibiyotiklerin medikal önemi ve ticari değeri tartışılamaz. Günümüzde kullanılan antibiyotiklerin yaklaşık dörtte üçü Streptomycetes'ler tarafından üretilmektedir. Antibiyotik üretimi, genel olarak farklılaşma, besin kıtlığı ve/veya farklı bir organizmanın varlığı gibi koşullardan etkilenir. İnorganik fosfatların birbirine eklenmesi ile oluşan polifosfat (poliP) polimerinin de antibiyotik üretimine etkisinin olduğu sınırlı sayıda çalışma ile gösterilmiştir. Bu çalışma kapsamında, poliP sentezinden sorumlu ana gen olan ppk (polifosfat kinaz) Streptomyces coelicolor'un ikincil metabolit üretme kapasiteleri birbirinden farklı olan M145 ve A3(2) suşlarından silinmiş ve mutasyon PZR ve southern blot ile doğrulanmıştır. A3(2) Δppk mutantının yaban tipten yaklaşık 8.5 kat, M145 Δppk mutantının ise yaban tipten yaklaşık 2.6 kat daha fazla aktinorhodin ürettiği bulunmuştur. Suşların PHB biriktirme kapasitelerinde anlamlı bir fark bulunamamış ancak mutant hücrelerdeki TAG miktarının yaban suşlardan daha az olduğu gözlenmiştir. Mutant A3(2) suşunun R2YE'de sporlanması dikkat çekmiştir. Bu tez çalışmasında elde edilen mutant suşlar antibiyotik üretimi ve polifosfat metabolizması arasındaki ilişkiyi aydınlatmaya yönelik çalışmalarda kullanılacak olması bakımından değer taşımaktadır.
Özet (Çeviri)
The biggest problem in the treatment of bacteria that cause infection diseases is the antibiotic resistance that bacteria gain through adaptation. Despite the fact that antibiotic resistance increases day by day, the medical and commercial value of antibiotics cannot be discussed. About three-quarters of antibiotics that we use today are produced by Streptomycetes. Antibiotic production is generally affected by conditions such as differentiation, nutrient shortage and/or the presence of a different organism. A limited number of studies have shown that polyphosphate (polyP) polymer formed by the incorporation of inorganic phosphates also has an effect on antibiotic production. In this study, the main gene responsible for polyP synthesis, ppk (polyphosphate kinase), was deleted from Streptomyces coelicolor M145 and A3(2) strains, which are different from each other by their secondary metabolite producing capacities. Mutation was confirmed by PCR and southern blot. It was found that A3(2) Δppk mutant produced about 8.5 times more actinorhodin than the wild type, and M145 Δppk mutant produced about 2.6 times more actinorhodin than the wild type. There was no significant difference in PHB accumulation between strains, however the amount of TAG in mutant cells was less than the wild type strains. It has been noted that the mutant A3(2) strain is sporulated in R2YE. The mutant strains obtained in this thesis are valuable in the sense that they will be used in future studies to elucidate the relationship between antibiotic production and polyphosphate metabolism.
Benzer Tezler
- Lakkaz üreticisi Streptomyces türlerinin katı kültür performanslarının karşılaştırılması
Comparison of laccase producer Streptomyces spp. performances under solid state fermentation conditions
MUSTAFA DURAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
BiyomühendislikEge ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SAYIT SARGIN
- Streptomyces coelicolor'da lon proteaz, sınırlandırılmış cevap, polifosfat metabolizması ve antibiyotik üretiminin ilişkilendirilmesi
Relation between lon protease, stringent response, polyphosphate metabolism and antibiotic production in Streptomyces coelicolor
ASLI BAYRAKTAR KAVALCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
- Systems biology approach to investigate the effect of nitrogen and phosphate metabolism on actinorhodin production by streptomyces coelicolor using genome scale metabolic models
Streptomyces coelıcolor'da azot ve fosfat metabolizmasının aktinorhodin üretimine etkisinin genom-ölçekli metabolik modeller kullanılarak sistem biyolojisi uygulamaları ile incelenmesi
HAMZA UMUT KARAKURT
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
BiyokimyaGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
YRD. DOÇ. DR. TUNAHAN ÇAKIR
- Streptomyces coelicolor'daki metabolik değişiklikler üzerine bir araştırma
An investigation on metabolic changes in Sreptomyces coelicolor
RECEP LİMAN
- Optimization of 2,3-Butanediol production in Streptomyces coelicolor
Streptomyces coelıcolor'da 2,3-Butandiol üretiminin optimizasyonu
ADEM DEMİROĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK