Streptomyces coelicolor'daki metabolik değişiklikler üzerine bir araştırma
An investigation on metabolic changes in Sreptomyces coelicolor
- Tez No: 212969
- Danışmanlar: PROF.DR. H. MEHTAP KUTLU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Biyoloji, Biyoteknoloji, Microbiology, Biology, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Streptomyces, mutant, transpozon, glikozil transferaz, galaktoz oksidaz, Streptomyces, mutant, transposon, glycosyl transferase, galactose oxidase
- Yıl: 2007
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Anadolu Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Streptomisetler antibiyotikleri de içeren sekonder metabolitleri üretme yetenegine sahip olmalarıyla bilinen baslıca toprak bakterileridir. Bu grubun üyeleri aynı zamanda sporulasyon olarak bilinen düzenli bölünme islemi geçiren havasal hiflerin ereksiyonunu içeren çok kompleks morfolojik farklılıklar göstermektedirler. Streptomyces coelicolor Streptomiset genetik çalısmaları için model organizmadır ve genom dizisi belirlenmistir. SCO2836 ve SCO2837'nin açık okuma çerçeveleri Streptomyces coelicolor A3(2) genomunun temel hücresel fonksiyonlar için gerekli genleri içeren korunmus merkez çekirdek bölge içerisinde bulunmaktadır. SCO2836 ve SCO2837 genleri sırasıyla glikozil transferaz ve galaktoz oksidaz domaini içerdigi sanılan proteinleri kodlar. Bu çalısmada SCO2836 ve SCO2837 genleri in vitro olarak Tn5062 transpozonu ile mutasyona ugratıldı ve bu mutasyonların fenotipik etkileri farklı ortamlarda arastırıldı. Her iki mutantta da ortam kosullarına baglı olarak havasal gelismede gecikme gösterdi. Bu mutasyonlar Southern Blot ile dogrulandı. Ayrıca bu iki genin promotor bölgesinin oldugu kısım pRLux87 plazmitine aktarılarak farklı besiyerlerinde lusiferaz aktivitesine de bakıldı.
Özet (Çeviri)
Streptomyces are soil bacteria mainly known by their ability to produce secondary metabolites including antibiotics. The members of this genus also display a very complex morphological differentiation, involving the erection of aerial hyphae that undergo a coordinated septation process known as sporulation. Streptomyces coelicolor is a model organism for Streptomyces genetics studies and its genome sequence has been determined. The SCO2836 and SCO2837 open-reading frames are located within the conserved central core region of the Streptomyces coelicolor A3(2) genome, which contain genes required for essential cellular functions. The SCO2836 and SCO2837 genes encode for putative proteins containing glycosyl transferase and galactose oxidase domains, respectively. In this study, SCO2836 and SCO2837 were mutagenised in vitro by Tn5062 transposon and phenotypic effects of these mutations were investigated in different media. Both mutants showed delayed aerial development in a mediun-dependent manner. These mutations were confirmed by Southern Blot. Additionally, promoter region of these two genes was transferred to pRlux87 plasmid and looked at luciferase activity in different media.
Benzer Tezler
- Studies on testing polyphosphate deficient Streptomyces coelicolor as a host for homolog and heterologous expression of valuable products
Polifosfat yoksunu Streptomyces coelicolorun değerli ürünlerin homolog ve heterolog ifadeleri için konak olarak test edilmesi çalışmaları
BUSE ÇINAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
MikrobiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
- Streptomyces coelicolor'da olası poli-ß-hidroksibutirat sentaz geni (phaC) ve antibiyotik biyosentezi arasındaki ilişki
Relation between putative poly-ß- hdroxybutyrate synthase gene (phaC) and antibiotic biosynthesis in streptomyces coelicolor
ZEYNEP DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
BiyoteknolojiGebze Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
- Systems biology approach to investigate the effect of nitrogen and phosphate metabolism on actinorhodin production by streptomyces coelicolor using genome scale metabolic models
Streptomyces coelıcolor'da azot ve fosfat metabolizmasının aktinorhodin üretimine etkisinin genom-ölçekli metabolik modeller kullanılarak sistem biyolojisi uygulamaları ile incelenmesi
HAMZA UMUT KARAKURT
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
BiyoteknolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
YRD. DOÇ. DR. TUNAHAN ÇAKIR
- Streptomyces coelicolor m145 ve streptomyces coelicolor A3(2)'nin δppk mutantlarının eldesi ve karakterizasyonlari
Construction and characterization of streptomyces coelicolor m145 and streptomyces coelicolor A3(2) δppk mutant strains
ĞARİP DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
GenetikGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
- Streptomyces coelicolor A3(2)'de Lon proteazın ikincil metabolit üretimine etkisi
Effect of Lon protease on secondary metabolite production in streptomyces coelicolor A3(2)
ZEYNEP DEMİR ÖKSÜZ
Doktora
Türkçe
2019
BiyoteknolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK