Streptomyces coelicolor'da olası poli-ß-hidroksibutirat sentaz geni (phaC) ve antibiyotik biyosentezi arasındaki ilişki
Relation between putative poly-ß- hdroxybutyrate synthase gene (phaC) and antibiotic biosynthesis in streptomyces coelicolor
- Tez No: 315075
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Biology, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 72
Özet
Poli-ß-hidroksibutirik asit (PHB) bakteri hücrelerinde granüller halinde depolanan, geri dönüşümlü, suda çözünmeyen, toksik etki göstermeyen, biyouyumlu ve termoplastik özellik gösteren bir polyesterdir. Endüstriyel önemi dışında PHB, hücre içinde önemli bir karbon ve enerji kaynağı olarak da görev yapar. Hücre zarlarına yapısal destek veren PHB, aynı zamanda sinyal iletiminde de önemli roller oynar.Literatürde, PHB'nin antibiyotik üretiminde karbon kaynağı olarak görev yapabileceğini öne süren çalışmalar bulunmaktadır. Bugüne kadar bilgimiz dahilinde PHB üretemeyen mutant suşlarda antibiyotik ölçümü gerçekleştirilmediğinden, bu polimerin antibiyotik biyosentezi için sağladığı düşünülen karbonun önemli olup olmadığı bilinmemektedir. Bu konuya açıklık getirilmesi amacıyla, bu çalışmada, S. coelicolor'ın PHB sentezinden sorumlu PHA sentaz enzimini kodladığı düşünülen olası phaC geni `PCR temelli' bir metod kullanılarak kromozomdan silinmiş ve PHB üretemeyen mutant suşta antibiyotik üretimi (aktinorhodin, undesilprodigiosin) ölçülmüştür. Çalışmadan elde edilen sonuçlar, PHB'den sağlanan karbonun antibiyotik üretimi için oldukça önemli olduğunu göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Poly-ß-hydroxybutyrate (PHB), which is stored as granules inside bacterial cells, is a biodegradable, water insoluble, non-toxic, biocompatible and termoplastic polyester. Other than industrial importance, PHB has an important role as carbon and energy source inside the cell. PHB not only support cell membrane structures but also has important roles in signal transduction.In the literature, there are studies showing that PHB can function as carbon source for the production of antibiotics. According to our information no antibiotic measurement is carried out in PHB deficient mutant strains, so it is not known how important is the carbon source supplied from PHB for antibiotic biosynthesis. In order to clarify this point, a `PCR-based? method was used to delete the putative phaC gene, encoding PHA synthase responsible for PHB biosynthesis, of Streptomyces coelicolor and antibiotic production by the mutant strain deficient in PHB production was measured. The results of this study show that carbon source supplied from PBH is rather important for antibiotic production.
Benzer Tezler
- Streptomyces coelicolor A3(2)'de Lon proteazın ikincil metabolit üretimine etkisi
Effect of Lon protease on secondary metabolite production in streptomyces coelicolor A3(2)
ZEYNEP DEMİR ÖKSÜZ
Doktora
Türkçe
2019
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
- Studies on testing polyphosphate deficient Streptomyces coelicolor as a host for homolog and heterologous expression of valuable products
Polifosfat yoksunu Streptomyces coelicolorun değerli ürünlerin homolog ve heterolog ifadeleri için konak olarak test edilmesi çalışmaları
BUSE ÇINAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
- Lon proteaz geninin çoklu kopyalarının streptomyces coelıcolor A3(2)'de homolog ifadesi ve Esherichia coli 'de heterolog ifadesi üzerine çalışmalar
Studies on expression of multiple copies of lon protease gene homologously in streptomyces coelicolor A3(2) and heterologously in Esherichia coli
HALİL YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
DR. ÖĞR. ÜYESİ TUĞRUL DORUK
- Systems biology approach to investigate the effect of nitrogen and phosphate metabolism on actinorhodin production by streptomyces coelicolor using genome scale metabolic models
Streptomyces coelıcolor'da azot ve fosfat metabolizmasının aktinorhodin üretimine etkisinin genom-ölçekli metabolik modeller kullanılarak sistem biyolojisi uygulamaları ile incelenmesi
HAMZA UMUT KARAKURT
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
BiyokimyaGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
YRD. DOÇ. DR. TUNAHAN ÇAKIR
- Optimization of 2,3-Butanediol production in Streptomyces coelicolor
Streptomyces coelıcolor'da 2,3-Butandiol üretiminin optimizasyonu
ADEM DEMİROĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK