Global phylogeographic comparisons and dietaryanalyses of gray wolf and red fox from Sarıkamış andYenice in Turkey using genetics and genomics approaches
Genetik ve genomik yaklaşımlar kullanılarak Sarıkamış ve Yenice / Türkiye'deki Gri Kurt ve Kızıl Tilki'nin global filogenetik karşılaştırmaları ve diyet analizleri
- Tez No: 527918
- Danışmanlar: DOÇ. DR. İBRAHİM RAŞİT BİLGİN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Çevre Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Çevre Bilimleri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 88
Özet
GENETİK VE GENOMİK YAKLAŞIMLAR KULLANILARAK SARIKAMIŞ VE YENİCE / TÜRKİYE'DEKİ GRİ KURT VE KIZIL TİLKİ'NİN GLOBAL FİLOGENETİK KARŞILAŞTIRMALARI VE DİYET ANALİZLERİ Bu çalışmada, Türkiye'nin iki bölgesinden (Sarıkamış ve Yenice) Türk gri kurdu (Canis lupus) ile kızıl tilkinin (Vulpes vulpes) genetik çeşitliliği ve filocoğrafik ilişkileri mitokondriyal DNA (mtDNA) D-loop dizileri temel alınarak değerlendirilmiştir. Bununla yanında, bu iki türün diyet profili sonraki nesil dizileme temelli bir DNA metabarkodlama tekniği kullanılarak incelenmiştir. Gri kurt sonuçlarımız Kars-Kafkasya ve Kars-Karabük örneklerinin genetik olarak birbirine benzediğini göstermiştir. Kars bölgesindeki kızıl tilki örneklerinin haplotip ve nükleotit çeşitlilikleri düşük bulunmuştur. Ayrıca haplotip ağında ve filogenetik ağaçlarda haplotiplerin global dağılımları tespit edilmiş ve Kars/Türkiye'ye ait haplotiplerin fazla yerel yapılanma olmuşturmadığı ve bu global haplotiplerle gruplar oluşturduğu gözlenmiştir. Gri kurtların beslenme alışkanlıklarının aşağıdaki kategorilerde olduğu görülmüştür: memeliler (kızıl geyik), amfibi (kurbağalar), kuşlar (Passeriformes ve Passeriformes olmayanlar) ve bitkiler (buğday, gül ailesi, düğün çiçegi, kayın ağacı ailesi, Poaceae ailesi). Kızıl tilkilerin diyet kompozisyonu ise şu şekildedir: kuşlar (Passeriformes) ve bitkiler (buğday ve gül ailesi). Kızıl tilkiye ait omurgalı ve bitki besin içeriği sonuçlarımız literatür ile uyumlu bulunmuştur. Buna ek olarak, kurbağanın gri kurtlar için bir av maddesi oluşu, Sarıkamış ve Yenice Ormanları'nda yeterli besin kaynaklarının azlığı anlamına gelebilecek, optimal olmayabilecek bir beslenme davranışının kanıtıdır.
Özet (Çeviri)
GLOBAL PHYLOGEOGRAPHIC COMPARISONS AND DIETARY ANALYSES OF GRAY WOLF AND RED FOX FROM SARIKAMIŞ AND YENİCE IN TURKEY USING GENETICS AND GENOMICS APPROACHES In this study, the genetic diversity of Turkish gray wolf (Canis lupus) and red fox (Vulpes vulpes) from two locations in Turkey (Sarıkamış and Yenice), and their phylogeographic relationships with the rest of the world were evaluated based on D-loop sequences of mitochondrial DNA (mtDNA). In addition, the dietary profile of those two species was examined using an NGS-based DNA metabarcoding approach. Our gray wolf results showed that Kars-Caucasus and Kars-Karabük samples were genetically similar to each other. For red fox samples, haplotype and nucleotide diversities in Kars were found to be low. In addition, global distributions of haplotypes were detected in the haplotype network and phylogenetic trees, and the haplotypes from Kars/Turkey formed groups with these global haplotypes, without much local structuring. The results of dietary habits for gray wolves showed the following categories: mammals (red deer), amphibia (frogs), the family Aves (Passeriformes and non-Passeriformes), and plants (wheat, rose family, buttercup, beech family, the family Poaceae). On the other hand, the diet composition of red foxes included the family Aves (Passeriformes) and plants (wheat and rose family). Our results of the vertebrate and plant dietary content for the gray wolf and red fox are in concordance with the literature. In addition, the evidence of frog as prey item for gray wolves is evidence of sub-optimal feeding behaviour, potentially suggesting the scarcity of adequate food resources in Sarıkamış and Yenice Forests.
Benzer Tezler
- Global phylogeographic comparisons and dietary analyses of gray wolf and red fox from Sarıkamış and Yenice in Turkey using genetics and genomics approaches
Genetik ve genomik yaklaşımlar kullanılarak Sarıkamış ve Yenice / Türkiye'deki Gri Kurt ve Kızıl Tilki'nin global filogenetik karşılaştırmaları ve diyet analizleri
İLKAY CİVELEK
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiÇevre Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM RAŞİT BİLGİN
- DNA barcoding of seven hermit crab species(Crustacea:Decapoda) from Turkey with phylogeographic comparisons
Türkiye denizlerinde bulunan yedi keşiş yengeci (Crustacea:Decapoda) türünün genetik kataloğunun oluşturulması ve filocoğrafik karşılaştırması
SELEN ÖZSİNAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2011
Çevre MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiÇevre Bilimleri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. RAŞİT BİLGİN
- Cataloging the genetic diversity of birds in Kars Igdir region with global comparisons
Kars Iğdır bölgesindeki kuşların genetik kataloglanması
NADİN EBEOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2011
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiÇevre Bilimleri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. RAŞİT BİLGİN
- Dominant viruses and mitochondrial genome of Cladocora caespitosa
Cladocora caespitosa'nın baskın vı̇rüslerı̇ ve mı̇tokondrı̇yal genomu
İDİL ÇAĞLA ERTAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiÇevre Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM RAŞİT BİLGİN
- Poecilimon birandi (Orthoptera, Phaneropterinae) alçak ve yüksek rakım populasyonları: Ekolojik ve temporal farklılaşmanın fenotipik ve genetik verilerle incelenmesi
Lowland and highland populations of Poecilimon birandi (Orthoptera, Phanoropterinae): Investigating of ecological and temporal differentiations using genetic and phenotypic data
SARP KAYA