Geri Dön

HIV ve Kaposi Sarkoma hastalığında mikroarray ile SNP (tek nükleotid polimorfizmi) analizi

SNP (single nucleotide polymorphism) analises with microarray in hiv and Kaposi's Sarcoma patient

  1. Tez No: 528645
  2. Yazar: EMRAH ÖZCAN
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ İSMAİL KOYUNCU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Harran Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 69

Özet

Bu çalışma HIV virüslü olup Kaposi Sarkoma (HIV+) hastalığını taşıyan ve HIV virüslü olup Kaposi Sarkoma hastalığını taşımayan bireyler arasındaki SNP farklılıklarını belirlemek amacıyla 2017 yılında laboratuvar koşullarında gerçekleşmiştir. Harran Üniversitesi Araştırma ve Uygulama Hastanesi Enfeksiyon polinikliğinde teşhisi konulan bireylerden alınan kan örnekleriyle çalışma gerçekleştirilmiştir. Hastalardan ve kontrol bireyinden alınan kan örneklerinden DNA izolasyonu yapılmış ve bu DNA'lardan mikroarray sistemiyle SNP analizi gerçekleştirilmiştir. Yaptığımız çalışma sonucunda 204 000 tane SNP taranmış ve bunlardan 32.362 tane SNP'in Kontrol [KS (-) ve HIV (-)] ve HIV+ [KS(-)] grupta aynı allel olduğu fakat Kaposi Sarkoma [KS(+) ve HIV(+)] hastasında farklı allel olduğu görülmüştür. Farklılık olan bu SNP'lerden 16 tanesinin daha önce yapılan çalışmalarla Kaposi Sarkoma [KS(+) ve HIV(+)] ile bağlantılı bulunan genler içerisinde yer aldığını belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

This study was conducted in laboratory conditions in 2017 to determine the SNP differences between HIV-infected individuals carrying Kaposi's Sarcoma (HIV +) disease and HIV-infected individuals who did not have Kaposi's sarcoma disease. This study was carried out with blood samples taken from individuals diagnosed at the Harran University Research and Practice Hospital Infection Clinic. DNA was isolated from blood samples taken from patients and control individual, and SNP analysis was carried out using microarray system from these DNAs. As a result of our work 204 000 SNP screened, and 32 362 of these units SNPs controls [KS (-) and HIV (-)] and HIV+ [KS (-)] are the same allele group but Kaposi's Sarcoma [KS(+) and HIV(+)] was found to be different alleles in the patient. We determined that 16 of these SNPs with differences were included in the genes associated with Kaposi's sarcoma [KS(+) and HIV(+)] in previous studies.

Benzer Tezler

  1. Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi'ne başvuran kan donörlerinde ve HIV (+) hastalarda human herpes virus 8 seroprevalansının araştırılması

    Investigation of Human Herpesvirus-8 Seroprevalence in Blood Donors and HIV-Positive Patients Admitted to Ege University Medical School Hospital, Turkey

    AYFER YOLCU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İMRE ALTUĞLU

  2. Kaposi sarkomu'nun deri lezyonlarında dermatoskopik bulgular ve dermatopatolojik korelasyonları

    Dermatoscopic findings of kaposi's sarcoma and dermatopathological correlations

    TUĞÇE ERTÜRK YILMAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    DermatolojiAnkara Üniversitesi

    Deri ve Zührevi Hast. Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BENGÜ NİSA AKAY

    PROF. DR. AYLİN HEPER

  3. HIV enfeksiyonlu hastalarda gelişen dermatolojik tutulumların irdelenmesi

    HIV enfeksiyonlu hastalarda gelişen dermatolojik tutulumların irdelenmesi

    KHALIS MUSTAFAYEV

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BİLGÜL METE

  4. HIV-1 pozitif hastalarda HHV-8 araştırılması ve test sonuçlarının karşılaştırılması

    Investigation of HHV-8 in HİV-1 positive patients and comparison of the test results

    BAHAR KARLI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ AĞAÇFİDAN

  5. Kaposi sarkomlarında konvansiyonel endotel belirleyicileri ve prox, FLI-1 ve D2-40'ın farklı evrelerdeki ifadesinin araştırılması

    Investigation of conventional endothelial determinants and prox, FLI-1 and D2-40 expression in different evaluations in kaposi sarcoma

    FIRAT TATLIDİL

    Tıpta Uzmanlık

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    PatolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SEDA GÜN